所謂的高通量測序技術,又名大規模平行測序,是將DNA(或者cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,檢測對應的信號并獲取序列信息。與傳統測序法相比,高通量測序技術在處理大規模樣品時具有強大的優勢,又快(兩天)又多(數百萬克隆),成為目前組學研究的主要技術。單細胞測序是一個系統的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實驗過程如何規劃,實驗平臺如何選擇,樣本如何制備,數據如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務就已經開始了,從銷售到實驗到專業技術支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項目訴求,提供從實驗設計到文章發表的全流程,我們始終是您貼心的科學合作伙伴。隨著單細胞多組學的不斷進步, 研究者將有機會在單細胞分辨率下進一步理解個體發育以及疾病發展機制。無錫烈冰生物單細胞多組學商業化服務
FluidigmC1平臺基于富魯達(Fluidigm®)的微流控技術應用于單細胞測序(SingleCellRNASequencing)領域的商業化中,該技術大約在幾個小時中可以捕獲96個左右的細胞,進行各類的Single-Cell測序建庫。當然,通量還是比較小。但不可否認的是,現在很多非RNA類SingleCell測序,仍然在采用這樣的技術,如SingleCellDNA-Seq,SingleCellATAC-Seq等,都是采用此技術進行單細胞分選后再分別用不同試劑盒建庫。所以可以說,至少在10XGenomics、BD或者其他企業推出有效的SingleDNA測序技術之前,C1仍然會是市場上的重要組成部分。重慶烈冰單細胞多組學技術支持,從多組學的角度對單細胞進行綜合分析 將是未來單細胞技術的必由之路。
reads數、基因表達量及細胞數量判定過程中:以捕獲5000個細胞、100G的測序量為標準,每個細胞的reads數大約在50k左右;每個細胞的基因中位數取決于樣本的細胞類型,例如成熟的B,T,粒細胞數量較多的組織中,由于該類型細胞表達的基因數普遍較少,導致基因中位數下降。而某一疾病組織、或者體外培養的如干細胞等,他們的基因表達數較高,甚至可以超過1萬,這就導致該類樣本基因中位數非常高。因此,我們對細胞數量以及基因中位數確認時,需要考察實際組織的細胞組成。
隨著單細胞轉錄組測序技術(scRNA-Seq)的蓬勃發展,其在在胚胎發育,腫瘤細胞異質性,免疫細胞轉化等多方面屢建奇功,但是由于細胞形態的不同和單細胞制備中細胞敏感性的差異等因素影響,scRNA-Seq在數據分析時可能會出現細胞類型占比失真,個別細胞類型丟失等情況。為了克服單細胞測序技術的局限性,單細胞核轉錄組測序技術(snRNA-Seq)應運而生,snRNA-Seq可利用凍存組織直接制備單細胞核進行轉錄組測序,不僅克服了細胞形態差異致使的細胞捕獲差異,還克服了單細胞測序必須使用新鮮樣本的多個局限性。單細胞測序手段有力地解決了組織內高度異質性對于低豐度信號影響的問題。
對于單細胞測序而言,常常需要先構建細胞圖譜,在此基礎上再開展后續各項分析,并且數據分析時以細胞聚類(cell cluster)為討論對象,而不是像常規Bulk測序一樣以組別為分析對象,因此單細胞測序項目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴格,但是單細胞測序,特別是目的為圖譜研究時,需要通過提高樣本復雜度(增加樣本數),盡可能的構建某一疾病類型、群體細胞圖譜信息。因此,單細胞測序實驗設計時首先需要保證生物學重復,不同樣本來源的樣本建議單獨進行細胞解離和捕獲、建庫、測序,以保證捕獲到足夠的細胞數,單個樣本分別捕獲細胞時,后續分析除了整體分析以外,還可以做單樣本分析,保證分析的完備準確性。單細胞多組學對不同組學技術產生的數據進行整合分析有助于更刻畫細胞內的基因調控狀態、揭示調控機制。合肥BD單細胞多組學
單一的轉錄本研究不能體現生命進程的變化,因此多組學聯合分析成為解析生命進程的有力工具。無錫烈冰生物單細胞多組學商業化服務
烈冰生信團隊傾情研發的NovelBrain®生信大數據分析平臺,可實現零代碼操作、簡單方便:單細胞瀏覽器的操作簡單,不需要命令行操作。簡單拖拽、設置參數即可運行,即使生信0基礎用戶也可以運用自如;可視化展示海量結果文件:可視化展示Cluster的基因數,UMI數量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對應的細胞數量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等;3D立體展示,文章動圖先人一步:單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結果進行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。無錫烈冰生物單細胞多組學商業化服務
上海烈冰生物醫藥科技有限公司是一家生物科技、醫藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發、技術服務、技術轉讓、技術咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調查(不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗),從事貨物及技術的進出口業務,計算機、軟件及耗材(除專控),軟件開發【依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動】的公司,是一家集研發、設計、生產和銷售為一體的專業化公司。烈冰生物作為醫藥健康的企業之一,為客戶提供良好的單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序。烈冰生物繼續堅定不移地走高質量發展道路,既要實現基本面穩定增長,又要聚焦關鍵領域,實現轉型再突破。烈冰生物始終關注醫藥健康市場,以敏銳的市場洞察力,實現與客戶的成長共贏。