烈冰生物BD Rhapsody平臺,采用精簡的工作流程助力您的實驗成功: 1.制備單細胞懸液:可使用碧迪醫療單細胞多樣本分析試劑盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶聯抗體( Ab-Oligos)將細胞染色 2.微孔板預充和處理:使用自動移液器進行液體交換 3.單細胞捕獲工作流程: (1)細胞上樣:上樣 575微升細胞懸液;系統未采用微流體通道設計,無需擔心通道堵寨;通過重力輕輕沉淀細胞,可捕獲脆弱細胞,BD Rhapsody微孔板包含大于220,000個分區,可在低雙細胞率下捕獲多達40000個細胞 (2)細胞上樣掃描:估算捕獲的活細胞數量和細胞多態率 (3)磁珠上樣:微孔的正六邊形幾何形狀和尺寸可防止磁珠多重分配在微孔中 (4)磁珠上樣和磁珠洗滌掃描:估算包含活細胞和磁珠的微孔數量;測定細胞存留率,評估是否發生細胞損失 (5)細胞裂解:使用裂解緩沖液,確保細胞完全裂解 (6)磁珠回收:輕松、高效地磁性回收磁珠并采用Scanner掃描磁珠回收情況深度的單細胞測序數據解讀助力醫療健康大時代。北京BD VDJ單細胞平臺
由于高通量測序實驗方法相關的測序成本,使得單細胞實驗往往非常昂貴,烈冰生物BD Rhapsody單細胞測序服務珍視您的每一份樣本,在平臺搭建前,我們測試評估了BD Rhapsody的性能,與BD官方公布的數據結合來看,將人293T和小鼠NIH/3T3細胞的1:1混合物以不同濃度上樣到BD Rhapsody卡式芯片上。存儲的cDNA分子普遍擴增并進行低通量測序(每個細胞月8700個讀數)。在測序數據中檢測到1109個細胞的上樣條件下,每個細胞中,來自每個細胞的平均99.4%的分子經檢測為人或小鼠,這表明微孔之間的串擾非常小,在測序數據中檢測到1000個或更少細胞的上樣密度下,多重態發生率接近零,并且在15000個細胞下小于5%。廣東BD VDJ單細胞多組學測序十二年測序經驗,烈冰生物單細胞多組學領域的佼佼者。
現有的單細胞測序技術陣營在幾個主要領域存在差別。一個是基于微流控通道的細胞與Beads的在通道內的動態結合,通過油相水相不相容的特點將結合了的細胞和Beads進行分隔,在這個空間,單個細胞的內容物釋放,轉錄本或其他生物分析物被標記或添加索引,以便下游識別。BD Rhapsody單細胞測序平臺采用靜態微孔技術(Cyto-Seq具有類似的技術原理)。通過微孔板的物理分隔,將一個個單個細胞和帶有標簽的磁珠,一對一的“框”在微反應的物理平臺中。這樣,每一個細胞都會結合一個磁珠,那么在每一個磁珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,這個抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構建文庫。
樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉錄組的變化,在對細胞進行清洗和計數后,單細胞懸液應當保存于冰上,直至用于后續的上機和文庫制備步驟。在理想狀況下,一旦制備好樣本,應當在3min鐘內將其用于下游步驟。然而,您還有必要了解各類細胞的不同性質,因為這可能會影響細胞應在冰上保存的時間,以及它們在制備后多久便應當被盡快使用。例如,有些細胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時間,它們就開始形成團塊。這些團塊很難解離,增加了堵塞的風險,而且每個團塊被當成單細胞計數,又降低了細胞計數的準確性。此外,有些細胞更加粘稠,形成團塊的速度更快。對于這些細胞,必須盡量減少制備和使用之間的時間差。單細胞多組學測序可識別重要的轉錄因子,進行譜系和發育追蹤。
據不完全統計,截至2022年6月,烈冰生物助力發表單細胞文章近40篇,從平臺應用比例來看,應用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺發文比例各占50%左右,研究類型涵蓋疾病發展,靶點探索,免疫研究,神經發育,干細胞分化,植物發育,退行病變,糖尿病,COVID-19等等研究;從發表期刊水平來看,烈冰生物聯合發表的單細胞文章,CNS一區期刊占比在30%以上,其中包括immunity三篇,Nature子刊3篇(Nature cell biology,Nature Plants,Nature communication),風濕類領域ARD期刊1篇,CUT 1篇,Advanced Science多篇,IF大于10分以上文章占比高達68.5%,烈冰專屬單細胞測序服務團隊,將與您攜手譜寫下一篇“高分”新文章。2019年,烈冰已助力發表了采用BD Rahpsody平臺的單細胞風濕類文章。廣東BD VDJ單細胞多組學測序
烈冰對于一個細胞群體中的每個細胞單獨進行建庫測序分析。北京BD VDJ單細胞平臺
烈冰生物為您的實驗定制工作流程: 對于不同用戶和實驗,單細胞實驗工作流程往往需要不同程度的樣本操作、質量和通量。BD儀器選項可以根據具體需求進行配置。烈冰生物搭建BD FACS流式分選平臺(如 BD FACSMelody),是上游樣本富集的良好選擇。此外,我們具備BD Rhapsody單細胞成像儀提供自動化細胞計數和細胞樣本活性測試,幫助用戶制備適用于Cartridge微孔板單細胞捕獲濃度的樣本。掃描儀提供了微孔板上磁珠捕獲細胞的計數。BD Rhapsody 樣品上樣工作站輕巧便攜,可在實驗室內輕松移動。搭配烈冰傾情研發多年的成果NovelBrain生物信息大數據分析系統,完成測序數據的生物信息分析和結果可視化呈現。這些工具包括 UMI 分析算法和可視化工具,即使沒有經驗的用戶也可分析和理解單細胞數據。北京BD VDJ單細胞平臺
上海烈冰生物醫藥科技有限公司總部位于江月路999號奇亞特中心22幢,是一家生物科技、醫藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發、技術服務、技術轉讓、技術咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調查(不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗),從事貨物及技術的進出口業務,計算機、軟件及耗材(除專控),軟件開發【依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動】的公司。烈冰生物作為生物科技、醫藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發、技術服務、技術轉讓、技術咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調查(不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗),從事貨物及技術的進出口業務,計算機、軟件及耗材(除專控),軟件開發【依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動】的企業之一,為客戶提供良好的單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序。烈冰生物不斷開拓創新,追求出色,以技術為先導,以產品為平臺,以應用為重點,以服務為保證,不斷為客戶創造更高價值,提供更優服務。烈冰生物創始人陳岱,始終關注客戶,創新科技,竭誠為客戶提供良好的服務。