基于測序的數據能夠將彰顯其強大之處,因為它能夠了解同一單細胞的多種生物分析指標。如果說單細胞基因表達提供了一種顏色的詳細信息,那么單細胞多組學提供了同一細節的全彩色圖譜,為您帶來樣本的真實視圖。烈冰自2019年引進的BD Rhapsody單細胞平臺以來,能夠從同一單細胞中讀取細胞復雜性的多組學特征。與傳統方法不同,單細胞多組學簡化了您需要開展的實驗,也節省了您需要分析的樣本,而能獲得相同的結果。這不但節省了寶貴的樣本,還保證了更高的生物學準確性,因為您不需要匹配拆分樣本的數據集并通過計算來推斷各個組學之間的關系。烈冰一站式單細胞測序服務:立足科學研究,解碼生命本質。上海BD Rhapsody單細胞測序服務
相對于Smart-Seq技術在細胞數量上的問題,BD平臺普遍提供的細胞數量都在1000-10000不等的測序細胞量,特殊研究需求的項目,可提供上限40000個細胞的捕獲量(單個樣本)。這個量級的測序細胞量已經可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此,對于基于基因表達進行準確細胞分型上,無論是從細胞數量上來說還是表達檢測可靠性來說,都會更實用。此外針對特殊項目研究,如需要捕獲和分析脆弱的細胞,如粒細胞、中性粒細胞、CAR-T細胞、干細胞、移植瘤細胞、骨髓瘤細胞等,烈冰生BD平臺也有更好的捕獲效能,滿足您的實際需求。濟南scRNA單細胞測序服務公司深度的單細胞測序數據解讀助力醫療健康大時代。
針對單細胞測序的細胞上樣數,為什么不建議捕獲到的細胞數量越高越好?一味地追求高數量的細胞捕獲可能會存在一些問題。例如在上機細胞懸液濃度固定時,如果目標細胞捕獲數增加到8000甚至10000,上樣細胞懸液體積勢必增加,在細胞懸液質量不是很理想(細胞活性<90%、碎片率>5%、結團率均>5%)的情況下,引入的背景信號會增加,分析結果不理想的直接體現包括:cell、non-cell無法有效區分和Fraction reads in cells偏低。當cell和non-cell無法有效區分時,會使得數據出現假陽性和假陰性結果!當目標細胞捕獲數很大時,多細胞率會增加,數據分析時,此部分“cell”表現為基因檢測數和UMI檢測數是正常cell的N倍(N是一個GEM包裹的細胞數),導致所有細胞的統計數據(單個細胞基因檢測中位數、單個細胞UMI檢測中位數)虛高。此部分“cell”雖然可以通過設置數據分析閾值進行過濾,但是容易會有此類數據的殘留和正常高基因檢測細胞的人為去除!
作為單細胞測序的又一個重要里程碑,BD Rhapsody單細胞捕獲平臺整合了儀器、試劑盒和基礎信息學軟件,能精確對接illumina測序儀,因此可實現大量大細胞的快速高效標記、測序和分析,獲得單細胞水平的基因表達譜和差異情況,并通過對復雜細胞群體進行深入細致分析,繪制大規模單細胞表達圖譜。 以量化細胞內的群體異質性,并逐個鑒定細胞類型、細胞狀態和動態細胞躍遷。除了有望鑒定新的細胞亞型和稀有細胞群體,單細胞技術還能更好地了解轉錄動態和基因調控關系。單細胞測序技術遍地開花,烈冰BD 單細胞測序服務讓您的醫學研究如虎添翼。
關于BD Rhapsody單細胞平臺的樣本類型和樣本制備 :在上機前需要注意細胞消化后的細胞團塊,獲得分離良好的細胞懸液、且細胞活力高(>70%);此外,了解您所研究細胞的大小范圍也很重要。細胞大小通常與細胞表達的轉錄本數量有關。各種尺寸不同的細胞(一般直徑不大于50μm)均可與我們基因表達解決方案中使用的BD Rhapsody平臺兼容。一般來說,細胞制備方案將根據組織來源和細胞類型而變化。每種組織類型都是獨特的,因此,必須在開始任何單細胞實驗之前優化樣本制備,烈冰多年樣本解離消化經驗,累積10+物種、50+組織的消化protocol,若您的樣本為組織,且尚未成功將組織樣本消化成單細胞懸液,烈冰將盡可能提供技術及實驗上的幫助。烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規模發現和復雜疾病研究的測序。濟南single cell 單細胞測序
BD Rhapsody平臺在細胞捕獲過程中沒有偏好性,可同樣無差別捕獲中性粒細胞。上海BD Rhapsody單細胞測序服務
烈冰生物單細胞測序服務體系,不僅提供10X Genomics和BD Rhapsody兩大國際認可的單細胞實驗平臺,在“附加”產品上,我們提供BD FACS Melody流式細胞儀,滿足您對特殊細胞類型的富集需求,自主研發的Panocell單細胞捕獲芯片,可兼容BD 平臺全套原裝磁珠、試劑和protocol,為您提供完整的單細胞多組學解決方案。從細胞多樣本分析和染色所需的試劑到檢測試劑盒,生物信息分析工具,和在線大數據分析系統、精簡方案和專業團隊技術支持,烈冰生物可為您提供用于單細胞多組學甚至到空間轉錄組測序的各種工具,助您加速科研探索之旅。上海BD Rhapsody單細胞測序服務
上海烈冰生物醫藥科技有限公司專注技術創新和產品研發,發展規模團隊不斷壯大。一批專業的技術團隊,是實現企業戰略目標的基礎,是企業持續發展的動力。公司業務范圍主要包括:單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序等。公司奉行顧客至上、質量為本的經營宗旨,深受客戶好評。一直以來公司堅持以客戶為中心、單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序市場為導向,重信譽,保質量,想客戶之所想,急用戶之所急,全力以赴滿足客戶的一切需要。