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來源: 發布時間:2022-07-31

聚合酶鏈反應注意事項:在實驗過程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在總RNA的提取過程中,注意避免mRNA的斷裂;為了防止非特異性擴增,必須設陰性對照;內參的設定:主要為了用于靶RNA的定量。常用的內參有G3PD(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)、β-Actin(β-肌動蛋白)等。其目的在于避免RNA定量誤差、加樣誤差以及各PCR反應體系中擴增效率不均一各孔間的溫度差等所造成的誤差;PCR不能進入平臺期,出現平臺效應與所擴增的目的基因的長度、序列、二級結構以及目標DNA起始的數量有關。故對于每一個目標序列出現平臺效應的循環數,均應通過單獨實驗來確定;防止DNA的污染: 采用DNA酶處理RNA; 在可能的情況下,將PCR引物置于基因的不同外顯子,以消除基因和mRNA的共線性。聚合酶鏈反應是一種非常強大和實用的研究工具。淮安骨頭Real-time PCR

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聚合酶鏈式反應:Taq(水生棲熱菌)聚合酶耐熱DNA聚合酶的很好活性溫度約為75-80°C(167-176°F),盡管該酶通常使用72°C(162°F)的溫度。在該步驟中,DNA聚合酶通過從反應混合物中添加在5’-至-3’方向上與模板互補的游離DNA鏈來合成與DNA模板鏈互補的新DNA鏈,在新生(伸長)DNA鏈的末端,將dNTPs的5'-磷酸基與3'-羥基縮合。延伸所需的精確時間取決于所使用的DNA聚合酶和要擴增的DNA目標區域的長度。根據經驗,在很好溫度下,大多數DNA聚合酶每分鐘聚合一千個堿基。在很好條件下(即,如果沒有限制底物或試劑的限制),在每個延伸/延伸步驟中,DNA靶序列的數量加倍。隨著每一個連續的循環,原始模板鏈加上所有新產生的鏈成為下一輪延伸的模板鏈,導致特定DNA目標區域的指數(幾何)擴增。淮安骨頭Real-time PCR許多疾病的未知病因的測序正在通過聚合酶鏈反應得到解決。

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聚合酶鏈式反應準備:PCR所用的酶主要有兩種來源:Taq和Pfu,分別來自兩種不同的噬熱菌。其中Taq擴增效率高但易發生錯配。Pfu擴增效率弱但有糾錯功能。所以實際使用時根據需要必須做不同的選擇。模板即擴增用的DNA,可以是任何來源,但有兩個原則,純度必須較高,第二濃度不能太高以免抑制。緩沖液的成分很為復雜,除水外一般包括四個有效成分:緩沖體系,一般使用HEPES或MOPS緩沖體系;一價陽離子,一般采用鉀離子,但在特殊情況下也可使用銨根離子;二價陽離子,即鎂離子,根據反應體系確定,除特殊情況外不需調整;輔助成分,常見的有DMSO、甘油等,主要用來保持酶的活性和幫助DNA解除纏繞結構。

聚合酶鏈式反應的常見問題:出現非特異性擴增帶:PCR擴增后出現的條帶與預計的大小不一致,或大或小,或者同時出現特異性擴增帶 與非特異性擴增帶。非特異性條帶的出現,其原因:一是引物與靶序列不完全互補、或引物聚合形成二聚體。二是Mg2+離子濃度過高、退火溫度過低,及PCR循環次數過多有關。其次是酶的質和量,往往一些來源的酶易出現非特異條帶而另一來源的酶則不出現,酶量過多有時也會出現非特異性擴增。其對策有:必要時重新設計引 物。減低酶量或調換另一來源的酶。降低引物量,適當增加模板量,減少循環次數。適當提高退火溫度或采用二溫度點法(93℃變性,65℃左右退火與延伸)。聚合酶鏈式反應的特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。

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聚合酶鏈式反應:定量PCR允許實時定量和檢測特定的DNA序列,因為它在合成過程中測量濃度。有兩種方法可以同時檢測和定量。種方法是使用在DNA雙鏈之間非特異性保留的熒光染料。第二種方法涉及編碼特定序列并被熒光標記的探針。只有在探針與其互補DNA雜交后,才能使用這些方法檢測DNA。一種有趣的技術組合是實時PCR和逆轉錄。這種復雜的技術被稱為RT-qPCR,允許定量少量RNA。通過這種組合技術,mRNA被轉化為cDNA,并用qPCR進一步定量。這種技術降低了聚合酶鏈反應終點出錯的可能性,增加了檢測與遺傳疾病如病癥相關的基因的機會。實驗室使用RT-qPCR來靈敏地測量基因調控。聚合酶鏈式反應準備:引物內部不應出現互補序列。寧波組織PCR檢測技術原理

逆轉錄聚合酶鏈反應(逆轉錄-聚合酶鏈反應):用于從RNA中擴增DNA。淮安骨頭Real-time PCR

聚合酶鏈式反應:模板的制備,PCR的模板可以是DNA,也可以是RNA。模板的取材主要依據PCR的擴增對象,可以是病原體標本如病毒、細菌、菌類等。也可以是病理生理標本如細胞、血液、羊水細胞等。法醫學標本有血斑、精斑、毛發等。標本處理的基本要求是除去雜質,并部分純化標本中的核酸。多數樣品需要經過SDS和蛋白酶K處理。難以破碎的細菌,可用溶菌酶加EDTA處理。所得到的粗制DNA,經酚、氯仿抽提純化,再用乙醇沉淀后用作PCR反應模板。淮安骨頭Real-time PCR

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