相對于細菌對非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的發病機制的調節作用，細菌代謝物可能是其驅動力。丁酸鹽是一種短鏈脂肪酸，由腸道內各種細菌分解纖維產生。它增加了腸屏障的完整性，減少了通過腸膜的脂多糖的數量。小鼠實驗中顯示，丁酸鹽的減少和通過腸膜的脂多糖量的增加導致NAFLD和胰島素抵抗[5]。一項人類中的研究也表明，與健康對照組相比，NAFLD患者的腸道通透性明顯增加，且與肝臟中更多的脂肪含量相關[6]。因此，將腸道微生物組納入NAFLD改善，以及其他與之相關的代謝性疾病，如肥胖、糖尿病和心血管疾病等，將有助于為這類疾病開發新的預防策略和精確的改善靶點。Craven等人進行了一項隨機雙盲對照研究，發現在21名非酒精性脂肪性肝病患者（NAFLD）中，移植健康供體的菌群相對于自體移植患者可明顯改善小腸通透性。菌群移植在GVHD中的應用現狀--上海沃本。河北自閉癥使用菌群移植適用人群

臨床研究發現，酒精性肝炎患者的糞便菌群可反映疾病嚴重程度，炎癥程度更高的患者Akk菌屬豐度較低、韋榮球菌屬豐度較高[2]。酒精灌胃野生型小鼠可很好降低Akk菌豐度，口服Akk菌可恢復酒精誘導的Akk菌損耗，且Akk菌可改善性改善酒精性肝病（ALD）患者的肝損傷和中性粒細胞浸潤[3]。Philips等人進行了一項回顧性隊列研究，將FMT與三個對照組(類固醇、營養支持或戊氧基林)改善重度酒精性肝炎進行了比較，但發現90天生存率的主要預后無很好改善(p=0.179)江蘇醫院菌群移植臨床應用菌群移植--潰瘍性結腸炎患者的福音。

在一項開放標簽單組初步研究中[4]，13名患者（18-75歲之間）異基因造血細胞植入后進行FMT，FMT的中位時間為27天（19-45天），FMT耐受良好，幸存者的中位隨訪時間為15個月(13-20個月)。Kaplan-Meier估計FMT術后12個月總生存率和無進展生存率分別為85%和85%。糞便成分和尿液中3-吲哚酚硫酸酯濃度的分析表明，FMT后腸道微生物群落多樣性改善。FMT對兩個德國三級臨床中心異(n = 11例)基因hct患者sr-GvHD的結果報道顯示[8]，FMT后，沒有觀察到干預相關的全身炎癥反應，只有輕微的副作用，排便頻率和容積降低，并且在sr-GvHD分級和分期上均出現明顯的衰減。此外，患者的腸道菌群α多樣性的增加以及組成向供體轉移。

2018年菌群移植寫入由中華醫學會消化病學分會炎癥性腸病學組撰寫的《炎癥性腸病診斷與診療的共識意見》，提示近期技術菌群移植在IBD診療中具有較好的效果[2]。《2020澳大利亞共識：糞菌移植在臨床實踐中的管理、制備和應用》發表在Gut上，24位澳大利亞**就FMT的臨床實踐達成了27項共識，同時，該份共識是較早認可FMT在誘導潰瘍性結腸炎緩解中的有效性的共識性聲明[3]。2020年中華胃腸外科雜志上發表的《菌群移植標準化方法學的建立與臨床應用中國**共識》中肯定了菌群移植在潰瘍性結腸炎中的應用。菌群移植--潰瘍性結腸炎患者的福音--上海沃本。

糞便微生物菌群移植也為探索腸道菌群在疾病發展中的作用提供了直接的證據。在這些研究中，人們通常將健康個體和患病個體的糞便微生物菌群移植到無菌嚙齒動物體內，然后分析受體動物的病理生理學變化。在接受糞便移植后，大多數受體動物會出現疾病表型，但是一些研究中使用少量的患者供體，然后通過將這些供體細菌在大量受體小鼠中復制以得出陽性結論。此外，人類腸道菌群中有相當大比例的菌群無法在受體動物中定殖，這表明受體嚙齒動物可能不存在能促使人的腸道微生物菌群生長的因子。因此，人類疾病引起的改變是復雜的，很難在嚙齒動物身上完全復制。菌群移植相關的**共識解讀--上海沃本。湖南醫院菌群移植耗材

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2016年 成功地將FMT應用于腸內急性GVHD中[4]，(類固醇抵抗，n=3；類固醇依賴，n=1)。發現接受FMT后，3例達到完全緩解，1例達到部分緩解。2018年蘇州大學附屬醫院團隊發表了一項前導性研究，將菌群移植用于胃腸道急性移植物抗宿主病中[5]。該研究共納入8名類固醇難治性GI-GvHD患者,FMT后所有患者的臨床癥狀均得到改善，腸道菌群的多樣性及組成恢復正常，且無進展生存期延長。2020年8月《ScienceTranslationalMedicine》納入15名接受allo-HCT并發生腸道GvHD的患者[6]，接受健康供體的單次菌群移植；在10名患者中，接受菌群移植1個月內可觀察到完全的臨床應答。且無需其它干預以緩解GvHD癥狀，其中6名可逐漸減少免疫抑制劑的使用；持續的GvHD緩解與患者的生存率提高相關。河北自閉癥使用菌群移植適用人群

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