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寧波上海烈冰生物單細胞多組學測序服務公司

來源: 發布時間:2022-08-27

BD的技術不再采用利用微流控孔道射出細胞和射出的磁珠碰撞的過程,進行單細胞捕獲的技術,轉而采用CytoSeq特有的蜂窩板技術。該技術用20萬+的微孔(該數量級遠大于Input細胞數量),保證單孔中的單細胞捕獲。同時避免了10X中存在的概率碰撞影響捕獲效率的問題,采用微孔捕獲相對會有更好的捕獲效率(來自兩家企業商業宣傳資料比對),保證Input細胞的高效使用。對于Input細胞的量更少的情況,可以基于百萬級別的細胞總量開始進行前期處理以及后期捕獲操作。而在細胞捕獲完成后,進行細胞裂解后,同樣的也進行細胞中RNApolyA序列的抓取工作。在單細胞水平上的多組學分析能夠為研究組提供前所未有的臨床和科研大數據。寧波上海烈冰生物單細胞多組學測序服務公司

基因測序是基因檢測的方法之一,其又叫基因譜測序,是國際上公認的一種基因檢測標準。高通量測序技術是對傳統測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定,被稱為下一代測序技術(nextgenerationsequencing),足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。基因測序相關產品和技術已由實驗室研究逐漸演變到臨床應用,可以說,基因測序技術將是下一個改變世界的技術。烈冰生物單細胞多組學商業化服務首先 出現的單細胞多組學方法就是將轉錄組與其他組學技術結合。

細胞是構成生命的基礎單元,迅速發展的單細胞測序技術為在單細胞層面研究細胞功能及其背后的基因調控機制提供了重要的技術手段,單細胞測序可用于檢測多種不同的組學種類,包括轉錄組、染色質開放組、DNA甲基化組、組蛋白修飾組等等,對不同組學技術產生的數據進行整合分析有助于更地刻畫細胞內的基因調控狀態、揭示調控機制。然而,與傳統的bulk數據相比,單細胞數據具有規模大、噪聲高、異構性強等特點,如何通過開發新的計算方法實現對這些寶貴數據的有效利用已成為當今生物信息學領域關注的重點與熱點。

單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉錄組測序分析,可精確地描述每一個細胞的狀態,在異質性發育過程中具有不可忽視的應用價值。然而,單細胞測序無法給出固態異質化組織中細胞空間排布信息,對于揭示發育過程、病理微環境都存在很大的局限性。空間轉錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序,可以精確指示點陣內的全部基因表達情況。空間轉錄組測序的加入,無疑讓單細胞測序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質性。隨著單細胞多組學的不斷進步, 研究者將有機會在單細胞分辨率下進一步理解個體發育以及疾病發展機制。

單細胞測序結果動輒上百G數據量,龐大的數據對于分析平臺和分析能力有著很高的要求,首先針對下機數據的質控環節:單細胞測序產生數億的結果序列,不可避免的會出現低質量的測序結果,存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質量評估就會變得極為重要。序列質量主要通過測序質量值Q20/Q30的占比來表征,即堿基測序結果的錯誤率在1%/0.1%以下的比例。理想的測序結果reads的堿基質量均高于30。保證數據獲得后第一步的處理結果的準確性,為后續細胞類型鑒定準確和功能分析打下堅實基礎。在單細胞轉錄組領域,將轉錄組與蛋白質結合的代表性例子只有單細 胞RNA測序方法。高通量測序單細胞多組學技術支持

單細胞多組學對不同組學技術產生的數據進行整合分析有助于更刻畫細胞內的基因調控狀態、揭示調控機制。寧波上海烈冰生物單細胞多組學測序服務公司

烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業,為科研學者提供專注的測序數據分析服務,先后經歷基因芯片時代、基因測序、轉錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來,單細胞測序進入發展的快車道,烈冰作為國內首批引進單細胞實驗雙平臺的公司,依托自主研發的NovelBrain®生物大數據分析平臺,為用戶提供一站式全流程的單細胞測序服務和解決方案。4年的單細胞技術的積累,烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種,皮膚、腦、胰腺、脂肪、心臟、花序等50+組織類型,100+細胞類型,1000+靶標基因,10000+樣本處理經驗。寧波上海烈冰生物單細胞多組學測序服務公司

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