空間轉錄組研究的的必耍性：研究單細胞是想要探究細胞間的異質性，但是常規的單細胞是將細胞解離成單細胞懸液，然后利用單細胞分離技術（微孔，微板，液滴）等方法實現單細胞建庫，這里比較大的問題是是細胞失去了原本在組織的空間信息。然而這個空間信息在實際研究中是非常重要。特別是在研究細胞命運機制及細胞譜系發生空間位置的信息顯得尤為重要，因此發展空問轉錄組技術實現細胞的位置信息的保留，對研究此類細胞狀態尤為必要。空間轉錄組測序技術的迅速發展和應用推廣，為從多維度揭示疾病進展提供了強有力的工具。廣州BD空間轉錄組服務機構

空間轉錄組測序的數據分析基本分為三個階段：1.數據的預處理部分；2.Spot點陣的分群與定義；3.Spot分群的功能與生物學價值。每一個部分都不可或缺，其結果都對后續的分析結果有重要影響。由于空間轉錄組的序列結構與單細胞轉錄組測序的左端序列結構是非常接近的，都是Cellbarcode/SpotBarcode+UMI+捕獲區域這樣的設計。右端普遍為捕獲的RNA序列。因此采用單細胞的原始數據過濾策略即可，左端可以考慮切下捕獲區域前的序列區域作為后續分析用的序列以減少分析負荷。隨后，采用10X官方的Spatialranger的策略進行后續分析，解析出位于空間位置中的有效的Spot表達矩陣。廣州高通量測序空間轉錄組服務機構烈冰引進國際主流空間轉錄組測序平臺，提供保留組織內部精細區域的空間信息的轉錄組測序。

烈冰生物生信分析團隊緊追國際前沿、整合添加多項國際期刊認可的空轉分析工具，構建一套完整的數據分析流程；精心研發空轉結果瀏覽器，可同步展示空間轉錄組與單細胞測序分析結果，詳細深入地解析空間轉錄組數據。完成從Rawdata（原始數據）到Spot-Gene的具有定位信息的表達矩陣的過程后，就進入了空轉的第二步，去進行Spot的Cluster的過程，熟悉單細胞測序的研究者知道，Cluster在單細胞測序中往往表示為細胞的類型，也就是說能聚在一起采用算法分為一個群體細胞是一個Celltype（當然分情況也會有不同）。而在空轉中，也正是由于前面提到了細胞的非單一性，導致了這里的分群并不是單純的同一細胞類型，而應該認為是具有相同細胞組成的點陣區域，或者說是近似的組織結構區域。

空間轉錄組數據可以用單細胞轉錄組數據的分析策略進行分析，例如，利用GO和Pathway分析篩選不同發育時期特定空間區域內的信號通路及其關鍵基因的較大情況，揭示在特定發育時期特定區域內發生的生物學過程。針對任何一個基因，空間轉錄組可以顯示表達該基因的點陣及其空間排布；單細胞轉錄組可以給出該基因表達的細胞類群；原位測序可以給出該基因在細胞內的表達狀況。通過不同發育時間點的信息比較，可以分析細胞類群在某個部位在不同時間點的差異，給出其在細胞內的真實的演變狀況。助力探索生命時空多維度的動態變化的生物學信息；助力生命健康醫療大時代！

當組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉錄組芯片上時，通過透化處理，細胞內的mRNA釋放出來，從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲。被捕獲的mRNA開始逆轉錄，得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列。通過上機測序，可以將每個mRNA轉錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置。Visium空間轉錄組的重點在于芯片部分：正式文庫構建的芯片上有4個捕獲區域（6.5mmX6.5mm，可以檢測4個樣本）每個捕獲區域含有約5000個被條形碼標記的點（barcodedspots）每個spot直徑55μm，每個spot能捕獲1-10個細胞spot與spot中心點之間的距離為100μm每個spot含有上百萬個可以與mRNA結合的捕獲探針，每個探針上都帶有獨特的spatialbarcodes，用以標記捕獲的mRNA的空間位置。空間轉錄組測序，上海烈冰生物科技很靠譜。廣州BD空間轉錄組數據分析可視化

空間轉錄組測序技術遍地開花，烈冰服務讓您的生物醫學研究如虎添翼。廣州BD空間轉錄組服務機構

烈冰提供空間轉錄組全流程服務，包括樣本包埋、貼片、選片、HE染色、拍照成像、組織透化、建庫測序以及后續的FISH驗證等各個步驟，為您提供無憂服務。烈冰搭建了以萊卡CM1950冷凍切片機、尼康多熒光通路全自動掃描顯微鏡、3Dhistech-midi數字掃描儀為基礎的先進實驗平臺，并制定嚴格規范的實驗室SOP，經過大量的切片、貼片實操演練，對不同類型組織的切片厚度、溫度進行優化，確保獲得更好質量的冷凍切片。利用NovelBrain云分析平臺，搭建0代碼需求的空間轉錄組分析流程，準確快速解析空間轉錄組數據。取同一樣本組織的相鄰區域進行單細胞轉錄組測序，通過單細胞轉錄組數據和空間轉錄組數據的整合分析，判定空間區域內的細胞類別，精確解析組織空間內的異質化信息。廣州BD空間轉錄組服務機構

上海烈冰生物醫藥科技有限公司是一家生物科技、醫藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發、技術服務、技術轉讓、技術咨詢，市場營銷策劃，市場信息咨詢與調查（不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗），從事貨物及技術的進出口業務，計算機、軟件及耗材（除專控），軟件開發【依法須經批準的項目，經相關部門批準后方可開展經營活動】的公司，致力于發展為創新務實、誠實可信的企業。烈冰生物擁有一支經驗豐富、技術創新的專業研發團隊，以高度的專注和執著為客戶提供單細胞測序，生物大數據云分析平臺，空間轉錄組測序，單細胞多組學測序。烈冰生物不斷開拓創新，追求出色，以技術為先導，以產品為平臺，以應用為重點，以服務為保證，不斷為客戶創造更高價值，提供更優服務。烈冰生物始終關注醫藥健康市場，以敏銳的市場洞察力，實現與客戶的成長共贏。