industryTemplateFFPE樣本只需要室溫運輸。重慶WGBS技術服務歡迎咨詢
Chip-Seq 是指通過染色質免疫共沉淀技術（ChIP）特異性地富集目的蛋白結合的DN**段，并對其進行純化和文庫構建；然后對富集得到的DN**段進行高通量測序，通過將獲得的數百萬條序列標簽精確定位到基因組上，從而獲得全基因組范圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的 DNA 區段信息，是目前在全基因組水平研究蛋白結合靶DNA序列的重要手段，為轉錄因子、組蛋白修飾、核小體定位等表觀遺傳學的研究提供有效方法。
應用領域
1、確定組蛋白修飾的位置及其與基因表達的關系。
2、完成對轉錄因子及其它蛋白在基因組上結合位點的精細定位。
3、研究特定的核小體或組蛋白的分布。 四川ATAC技術服務專業服務焦磷酸測序技術是甲基化檢測新的金標準。
甲基化敏感性高分辨率熔解曲線分析(MS-HRM)
通過熔解曲線分析可以將單堿基序列的差異轉變成熔解曲線的差異，因此DNA樣本經過亞硫酸氫鹽處理后，甲基化與未甲基化DNA會存在序列差異，這種差異可通過熔解曲線分析來發現。使用該方法進行甲基化分析*需一對引物，相對簡單，不過這種方法對儀器的要求頗高，需要帶HRM模塊的熒光定量PCR儀，并且在進行實時定量PCR過程中，需要使用飽和的熒光染料。利用MS-HRM技術進行甲基化檢測只能對檢測片段整體甲基化情況進行分析，并不能明確每個CpG位點的甲基化狀態。因此這種技術適用于大量樣本的檢測，篩選出感興趣的CPG位點，然后利用其他方法進行單個位點的精確檢測及甲基化程度的精確定量。
DNA甲基化（DNAmethylation）是指在DNA甲基化轉移酶（DNMT）催化下，以S-腺苷甲硫氨酸為甲基供體，將活性甲基轉移至DNA鏈中特定堿基上的化學修飾過程。哺乳動物基因組中，DNA甲基化多發生在CpG二核苷酸中的胞嘧啶的5位碳原子。DNA甲基化是一種表觀（epigenetic）修飾，它在不改變DNA序列的情況下，對個體的生長、發育、基因表達模式以及基因組的穩定性起到重要的調控作用，這種修飾是可逆的，并且這種修飾在發育和細胞增殖的過程中是可以穩定傳遞的。近年來的大量研究表明，DNA異常甲基化與**的發生、發展、細胞*變有著密切的聯系。DNA甲基化在**中的作用主要表現在以下幾個方面：一是甲基化的CpG島二核苷酸中的胞嘧啶以較高的頻率脫氨基變成胸腺嘧啶，造成堿基突變；二是抑*基因和DNA修復基因由于超甲基化而沉默；三是*基因甲基化水平降低而活化；四是基因組總體甲基化水平降低使轉座子、重復序列活化導致染色體穩定性下降。這些因素是導致**發展、轉移、惡化**終導致患者死亡的重要原因。其中后三個方面源于甲基化水平的改變，而甲基化的過程是可逆的，因此可以甲基化位點為靶點，靶向用藥進行**的預防、***。 WGBS用于人、哺乳動物及農林牧漁方向的高水平甲基化研究。
甲基化是表觀修飾的重要部分，DNA甲基化可以引起DNA構象、穩定性及DNA與蛋白質相互作用方式的改變，從而影響基因表達。DNA鏈中含有很多CpG結構，雙鏈DNACpG中的胞嘧啶五位碳原子通常容易被甲基化，基因組中60~90%的CpG都被甲基化，未甲基化的CpG成簇出現在基因啟動子**序列或者轉錄起始位點。DNA甲基化轉移酶可以催化CpG的甲基化反應。DNA甲基化轉移酶有兩種，Dnmt1是一種持續性甲基化轉移酶，作用于只有一條鏈甲基化的DNA雙鏈，使其完全甲基化，參與DNA復制過程中新合成鏈的甲基化修飾；Dnmt3a/Dnmt3b是一種從頭甲基化轉移酶，可以在CpG上產生新的甲基化修飾，首先半甲基化，繼而全甲基化，該甲基化轉移酶可能參與細胞生長分化的調控，在**基因甲基化中起到重要作用。近年來CRISPR/Cas9技術得到快速發展，在基因切割活性失活的dCas9的5’端融合一個Dnmt3a，能夠通過dCas9介導特定位點的甲基化修飾，調控相關基因的表達。 RRBS用于人、哺乳動物及魚類方向的高水平甲基化研究。江蘇焦磷酸測序技術服務活動
甲基化驗證是甲基化研究必不可少的一環。重慶WGBS技術服務歡迎咨詢
全基因組甲基化測序（WholeGenomeBisulfiteSequencing,WGBS）是將重亞硫酸鹽Bisulfite處理和高通量測序技術相結合，對有參考基因組進行全基因組范圍的單堿基分辨率的甲基化測序，是DNA甲基化檢測的“金標準”。WGBS滿足全基因組DNA甲基化圖譜及疾病關聯分析、基因調控分析、疾病的甲基化標志物篩選等探索性課題的研究。技術優勢DNA甲基化檢測**有力的工具單堿基分辨率，檢測每個C堿基的甲基化狀態全基因組范圍，**限度地獲得甲基化信息適合所有有參考基因組的物種適合各種類型的樣本樣本要求：基因組DNA:>=3ug；樣品濃度>30ng/ul；無RNA和蛋白污染建庫測序：測序策略：IlluminaHiSeq,PE150；測序深度：>=30X信息分析基于全基因組范圍的甲基化分析，數據質控，5mCCalling，5mC在基因組、染色體、功能元件上的分布，多樣本甲基化差異聚類，差異甲基化DMR鑒定及相關基因的功能分析，結合項目背景和科學問題的數據亮點挖掘。 重慶WGBS技術服務歡迎咨詢