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長寧區嘉安健達二代測序分析

來源: 發布時間:2024-12-12

二代測序——技術原理類問題

二代測序與一代測序的區別是什么:一代測序技術如Sanger測序,一次只能讀取一條DNA序列,通量低、速度慢、成本高,但準確性高,適用于對少量基因片段的精確測序。而二代測序技術具有高通量、速度快、成本低等優點,可以同時對大量DNA分子進行測序,但在單個堿基的準確性上稍低于一代測序,二者在不同的應用場景中各有優勢。二代測序有哪些主要的測序原理:主要包括邊合成邊測序和連接法測序。邊合成邊測序是在DNA聚合酶的作用下,逐個添加帶有熒光標記的dNTP,通過檢測釋放的熒光信號來確定堿基序列;連接法測序則是利用DNA連接酶將寡核苷酸探針連接到模板DNA上,根據連接的探針序列來推斷模板DNA的堿基組成。 高通量測序是二代測序嗎?長寧區嘉安健達二代測序分析

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什么樣本可以做二代測序?②

組織樣本

新鮮組織:如手術切除的**組織、活檢組織等。新鮮組織樣本中的細胞完整性較好,能夠提供高質量的DNA和RNA。在**研究中,對新鮮**組織進行全基因組測序、轉錄組測序等,可以深入了解**的基因突變、基因表達變化等情況。例如,在研究結直腸*的發病機制時,對手術切除的結直腸*組織及其*旁組織進行測序,比較兩者之間的差異,以發現**相關的基因變異和表達調控異常。

福爾馬林固定石蠟包埋(FFPE)組織:這是臨床上常用的保存組織樣本的方式。FFPE組織中的DNA和RNA會有一定程度的損傷和降解,但經過適當的提取和修復處理后,仍然可以用于二代測序。在回顧性研究中,大量的FFPE組織存檔樣本可以被利用起來。例如,對多年前保存的乳腺*FFPE組織進行測序,研究乳腺*的疾病進展和***反應相關的基因變化。 長寧區嘉安健達二代測序分析二代測序包括全基因組測序和全外顯子測序。

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②二代測序一般多久出結果?

2、測序平臺和通量

不同的二代測序平臺有不同的通量(一次能測序的樣本數量和數據量)和測序速度。一些高通量的測序平臺,如IlluminaNovaSeq系列,能夠在較短時間內產生大量的數據。但如果使用的是通量較低的小型測序儀,或者測序儀的運行時間被多個項目分配,都會影響結果產出的時間。例如,在高通量平臺上進行全基因組測序,測序運行時間可能在2-7天左右,具體取決于測序深度等因素。而對于一些小型臺式測序儀進行靶向基因測序,運行時間可能在1-3天。

①二代測序一般多久出結果?

二代測序(Next-GenerationSequencing,NGS)出結果的時間會受到多種因素的影響,一般在數天到數周不等。

1、樣本類型和質量

不同的樣本類型處理時間不同。例如,血液樣本相對容易處理,提取DNA的過程比較常規。如果是組織樣本,可能需要先進行樣本的解離等復雜操作。如果樣本質量高,DNA提取和文庫構建等前期工作會比較順利,能加快整體進程。但如果樣本量少或者DNA有降解等質量問題,可能需要重新提取樣本或者進行DNA修復等操作,這會**延長時間。例如,對于新鮮血液樣本,DNA提取可能在1-2天內完成;而對于一些福爾馬林固定石蠟包埋(FFPE)組織樣本,可能需要3-5天來完成高質量DNA的提取和后續的優化處理。


二代測序即高通量測序技術。

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一代、二代、三代測序的技術原理和技術特點分別是什么?

技術原理:

一代—雙脫氧終止法

二代—橋式PCR+4色熒光可逆終止+激光掃描成像

三代—PacBio SMRT測序技術

技術特點:

一代—只能檢測序列一致的PCR產物;讀長可以較長,比如Sanger可以達到幾百bp;通量低,一次只能檢測少量的序列;成本低;

二代—可以并行測序;需要放大信號才能檢測;通量大,可以產生上G的reads;讀長較短,一-般是固定的,比如50、100、150、250等;成本較高

三代:可以并行測序;不需要放大信號,對單個分子進行測序;通量大,比如SequelII平臺,一張芯片可以有800萬個ZMW;讀長較長;測序精確度較差;成本高; 二代測序的優勢是高通量。北京嘉安健達二代測序原理

什么是二代測序技術?長寧區嘉安健達二代測序分析

一代、二代、三代測序的區別分別是什么?

一代測序是上世紀70年代由Sanger和Coulson開創的DNA雙脫氧鏈終止法測序,也稱為Sanger測序。

二代測序技術(NGS)是為了改進一代測序通量過低的問題而出現的,能夠同時對上百萬甚至數十億個DNA分子進行測序實現了大規模、高通量測序的目標。

三代測序主要有兩種技術PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore 的納米孔單分子測序技術,這兩種技術的測序讀長都可以達到幾-kb的級別,遠遠高于二代測序技術。 長寧區嘉安健達二代測序分析

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