單細胞測序技術是一種在單細胞水平上對基因組、轉錄組、表觀組等進行高通量測序分析的技術。單細胞測序技術能夠在組學水平揭示細胞間的異質性。單細胞水平細胞譜系追蹤技術位居2018年Science 雜志評選的科學突破。常規單細胞轉錄組測序技術丟失了細胞在原組織中至關重要的空間位置信息，而單細胞空間轉錄組技術在進行單細胞轉錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息。空間轉錄組技術能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環境，將成為發育生物學、神經生物學、免疫生物學等領域的研究利器。十二年測序經驗，累計服務與5000余項重要科研項目。廈門BD空間轉錄組平臺

空間轉錄組數據可以用單細胞轉錄組數據的分析策略進行分析，例如，利用GO和Pathway分析篩選不同發育時期特定空間區域內的信號通路及其關鍵基因的較大情況，揭示在特定發育時期特定區域內發生的生物學過程。針對任何一個基因，空間轉錄組可以顯示表達該基因的點陣及其空間排布；單細胞轉錄組可以給出該基因表達的細胞類群；原位測序可以給出該基因在細胞內的表達狀況。通過不同發育時間點的信息比較，可以分析細胞類群在某個部位在不同時間點的差異，給出其在細胞內的真實的演變狀況。上海烈冰空間轉錄組測序服務公司空間轉錄組測序以分子方式定義病理，完成了病理數字化結合病理影像化的革新。

相比于常規的測序手段，空間轉錄組測序有幾個明顯的優勢：1.將轉錄組信息與空間信息對應，體現組織內部的異質性：每個區域獨特的條形碼使測序結果與空間位置形成一一對應關系。雖然暫時還無法精細到單細胞層面，但是這樣的區域劃分也已經足以展現出組織內部不同區域間的轉錄組差異。2.不影響對全組織進行分析：芯片上捕獲的全轉錄組在同一個反應中完成測序，能有效降低多次重復實驗中的誤差。測序結果如果不按照條形碼歸類，則直接體現的是切片全組織的轉錄組情況，無需再做單獨檢測。3.為進一步的研究提供指導意見：常規的轉錄組測序，對后續實驗的指導仍然停留在全組織層面。而空間轉錄組測序則可以標識出更有價值的研究區域，引導研究者將組織進一步細分。

解決空間轉錄組測序數據分析中由于超大數據量、超高的質控要求以及繁多分析需求而引起的分析困難，做到快速可定制化完成空間轉錄組分析；擁有行業先進的3DHISTECH公司的PANNORAMIC系列的數字切片掃描儀，可以同時實現明場與熒光場下冷凍切片的快速掃描成像；Z-Stack多層聚焦掃描及Extended Focus 景深擴展多層融合掃描模式，進一步提升分辨率和清晰度，保證切片高分辨的數字圖像信息精細采集；能夠滿足針對分析結果中感興趣基因的RNA-FISH驗證以及組織切片的免疫組化的高清成像，獲取表達與定位信息。空間轉錄組測序是高通量測序下的又一重大技術突破。

多樣本數據合并：FractionofReadsKept：合并樣本時，各樣本根據MappedBarcodedReadsperCell數量計算出來的數據利用率。如果各樣本間該參數值相差很大，需要進行Downsample處理，以數據量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平，從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數據，深入解讀數據分析結果，深入挖掘其背后的生物學意義；從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統穩定等方面助力單細胞研究，加速科研進程！烈冰斥巨資引進Novaseq6000，開啟更大通量測序新紀元。青島BD Rhapsody空間轉錄組測序服務公司

強勢發文！烈冰空間轉錄組測序助力揭示愈傷組織能再生的機制。廈門BD空間轉錄組平臺

空間轉錄組測序的數據分析基本分為三個階段：1.數據的預處理部分；2.Spot點陣的分群與定義；3.Spot分群的功能與生物學價值。每一個部分都不可或缺，其結果都對后續的分析結果有重要影響。由于空間轉錄組的序列結構與單細胞轉錄組測序的左端序列結構是非常接近的，都是Cellbarcode/SpotBarcode+UMI+捕獲區域這樣的設計。右端普遍為捕獲的RNA序列。因此采用單細胞的原始數據過濾策略即可，左端可以考慮切下捕獲區域前的序列區域作為后續分析用的序列以減少分析負荷。隨后，采用10X官方的Spatialranger的策略進行后續分析，解析出位于空間位置中的有效的Spot表達矩陣。廈門BD空間轉錄組平臺

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