單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉(zhuǎn)錄組測序分析，可精確地描述每一個細胞的狀態(tài)，在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有特殊的應用價值。然而，單細胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息，對于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性。空間轉(zhuǎn)錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序，可以精確指示點陣內(nèi)的全部基因表達情況。空間轉(zhuǎn)錄組測序的加入，無疑讓單細胞測序如虎添翼，更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。烈冰專精單細胞多組學測序領域。南京二代測序單細胞測序數(shù)據(jù)分析

細胞中基因的表達是嚴格按照時間和空間順序發(fā)生，因此細胞類型和基因表達具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序來分析。但是單細胞轉(zhuǎn)錄組測序（scRNA-Seq）在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結構，無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個問題，其以點陣形式記錄組織切片細胞的空間信息，在保留組織形態(tài)結構的基礎上，獲得細胞/基因的空間表達特異性。蘇州10X單細胞測序商業(yè)化服務基因測序相關產(chǎn)品和技術已由實驗室研究逐漸演變到臨床應用，是下一個改變世界的技術。

關于10XGenomics單細胞平臺的樣本類型和樣本制備：10X平臺在上機前需要注意細胞消化后的細胞團塊，獲得分離良好的細胞懸液、無細胞隨便、極少的細胞團塊，且細胞活力高（＞70%）；此外，了解您所研究細胞的大小范圍也很重要。細胞大小通常與細胞表達的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關。各種尺寸不同的細胞（一般直徑不大于50μm）均可與我們基因表達解決方案中使用的10XGenomics平臺兼容。一般來說，細胞制備方案將根據(jù)組織來源和細胞類型而變化。每種組織類型都是獨特的，因此，必須在開始任何單細胞實驗之前優(yōu)化樣本制備，烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗，累積10+物種、50+組織的消化protocol，若您的樣本為組織，且尚未成功將組織樣本消化成單細胞懸液，烈冰將盡可能提供技術及實驗上的幫助。

作為單細胞測序的一個重要里程碑，10xgenomic公司于2016年2月推出10xChromiumSingleCellGeneExpressionSolution，此平臺整合了儀器、試劑盒和信息學軟件，能精確對接illumina測序儀，因此可實現(xiàn)大量大細胞的快速高效標記、測序和分析，獲得單細胞水平的基因表達譜和差異情況，并通過對復雜細胞群體進行深入細致分析，繪制大規(guī)模單細胞表達圖譜。以量化細胞內(nèi)的群體異質(zhì)性，并逐個鑒定細胞類型、細胞狀態(tài)和動態(tài)細胞躍遷。除了有望鑒定新的細胞亞型和稀有細胞群體，單細胞技術還能更好地了解轉(zhuǎn)錄動態(tài)和基因調(diào)控關系。全線搭建10x Genomics單細胞測序平臺。

單細胞獲得困難，不同組織要求不盡相同難以搞定？烈冰2000+項目消化經(jīng)驗，100+組織類型解離protocol，精心設計不同組織實驗的解離、細胞懸浮實驗體系，確保單細胞的獲得。凍存樣本無法實驗，珍貴樣本無法使用？烈冰采用國際認可的凍存組織復蘇技術以及死細胞過濾技術，確保凍存組織使用。珍貴樣本，細胞數(shù)量太少，消化背景雜無法做單細胞？采用國際認可的10XGenomics，BDRhapsody雙平臺模式，根據(jù)樣本實際情況和用戶需求提供客觀有效的實驗方案,細胞量少，背景雜也能做單細胞。單細胞RNA分類精度不足，部分細胞無法細分？烈冰同時采用單細胞蛋白質(zhì)組與單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術，真正做到從上游到下游的全流程檢測，確保超高的細胞分類精度。單細胞測序平臺，烈冰提供高性價比服務方案。南京二代測序單細胞測序數(shù)據(jù)分析

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單細胞測序結果動輒上百G數(shù)據(jù)量，龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求，首先針對下機數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié)：單細胞測序產(chǎn)生數(shù)億的結果序列，不可避免的會出現(xiàn)低質(zhì)量的測序結果，存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質(zhì)量評估就會變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過測序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來表征，即堿基測序結果的錯誤率在1%/0.1%以下的比例。理想的測序結果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后的處理結果的準確性，為后續(xù)細胞類型鑒定和功能分析打下堅實基礎。南京二代測序單細胞測序數(shù)據(jù)分析

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