高通量測序技術具有的作用:高通量測序技術在冠狀病毒的鑒定中發揮了重要作用,先通過該技術確認了該病原為以前未知的β冠狀病毒,其次確認了該病毒與蝙蝠相關冠狀病毒ZC45和ZXC21密切相關,同源性約為88%,后高通量測序為后續的診斷提供了強有力的技術支撐。高通量測序能否定向檢測細菌病毒等微生物?例如某人有皮膚病,提取組織,能否通過高通量測序來檢測后列出所有的致病菌。或者當懷疑的時候,在人體組織中檢測是否有某種特定的細菌或者病毒。(不求原理),就是想知道現在的測序技術能否替代傳統臨床檢驗方法。相比傳統培養等方法,對樣本的全微生物檢測,或者特定微生物檢測,基因測序技術目前的時間消耗,準確率,和金錢成本大概如何。可以定向檢測,用特異引物就可以。病毒全基因組測序是針對疑難報告,由**進行深度解析。DNA二代測序分析上哪找
病毒基因組測序:病毒基因組測序包括完成圖測序、掃描圖測序和重測序三個層面,通過二代/三代測序平臺,獲得病毒的基因組的序列信息,并在結構基因組學、比較基因組學層面通過差異分析、同源基因分析、共線性分析、物種進化分析等手段探究病毒的毒力系統、基因組的進化與演變歷程等。對疑似傳染標本采集提取后直接進行高通量測序,通過病原微生物專門用的數據庫比對和智能化算法分析,獲得疑似致病微生物種屬信息,并提供全方面深入的報告,為疑難危重傳染提供快速準確診斷依據,促進藥物的合理應用。國內病毒全基因組測序技術深度測序技術促進了基因檢測的普及。
人類的病毒性傳染很普遍,病毒可以通過呼吸道、消化道、皮膚等多種途徑進行傳播,常常會導致嚴重的公共健康問題,對人類的健康造成威脅。傳統的病毒檢測方法主要依賴于細胞培養法、抗原抗體結合法等,這些方法耗時久,靈敏度低,往往不能夠滿足臨床檢測需求。隨著分子生物學的發展,PCR方法用于病毒檢測的案例越來越多,但該方法的特異性限制了其同時檢測其它病毒的能力。因此,需要通過新的技術來實現。隨著二代測序技術成本的降低與普及,二代測序在臨床病原體檢測方面的優勢也越加突顯。該技術基于二代測序平臺,可以直接從樣本中獲得病原體的核酸序列信息,再通過生物信息學的方法對得到的序列進行分析,可以快速地對樣本中可能存在的全部病原體進行鑒定,縮短了臨床檢測的周期。
深度測序技術對科學研究范式相關影響:個性化醫學、P4醫學和準確醫學等研究范式都是在近幾年深度測序技術迅猛發展的基礎上提出的。個人基因組測定的可行性,使得大眾有可能測定和分析自己的基因組、尋找到個人健康相關的基因風險因素,從而可以在生活習慣、飲食等方面提早進行個性化預測和預防。由于互聯網的發展和即時檢驗技術(point-of-care-testing,POCT)的應用,人們可以通過網絡進行交流和參與到整個診療過程,這便是P4醫學的概念:預測性(predictive)、預防性(preventive)、個性化(personalized)及參與性(participatory)。DNA病毒基因組測序:一種指定DNA病毒盡量完整的序列。
能實現對病毒的全基因組進行測序的技術手段:早期在高通量測序技術普及之前,對病毒的全基因組進行測序是通過非特異性擴增+克隆結合sanger測序來完成的。當物種有了參考的序列之后,可以通過特異性擴增+sanger測序獲得全基因組序列。Sanger測序準確度高,讀長很長,但與此同時,擴增和克隆工作費時費力,由于流程繁瑣,加上快速變異導致引物無法通用,該方法對于大量基因組的測序工作而言,可操作性不強,這對于研究者一直是一個困擾。高通量測序技術正式啟用之后,研究者可以將樣品處理至標準濃度和體積后進行測序和分析,減少了工作量,增加了成功率。探普生物進行了大量有針對性的研發和測試,開發了全套的實驗和分析流程用于對病毒的全基因組進行測序,該流程自運行以來廣受研究者們好評。測序覆蓋度是反映測序隨機性的指標之一。國內病毒全基因組測序突變分析原理
在探普生物進行病毒基因組測序是比較簡單的。DNA二代測序分析上哪找
病毒是由一種核酸分子(DNA或RNA)與蛋白質(Protein)構成或只由蛋白質構成(如朊病毒)。根據遺傳物質的組成,可分為單鏈DNA病毒(ssDNA)、雙鏈DNA病毒(dsDNA)、單鏈RNA病毒(ssRNA)、雙鏈RNA病毒(dsRNA)和蛋白質病毒(如朊病毒)。根據宿主類型的不同,可以分為噬菌體(細菌病毒)、植物病毒(煙花葉病毒)和動物病毒(如禽流感病毒、天花病毒和HIV等)。病毒全基因組測序(VirusWholeGenomeSequencing,VWGS),是指基于第二代高通量測序技術,對病毒全基因組進行測序,利用生物信息分析手段,得到病毒的全基因組序列,解析編碼信息,并獲得相應的變異信息。DNA二代測序分析上哪找
上海探普生物科技有限公司是一家從事生物科技專業領域內技術開發、技術轉讓、技術咨詢、技術服務,化工原料及產品(除危險化學品、監控化學品、煙花爆竹、易制毒化學品),實驗室設備,計算機、軟件及輔助設備,電子產品銷售,計算機軟件開發及維護,計算機信息系統集成服務等。的公司,是一家集研發、設計、生產和銷售為一體的專業化公司。公司自創立以來,投身于病毒測序,病毒全基因組測序,病毒宏基因組測序,未知病原鑒定,是醫藥健康的主力軍。上海探普生物繼續堅定不移地走高質量發展道路,既要實現基本面穩定增長,又要聚焦關鍵領域,實現轉型再突破。上海探普生物始終關注醫藥健康市場,以敏銳的市場洞察力,實現與客戶的成長共贏。