烈冰生物生信分析團隊緊追國際前沿、整合添加多項國際期刊認可的空轉分析工具,構建一套完整的數據分析流程;精心研發空轉結果瀏覽器,可同步展示空間轉錄組與單細胞測序分析結果,詳細深入地解析空間轉錄組數據。完成從Rawdata(原始數據)到Spot-Gene的具有定位信息的表達矩陣的過程后,就進入了空轉的第二步,去進行Spot的Cluster的過程,熟悉單細胞測序的研究者知道,Cluster在單細胞測序中往往表示為細胞的類型,也就是說能聚在一起采用算法分為一個群體細胞是一個Celltype(當然分情況也會有不同)。而在空轉中,也正是由于前面提到了細胞的非單一性,導致了這里的分群并不是單純的同一細胞類型,而應該認為是具有相同細胞組成的點陣區域,或者說是近似的組織結構區域。烈冰對于一個細胞群體中的每個細胞單獨進行建庫測序分析。蘇州BD空間轉錄組測序服務公司
空間轉錄組測序在病理學中,通過添加基因表達維度,得出形態學結論,通過觀察基因表達區域,了解可能發生假陰性/假陽性的位置; 在免疫學,研究免疫細胞浸潤、不同區域的免疫細胞中的基因表達特征;免疫群體擴散、不同類型免疫細胞的空間位置解析; 在神經科學,研究大腦皮層層狀組織解析,揭示大腦皮層的結構-功能關系,正常vs.疾病大腦結構特征分析與疾病相關的基因表達于特定的大腦皮層; 在發育生物學,通過解析每個發育階段不同解剖區域特有的基因表達特征,解析組織中與形態形成相關基因;豐富基因表達的空間注釋信息,創建組織發育的空間細胞圖譜。深圳烈冰科技空間轉錄組數據分析強勢發文!烈冰空間轉錄組測序助力揭示愈傷組織能再生的機制。
烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業,為科研學者提供專注的測序數據分析服務,先后經歷基因芯片時代、基因測序、轉錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來,烈冰依托自主研發的NovelBrain®生物大數據分析平臺,為用戶提供一站式全流程的空間轉錄組測序服務和解決方案。烈冰經過十幾年的經歷,已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種,皮膚、腦、胰腺、脂肪、心臟、花序等50+組織類型,100+細胞類型,1000+靶標基因,10000+樣本處理經驗。
空間組學可以應用的方向:1.可以鑒定到疾病的空間位置異質性:對于阿爾茨海默癥的研宄可以探索到小神經質細胞趨向于阿爾茨海默神經班。 2.建立空間轉錄組圖譜構建個人空間轉錄組圖譜將極大提升科研人員對生物體組織間的細胞差異。3、描述胚胎發育及空間藍區胚胎發育的動態過程是科研人員一直為之著迷的,空間組學發展可以清晣的描繪胚胎發育的藍圖。除了皮膚、胰腺和骨頭組織外,其余樣本類型均可開展10xGenomics空間轉錄組研究。10xGenomics公司已經測試完畢的組織類型有:人:心勝、腎勝、卵巢、乳房、淋巴結、大腦、大腸、肺、脾臟小鼠:大腦、眼睛、心勝、腎勝、大腸、肝臟、肺、卵巢,四頭肌、小腸、脾勝、胃、翠丸、甲狀腺、舌頭大鼠:大腦、腎臟、心臟烈冰生物成立于2010年,專注于空間轉錄組測序領域科研服務。
多樣本數據合并:FractionofReadsKept:合并樣本時,各樣本根據MappedBarcodedReadsperCell數量計算出來的數據利用率。如果各樣本間該參數值相差很大,需要進行Downsample處理,以數據量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平,從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數據,深入解讀數據分析結果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統穩定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!空間轉錄組測序數據分析,認準烈冰NovelBrain生物信息數據分析平臺。廣州烈冰空間轉錄組服務機構
高通量測序技術是對傳統測序一次翻天覆地的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。蘇州BD空間轉錄組測序服務公司
冰凍切片的空間轉錄組測序在RNA捕獲、文庫構建方面,需要將組織切片貼合在帶有mRNA結合捕獲探針的載玻片上,通過甲醛固定、H&E染色得到組織切片的形態結構。再進行透化處理,使細胞中的mRNA釋放,并結合到芯片相鄰的捕獲探針上。將捕獲的mRNA反轉錄合成cDNA并構建測序文庫進行上機測序,從而獲取基因表達信息。總體來說,空間轉錄組的實驗流程包括:組織凍存-OCT包埋-冷凍切片-固定染色-組織透化-cDNA合成及建庫-上機測序,而需要客戶進行樣本準備的步驟相對簡單:組織凍存與OCT包埋。蘇州BD空間轉錄組測序服務公司
上海烈冰生物醫藥科技有限公司屬于醫藥健康的高新企業,技術力量雄厚。公司是一家有限責任公司(自然)企業,以誠信務實的創業精神、專業的管理團隊、踏實的職工隊伍,努力為廣大用戶提供***的產品。以滿足顧客要求為己任;以顧客永遠滿意為標準;以保持行業優先為目標,提供***的單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序。烈冰生物自成立以來,一直堅持走正規化、專業化路線,得到了廣大客戶及社會各界的普遍認可與大力支持。