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重慶850K芯片DNA甲基化經驗豐富

來源: 發布時間:2021-09-02

全基因組甲基化測序(Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS)是將重亞硫酸鹽Bisulfite處理和高通量測序技術相結合,對有參考基因組進行全基因組范圍的單堿基分辨率的甲基化測序,是DNA甲基化檢測的“金標準”。WGBS滿足全基因組DNA甲基化圖譜及疾病關聯分析、基因調控分析、疾病的甲基化標志物篩選等探索性課題的研究。技術優勢:DNA甲基化檢測**有力的工具,單堿基分辨率,檢測每個C堿基的甲基化狀態,全基因組范圍,**限度地獲得甲基化信息,適合所有有參考基因組的物種適合各種類型的樣本。甲基化驗證是甲基化研究必不可少的一環。重慶850K芯片DNA甲基化經驗豐富

WGBS:科學方案設計:從項目背景了解、協助方案設計、實驗材料選取、建庫測序,到數據分析每個項目有特定的科學問題;需要專業、有價值的建議;科學、縝密的設計及時高效的溝通;以保障高質量研究成果。樣本要求:基因組DNA:>=3ug;樣品濃度>30ng/ul;無RNA和蛋白污染建庫測序:測序策略:IlluminaHiSeq,PE150;測序深度:>=30X。信息分析:基于全基因組范圍的甲基化分析,數據質控,5mCCalling,5mC在基因組、染色體、功能元件上的分布,多樣本甲基化差異聚類,差異甲基化DMR鑒定及相關基因的功能分析,結合項目背景和科學問題的數據亮點挖掘。安徽WGBSDNA甲基化口碑推薦ATAC-seq實驗過程短,從實驗到分析可達2周。

DNA甲基化(DNA methylation)是指在DNA甲基化轉移酶(DNMT)催化下,以S-腺苷甲硫氨酸為甲基供體,將活性甲基轉移至DNA鏈中特定堿基上的化學修飾過程。哺乳動物基因組中,DNA甲基化多發生在CpG二核苷酸中的胞嘧啶的5位碳原子。DNA甲基化是一種表觀(epigenetic)修飾,它在不改變DNA序列的情況下,對個體的生長、發育、基因表達模式以及基因組的穩定性起到重要的調控作用,這種修飾是可逆的,并且這種修飾在發育和細胞增殖的過程中是可以穩定傳遞的。近年來的大量研究表明,DNA異常甲基化與**的發生、發展、細胞*變有著密切的聯系。

industryTemplateRRBS用于人、哺乳動物及魚類方向的高水平甲基化研究。

羥甲基化DNA免疫沉淀測序(HydroxymethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing,hMeDIP-Seq)是通過5hmC特異性抗體富集羥甲基化的DN**段,然后結合高通量測序技術在全基因組水平上以較小的數據量,快速、高效地尋找羥甲基化區域。可廣泛應用于羥甲基化與疾病關系研究以及羥甲基化在胚胎發育過程中的研究。技術優勢:從項目背景了解、協助方案設計、實驗材料選取、建庫測序,到數據分析每個項目有特定的科學問題;需要專業、有價值的建議;科學、縝密的設計及時高效的溝通;以保障高質量研究成果強化版RRBS技術及應用是高性價比方案。四川RRBSDNA甲基化口碑推薦

中小樣本篩選, 大樣本中進一步驗證。重慶850K芯片DNA甲基化經驗豐富

甲基化DNA免疫沉淀測序(MethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing,MeDIP-Seq)是通過5mC特異性抗體富集甲基化的DN**段,然后結合高通量測序技術在全基因組水平上以較小的數據量,快速、高效地尋找甲基化區域。可廣泛應用于甲基化與疾病關系研究。樣本要求:基因組DNA:>=3ug;樣品濃度>50ng/ul;無RNA和蛋白污染,建庫測序:測序策略:IlluminaHiSeq,PE150;測序深度:20-30Mreads。信息分析:基于全基因組范圍的羥甲基化分析,數據質控,Peak鋒Calling,Peak鋒在基因組、染色體、功能元件上的分布,多樣本羥甲基化差異聚類,差異羥甲基化DMR鑒定及相關基因的功能分析,結合項目背景和科學問題的數據亮點挖掘。重慶850K芯片DNA甲基化經驗豐富

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