在轉錄組學領域，空間轉錄組也開辟了新世界。Nature Methods在今年1月份將空間轉錄組學評價為2020年度方法，空間轉錄組方法近幾年越來越受到歡迎，它將帶領組學在生物學的研究上進入新的階段。從轉錄組測序到實現單細胞轉錄測序，這一過程為精確認識不同細胞類型提供了巨大的幫助?，F在，新的空間轉錄組方法不僅帶來轉錄組信息，同時還提供空間信息，幫研究者更好辨別轉錄的位置，進一步擴展到單細胞分辨率，這會更大程度提升科學家對單個細胞的認識和解讀。空間轉錄組測序技術遍地開花，烈冰服務讓您的生物醫學研究如虎添翼。廈門高通量測序空間轉錄組平臺

空間轉錄組測序的關鍵就在于，解決了空間位置保留的問題。被放置在芯片區域內的冰凍組織切片在經過H&E染色和成像記錄后，會被進行透化處理，釋放細胞中的RNA。芯片上的捕獲引物的中段設置了帶有獨特標識的條形碼區域。芯片被劃分為了數個不同的捕獲區域，每個捕獲區域中錨定的引物都帶有不同的條形碼序列。每個區域對應的組織位置會被記錄下來，然后再進行測序后，通過條形碼將不同區域的測序結果，映射到對應的組織位置上，拼貼形成組織樣品的空間轉錄組圖像。深圳上海烈冰生物空間轉錄組多組學測序烈冰生物為您提供一站式全流程空間轉錄組測序服務。

空間轉錄組測序與單細胞測序的結果不同，這里存在一個概念叫做NumberofSpotsundertissue，即，空間轉錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點。這個有效Spot的篩選標準是有UMI以及有序列表達。那么這個時候，貼片的質量就成為了制約空間轉錄組有效區域的要點了。如果組織沒有很好地覆蓋到空轉片上，那么容易出現雖然有HE染色有組織片子，但是沒有基因表達，即無有效Spot位點。同樣的，另一個就是組織切片的大小，也就是說組織切片在整個玻片的覆蓋面積越小，分析的有效區域就越少。這兩者基本上決定了整個空間轉錄組分析結果的基礎質量。

多樣本數據合并：FractionofReadsKept：合并樣本時，各樣本根據MappedBarcodedReadsperCell數量計算出來的數據利用率。如果各樣本間該參數值相差很大，需要進行Downsample處理，以數據量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平，從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數據，深入解讀數據分析結果，深入挖掘其背后的生物學意義；從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統穩定等方面助力單細胞研究，加速科研進程！烈冰開展了空間轉錄組、單細胞多組學以及空間轉錄組等多種產品在內的全套科研解決方案。

烈冰生信團隊傾情研發的NovelBrain®生信大數據分析平臺，可實現零代碼操作、簡單方便：單細胞瀏覽器的操作簡單，不需要命令行操作。簡單拖拽、設置參數即可運行，即使生信0基礎用戶也可以運用自如；可視化展示海量結果文件：可視化展示Cluster的基因數，UMI數量、線粒體RNA占比信息；以及不同Cluster對應的細胞數量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等；3D立體展示，文章動圖先人一步：單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結果進行三維立體展示，更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。附加流式分選細胞表面Marker，對于較低分辨率的標志物也能有效鑒定，助力高要求測序項目。合肥烈冰空間轉錄組測序

測序可準確地分析基因表達差異、基因結構變異、篩選分子標記（SNPs或SSR）等生命科學重要問題。廈門高通量測序空間轉錄組平臺

空間轉錄組學（Spatial Transcriptomics）是指在組織切片上完成，保留樣本空間信息的組學研究。空間轉錄組可展示組織切片中不同區域的基因表達情況，揭示精細病理區域中激發的信號通路，完成分子特征驅動病理特征的機制解析。空間轉錄組學完成了病理數字化結合病理影像化的技術革新，對于診斷標志物、耐藥位點以及靶向藥物的研發，免疫治等新興領域都具有重要作用。當組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉錄組芯片上時，通過透化處理，細胞內的mRNA釋放出來，從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲。被捕獲的mRNA開始逆轉錄，得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列。通過上機測序，可以將每個mRNA轉錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置。廈門高通量測序空間轉錄組平臺

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