上海翼和生物根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)規(guī)模,提供兩種檢測平臺,分別為:適合中低通量檢測的PCR-LDR分型服務(wù)和適合高通量的基于二代Hi-SNP分型服務(wù)。PCR-LDRSNP分型服務(wù):PCR-LDR技術(shù)是PCR技術(shù)和LDR(LigaseDetectionReaction,連接酶檢測反應(yīng))想結(jié)合的檢測技術(shù)。LDR是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對基因多態(tài)性位點(diǎn)的識別。高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類型的堿基錯配,則連接反應(yīng)就不能進(jìn)行,反之則可以進(jìn)行連接反應(yīng)。Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測序技術(shù),對需要檢測的位點(diǎn)設(shè)計特異性引物,在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分。混合樣本后,在illumina等主流測序平臺上,對擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測序。測序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法,區(qū)分不同的樣本,,終獲得每個位點(diǎn)的SNP信息。高通量測序能一次對幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定,相比其他的SNP檢測技術(shù),基于高通量測序的SNP分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點(diǎn)。組成DNA的堿基雖然有4種,但SNP一般只有兩種堿基組成。北京微衛(wèi)星SSRSNP分型質(zhì)量好
Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測序技術(shù),對需要檢測的位點(diǎn)設(shè)計特異性引物,在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分。混合樣本后,在IonProton/IonTorrent平臺上,對擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測序。測序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法,區(qū)分不同的樣本,,終獲得每個位點(diǎn)的SNP信息。高通量測序能一次對幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定,相比其他的SNP檢測技術(shù),基于高通量測序的SNP分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點(diǎn)。上海翼和生物提供snp分型服務(wù)。STR/SSR基因SNP分型外包服務(wù)SNP一般來說,是全部體細(xì)胞一樣的基因型(除開嵌合體)。
單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphism,SNP),主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。它是人類可遺傳的變異中,常見的一種。占所有已知多態(tài)性的90%以上。SNP在人類基因組中比較常見存在,平均每500~1000個堿基對中就有1個,估計其總數(shù)可達(dá)300萬個甚至更多。SNP所表現(xiàn)的多態(tài)性只涉及到單個堿基的變異,這種變異可由單個堿基的轉(zhuǎn)換(transition)或顛換(transversion)所引起,也可由堿基的插入或缺失所致。但通常所說的SNP并不包括后兩種情況。
連接酶檢測反應(yīng)(LigaseDetectionReaction,LDR)是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對基因多態(tài)性位點(diǎn)的識別,高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類型的堿基錯配,連接反應(yīng)就不能進(jìn)行。該方法,對SNP位點(diǎn)同時設(shè)計兩條有長度差異的探針,當(dāng)探針末端與模板有一個堿基不配對,所以連接反應(yīng)不能進(jìn)行,沒有連接產(chǎn)物;相反,若探針與模板DNA完全互補(bǔ),故進(jìn)行連接反應(yīng),通過溫控循環(huán),該特異性連接反應(yīng)可反復(fù)進(jìn)行,達(dá)到線性擴(kuò)增的效果。,后通過熒光掃描片段長度,實(shí)現(xiàn)對SNP位點(diǎn)的檢測。高分辨率熔解曲線分析(HRM)是近幾年興起的SNP研究工具。
為了評估在這些前體miRNA中的5個多態(tài)性位點(diǎn)與中國漢族人群個體中潛在的關(guān)聯(lián),作者采用了PCR-LDR的方法在287例心肌梗死病人和646個對照組樣本中檢測5個多態(tài)性位點(diǎn)的SNP分型。并用SPSS軟件分析了SNP位點(diǎn)與MI風(fēng)險的關(guān)聯(lián)性。(其中,PCR-LDR法SNP分型在上海翼和生物有限公司完成)。上海翼和**團(tuán)隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。SNP是人類可遺傳的變異中比較常見的一種。占所有已知多態(tài)性的90%以上。STR/SSR基因SNP分型外包服務(wù)
通常所說的SNP都是二等位多態(tài)性的。北京微衛(wèi)星SSRSNP分型質(zhì)量好
SNP位點(diǎn)信息:人類基因組需SNP位點(diǎn)的rs號;其它物種如牛、雞、魚、水稻、玉米等無rs號的,需SNP位點(diǎn)上下游各250bp的確切序列、SNP位點(diǎn)突變類型、以及位點(diǎn)上下游25bp內(nèi)是否存在其它位點(diǎn)。(二代測序SNP基因分型)送樣注意事項:1.此分型方法適用于15-500個位點(diǎn),樣本數(shù)目為數(shù)百至數(shù)千的高通量檢測;2.樣本寄送前請與本公司工作人員取得聯(lián)系,確認(rèn)樣本寄送時間、方式、數(shù)量和收件人信息;3.請再三確認(rèn)盛放樣本的容器密封,可使用封口膜,不推薦錫箔紙、保鮮膜等密封方式;北京微衛(wèi)星SSRSNP分型質(zhì)量好
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是一家第三方檢測服務(wù);生物專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù);健康衰老評估;大健康檢測;遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù);生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測技術(shù)技術(shù)服務(wù);小鼠遺傳品系鑒定;轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定;細(xì)胞點(diǎn)突變檢測;細(xì)胞端粒長度和端粒酶活性檢測。的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實(shí)、誠實(shí)可信的企業(yè)。公司自創(chuàng)立以來,投身于細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務(wù),是醫(yī)藥健康的主力軍。翼和生物不斷開拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺,以應(yīng)用為重點(diǎn),以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價值,提供更優(yōu)服務(wù)。翼和生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場,以敏銳的市場洞察力,實(shí)現(xiàn)與客戶的成長共贏。