其實,空間轉(zhuǎn)錄組的概念早就已經(jīng)存在了,目前已經(jīng)發(fā)表的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。但是這些方法存在操作復(fù)雜、檢測精度不準(zhǔn)確、基因和細(xì)胞檢測量的限制等問題。10xGenomics公司升級spatialTranscriptomic后推出的Visium空間基因表達(dá)解決方案是一款商業(yè)化的高精度、高通量空間轉(zhuǎn)錄組測序方案。烈冰科技自2020年起,國內(nèi)率先搭建空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)平臺,聯(lián)合上線單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測序、AbSeq、單細(xì)胞TCR-Seq、單細(xì)胞ATAC-Seq(ARCHR測序)、空間轉(zhuǎn)錄組測序產(chǎn)品結(jié)合scRNA-Seq服務(wù),多組學(xué)聯(lián)合助力科研人員探索時空等多維度、多角度的動態(tài)變化的生物學(xué)信息。烈冰生物為您提供貼心的單細(xì)胞研究完整解決方案!單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)整合了單細(xì)胞各個組學(xué)特征, 提供了揭示細(xì)胞內(nèi)復(fù)雜分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及其互動關(guān)系的機(jī)會。青島single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持
機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激,其細(xì)胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時,往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,導(dǎo)致一些基因被“沉默”,一些基因被重新“喚醒”,但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時序分析,即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時間的變化情況,構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育,但這里的時間并不是真時間,而是一個虛擬的時間,是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中,也會存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此,不論測定了多少樣本,我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。重慶single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)平臺單細(xì)胞多組學(xué)可從整體層面快速有效地探尋疾病發(fā)生、發(fā)展的根本原因或藥物作用靶點等信息。
單細(xì)胞測序技術(shù)的不斷發(fā)展解決了以往群體細(xì)胞組學(xué)分析面臨的兩個瓶頸:一是大量細(xì)胞的混合測序會掩蓋細(xì)胞間的異質(zhì)性;二是傳統(tǒng)的測序技術(shù)需要大量的細(xì)胞作為起始,細(xì)胞數(shù)目稀有的樣品則難以研究.利用單細(xì)胞測序方法不僅能夠揭示組織中的細(xì)胞類型和稀有亞群、細(xì)胞狀態(tài)和命運(yùn)的變化,還可以研究細(xì)胞數(shù)稀有的珍貴樣品,從而幫助人們理解發(fā)育、衰老和疾病發(fā)展的機(jī)制。隨著單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、基因組、表觀遺傳組、蛋白組等各組學(xué)測序技術(shù)的快速發(fā)展,研究者開始將它們相互組合,使得單個細(xì)胞或同類細(xì)胞的多個組學(xué)數(shù)據(jù)能夠聯(lián)合分析.因此,利用單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)能夠更有效地研究細(xì)胞在特定時空狀態(tài)下各組學(xué)間的復(fù)雜聯(lián)系,從而揭示細(xì)胞狀態(tài)和命運(yùn)調(diào)控的分子機(jī)制。
空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可以用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分析策略進(jìn)行分析,例如,利用GO和Pathway分析篩選不同發(fā)育時期特定空間區(qū)域內(nèi)的信號通路及其關(guān)鍵基因的較大情況,揭示在特定發(fā)育時期特定區(qū)域內(nèi)發(fā)生的生物學(xué)過程。針對任何一個基因,空間轉(zhuǎn)錄組可以顯示表達(dá)該基因的點陣及其空間排布;單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組可以給出該基因表達(dá)的細(xì)胞類群;原位測序可以給出該基因在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)狀況。通過不同發(fā)育時間點的信息比較,可以分析細(xì)胞類群在某個部位在不同時間點的差異,給出其在細(xì)胞內(nèi)的真實的演變狀況。單細(xì)胞多組學(xué)突破了以往單細(xì)胞檢測的單一性,可更多樣化。
烈冰科技作為國內(nèi)同時擁有10XGenomics和BDRhapsody雙分選平臺的測序服務(wù)商及云計算服務(wù)供應(yīng)商,經(jīng)過多年實戰(zhàn),擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗,實測BDRhapsody對能夠高效捕獲粒細(xì)胞。針對不同的分選平臺、建庫方法,實戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程;烈冰科技NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)平臺能有效支撐生命科學(xué)研究、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。完備的高通量測序?qū)嶒炂脚_,包括NovaSeq6000、10XChromiumX、BDFACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,配合一支來自海內(nèi)外名校、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團(tuán)隊,為您的科學(xué)研究保駕護(hù)航。單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)是在單細(xì)胞分辨率下精確分析細(xì)胞異質(zhì)性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的新技術(shù)。重慶single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)平臺
單細(xì)胞多組學(xué)的研究對生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn),細(xì)胞分化發(fā)育研究等均有重要意義。青島single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持
烈冰生物生信分析團(tuán)隊緊追國際前沿、整合添加多項國際期刊認(rèn)可的空轉(zhuǎn)分析工具,構(gòu)建一套完整的數(shù)據(jù)分析流程;精心研發(fā)空轉(zhuǎn)結(jié)果瀏覽器,可同步展示空間轉(zhuǎn)錄組與單細(xì)胞測序分析結(jié)果,詳細(xì)深入地解析空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。完成從Rawdata(原始數(shù)據(jù))到Spot-Gene的具有定位信息的表達(dá)矩陣的過程后,就進(jìn)入了空轉(zhuǎn)的第二步,去進(jìn)行Spot的Cluster的過程,熟悉單細(xì)胞測序的研究者知道,Cluster在單細(xì)胞測序中往往表示為細(xì)胞的類型,也就是說能聚在一起采用算法分為一個群體細(xì)胞是一個Celltype(當(dāng)然分情況也會有不同)。而在空轉(zhuǎn)中,也正是由于前面提到了細(xì)胞的非單一性,導(dǎo)致了這里的分群并不是單純的同一細(xì)胞類型,而應(yīng)該認(rèn)為是具有相同細(xì)胞組成的點陣區(qū)域,或者說是近似的組織結(jié)構(gòu)區(qū)域。青島single cell RNA單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)支持
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司辦公設(shè)施齊全,辦公環(huán)境優(yōu)越,為員工打造良好的辦公環(huán)境。在烈冰生物近多年發(fā)展歷史,公司旗下現(xiàn)有品牌NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造等。我公司擁有強(qiáng)大的技術(shù)實力,多年來一直專注于生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計算機(jī)、軟件及耗材(除專控),軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】的發(fā)展和創(chuàng)新,打造高指標(biāo)產(chǎn)品和服務(wù)。上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主營業(yè)務(wù)涵蓋單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序,堅持“質(zhì)量保證、良好服務(wù)、顧客滿意”的質(zhì)量方針,贏得廣大客戶的支持和信賴。