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濟南scRNA單細胞服務機構

來源: 發布時間:2022-07-16

作為單細胞測序的又一個重要里程碑,BD Rhapsody單細胞捕獲平臺整合了儀器、試劑盒和基礎信息學軟件,能精確對接illumina測序儀,因此可實現大量大細胞的快速高效標記、測序和分析,獲得單細胞水平的基因表達譜和差異情況,并通過對復雜細胞群體進行深入細致分析,繪制大規模單細胞表達圖譜。 以量化細胞內的群體異質性,并逐個鑒定細胞類型、細胞狀態和動態細胞躍遷。除了有望鑒定新的細胞亞型和稀有細胞群體,單細胞技術還能更好地了解轉錄動態和基因調控關系。對于消化背景雜,樣本初始數量少,關注粒細胞的項目,推薦您使用烈冰BD 單細胞測序平臺。濟南scRNA單細胞服務機構

您的珍貴樣本,可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細胞捕獲系統,基于BD平臺從原理到效率到通量的多重包容性,使得BD平臺對實驗過程存在的批次效應產生的可能性更小,可在技術、生物學、實驗中心和用戶之間的樣本檢測獲得一致、可靠的結果,而磁珠的拆分使用和即時存儲,可增加實驗設計的靈活性,配套的BD Scanner可視化工作流程質控,從細胞鋪板前微孔板空板檢測,到細胞上樣、磁珠上樣、磁珠洗滌掃描、細胞裂解、磁珠回收、回收磁珠掃描等全過程,均實現BD Scanner的可視化質控,讓您的每個樣本在實驗端全程無憂。scRNA單細胞數據分析深度的單細胞測序數據解讀助力醫療健康大時代。

樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉錄組的變化,在對細胞進行清洗和計數后,單細胞懸液應當保存于冰上,直至用于后續的上機和文庫制備步驟。在理想狀況下,一旦制備好樣本,應當在3min鐘內將其用于下游步驟。然而,您還有必要了解各類細胞的不同性質,因為這可能會影響細胞應在冰上保存的時間,以及它們在制備后多久便應當被盡快使用。例如,有些細胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時間,它們就開始形成團塊。這些團塊很難解離,增加了堵塞的風險,而且每個團塊被當成單細胞計數,又降低了細胞計數的準確性。此外,有些細胞更加粘稠,形成團塊的速度更快。對于這些細胞,必須盡量減少制備和使用之間的時間差。

烈冰生信團隊傾情研發的NovelBrain?生信大數據分析平臺,針對龐大的單細胞測序數據,能夠實現細胞類型鑒定的快、精、準:一鍵導入gene list構建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調節寬、高和系數比例來調節美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現分析工具和模板的快速調用和一站式全流程自動化分析,節省工作時間并提升整體工作效率。烈冰一站式單細胞測序服務:立足科學研究,解碼生命本質。

單細胞獲得困難,不同組織要求不盡相同難以搞定? 烈冰2000+項目消化經驗,100+組織類型解離protocol,精心設計不同組織實驗的解離、細胞懸浮實驗體系,確保單細胞的獲得。 凍存樣本無法實驗,珍貴樣本無法使用? 烈冰采用國際認可的凍存組織復蘇技術以及死細胞過濾技術,確保凍存組織使用。 珍貴樣本,細胞數量太少,消化背景雜無法做單細胞? 采用國際認可的10X Genomics,BD Rhapsody雙平臺模式,根據樣本實際情況和用戶需求提供客觀有效的實驗方案,細胞量少,背景雜也能做單細胞。 單細胞RNA分類精度不足,部分細胞無法細分? 烈冰同時采用單細胞蛋白質組與單細胞轉錄組測序技術,真正做到從上游到下游的全流程檢測,確保超高的細胞分類精度。烈冰科技已建立了多種國際和國內主流的高通量測序實驗平臺和自主研發國產化實驗平臺。南京BD單細胞平臺

BD Rhapsody平臺在細胞捕獲過程中沒有偏好性,可同樣無差別捕獲中性粒細胞。濟南scRNA單細胞服務機構

根據烈冰多年單細胞測序服務經驗,為什么不建議您一味的追求高細胞數量的捕獲:單細胞測序所有的分析都是基于細胞聚類進行,而細胞聚類是在區分cell和non-cell后,獲得細胞基因表達譜,通過降維(pca),無監督聚類以及可視化(t-SNE)得到的。進行細胞聚類時需要考慮到每個細胞的基因表達模式,因此即使是相同的數據,在剔除幾個細胞的情況下,前后獲得的聚類圖也會出現明顯不同。而當細胞捕獲數過多時,無論是假陰性和假陽性數據還是多細胞數據,都會對正常細胞聚類產生影響,造成聚類結果失真。這也是很多文章,特別是很多高分文章,為什么單個樣本捕獲細胞數在2000-3000的原因了。烈冰建議單個樣本捕獲細胞數在3000-5000個時,數據量在100G左右時,可以滿足分析和文章發表的多重需求。濟南scRNA單細胞服務機構

上海烈冰生物醫藥科技有限公司是一家生物科技、醫藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發、技術服務、技術轉讓、技術咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調查(不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗),從事貨物及技術的進出口業務,計算機、軟件及耗材(除專控),軟件開發【依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動】的公司,致力于發展為創新務實、誠實可信的企業。公司自創立以來,投身于單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序,是醫藥健康的主力軍。烈冰生物不斷開拓創新,追求出色,以技術為先導,以產品為平臺,以應用為重點,以服務為保證,不斷為客戶創造更高價值,提供更優服務。烈冰生物始終關注醫藥健康行業。滿足市場需求,提高產品價值,是我們前行的力量。

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