空間轉錄組測序在病理學中,通過添加基因表達維度,得出形態學結論,通過觀察基因表達區域,了解可能發生假陰性/假陽性的位置; 在免疫學,研究免疫細胞浸潤、不同區域的免疫細胞中的基因表達特征;免疫群體擴散、不同類型免疫細胞的空間位置解析; 在神經科學,研究大腦皮層層狀組織解析,揭示大腦皮層的結構-功能關系,正常vs.疾病大腦結構特征分析與疾病相關的基因表達于特定的大腦皮層; 在發育生物學,通過解析每個發育階段不同解剖區域特有的基因表達特征,解析組織中與形態形成相關基因;豐富基因表達的空間注釋信息,創建組織發育的空間細胞圖譜。烈冰生物全轉錄組測序通過雙文庫構建,實現多種RNA的一網打盡。合肥烈冰生物空間轉錄組服務機構
10xGenomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區域,每個捕獲區域的大小為6.5x6.5mm,包含5000個被條形碼標記的點(barcodedspots),每個點的直徑為55μm,點和點之間中心的距離為100μm,并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA,遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列,然后進行文庫構建并進行測序。根據數據的條形碼信息對數據進行分析,以確定哪些數據來自哪個位置,從而實現空間基因表達的可視化。烈冰空間轉錄組平臺烈冰智造空間轉錄組細胞捕獲,媲美國際主流的單細胞平臺。
已發表的關于空間轉錄組技術有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。這些方法或是在細胞數量上限制較大,或是存在有效測序深度不足等問題。10xGenomics公司提供的Visium空間基因表達解決方案是目前一個高通量空間轉錄組的商業化解決方案。該解決方案可以輕松地將空間轉錄組學技術應用到組織切片和染色的標準方法中,從而研究空間分辨率下整個轉錄組mRNA的表達情況,同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息。
細胞在組織樣本中的相對空間位置關系對于了解疾病病理學非常重要。但是scRNA-Seq在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結構,無法給出固態異質化組織中細胞空間排布信息。而空間轉錄組可以解決這個問題,通過記錄組織切片細胞的空間信息,捕獲組織切片中的組織學信息;通過免疫熒光進行蛋白組檢測,將基因表達譜映射回組織樣本中的原始位置,同時獲得細胞/基因的空間表達特異性。該技術可以為神經科學,發育生物學,免疫生理學等領域的研究提供組織和基因表達情況的新視角。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務。
空間轉錄組學(Spatial Transcriptomics)是指在組織切片上完成,保留樣本空間信息的組學研究。空間轉錄組可展示組織切片中不同區域的基因表達情況,揭示精細病理區域中激發的信號通路,完成分子特征驅動病理特征的機制解析。空間轉錄組學完成了病理數字化結合病理影像化的技術革新,對于診斷標志物、耐藥位點以及靶向藥物的研發,免疫治等新興領域都具有重要作用。當組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉錄組芯片上時,通過透化處理,細胞內的mRNA釋放出來,從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲。被捕獲的mRNA開始逆轉錄,得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列。通過上機測序,可以將每個mRNA轉錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置。烈冰測序服務已助力300余篇國際主流期刊研究文章發表。上海上海烈冰生物空間轉錄組測序服務公司
空間轉錄組測序因其強大的探究疾病--細胞--基因的關系,一度成為高通量測序技術的“天花板”。合肥烈冰生物空間轉錄組服務機構
自2015年以來,健康科技成為醫藥健康有限責任公司(自然)增長的領域。事實上,根據硅谷銀行的分析,有風投支持的健康科技行業募資次數在這段時間增長了25%,硅谷銀行與其中大約40%的歐美公司進行了合作。在《2019年本》鼓勵類條目中增加了“單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序的開發和生產”。在中藥產業領域,增加了“中藥飲片炮制技術傳承與創新,中藥經典名方的開發與生產,中藥創新的研發與生產”等內容。總體而言,健康科技行業前景光明。在過去五年里,這一行業的穩健增長已經給未上市有限責任公司(自然)公司帶來逾270億美元的收入,14家公司的估值超過10億美元。另外,2019年退出總價值已經超過2018年,達到創紀錄的80億美元,這在很大程度上是因為強勁IPO的推動。新增內容體現了我國醫藥產業技術升級的方向,有助于引導企業緊跟國際前沿技術,加快開發具有國際競爭力的新產品,提高產業化水平。既是單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序當前發展的重要方向,也是我國重視中醫藥傳承與創新發展的重要體現。合肥烈冰生物空間轉錄組服務機構
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