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廣東SNP分型公司

來源: 發布時間:2021-11-03

上海翼和應用生物技術有限公司是一具有16年行業經驗的專業遺傳學服務供應商。公司的首席科學家為肖君華教授(東華大學生物科學與技術研究所教授;中國遺傳學會理事;上海市遺傳學會常務理事)。公司擁有兩大專業平臺:基于一代測序儀3730XL的PCR-LDRSNP分型平臺;基于多重PCR捕獲建庫技術的二代測序平臺。為順應市場需求,公司在2019年開拓了個人基因檢測業務。目前已開展心血管個體化用藥相關基因的檢測,孕婦葉酸及鈣代謝兩項基因檢測業務。兩項基因檢測均基于翼和一代測序平臺的PCR-LDRSNP基因分型方法。SNPs是英文Single nucleotide polymorphisms的縮寫。廣東SNP分型公司

二代測序法主要通過PCR的方法,對目標SNP位點進行特異性捕獲。為了提型的通量,目前多采用多重PCR的方法同時對多個位點進行捕獲(可同時對1-100位點進行分型)。由于二代測序通量是足夠滿足數百數千樣本的同時測序,因此需要對不同的樣本添加的樣本標簽(Barcode),從而在后續數據分析過程中,能夠進行樣本拆分。因此在多重PCR完成輪多SNP位點捕獲后,需要進行第二輪PCR,在輪PCR產物的基礎上,添加樣本樣本標簽及測序接頭等序列。通過PCR條件優化,目前亦可實現一次反應,兩輪PCR接力完成的效果。杭州SNP分型哪里好多態性是一個群體概念,多態性指這個差異占群體的1%以上。否則就叫突變(小于1%)。

3.HRM法高分辨率熔解曲線分析(HRM)是近幾年興起的SNP研究工具,它通過實時監測升溫過程中雙鏈DNA熒光染料與PCR擴增產物的結合情況,來判斷是否存在SNP,而且不同SNP位點、是否是雜合子等都會影響熔解曲線的峰形,因此HRM分析能夠有效區分不同SNP位點與不同基因型。這種檢測方法不受突變堿基位點與類型的局限,無需序列特異性探針,在PCR結束后直接運行高分辨率熔解,即可完成對樣品基因型的分析。該方法無需設計探針,操作簡便、快速,成本低,結果準確,并且實現了真正的閉管操作。

目前市場上有多個廠家提供HRM分析的儀器,包括IdahoTechnology、Corbett(QIAGEN)、Roche等,有些是HRM的儀器,有些則是附帶HRM功能的定量PCR儀。HRM的發明者—美國猶他大學醫學院的Wittwer實驗室曾評估了市場上多臺儀器在基因分型和突變掃描上的性能1。他們發現,對于大部分儀器的準確基因分型來說,主要限制在于平板上的空間溫度差異(Tm的標準偏差為0.020-0.264°C)。其它差異如數據密度、信噪比和熔解速率,也會影響雜合體的掃描。經過比較發現,空氣加熱型儀器以及樣品溫度單獨控制的儀器有著更低的Tm標準偏差(0.018-0.065),而加熱塊型儀器則在0.092-0.274。在經濟作物育種領域,檢測SNP可實現對所需性狀的早期選擇。

從對生物的遺傳性狀的影響上來看,cSNP又可分為2種:一種是同義cSNP(synonymouscSNP),即SNP所致的編碼序列的改變并不影響其所翻譯的蛋白質的氨基酸序列,突變堿基與未突變堿基的含義相同;另一種是非同義cSNP(non-synonymouscSNP),指堿基序列的改變可使以其為藍本翻譯的蛋白質序列發生改變,從而影響了蛋白質的功能。這種改變常是導致生物性狀改變的直接原因。cSNP中約有一半為非同義cSNP。上海翼和**團隊富有開創精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領下,秉承“專業、協作、進取”的企業精神,為科研用戶提供性價比高、可靠的遺傳學技術服務和產品。SNP一般來說,是全部體細胞一樣的基因型(除開嵌合體)。廣州基因SNP分型準確度高

通常所說的SNP都是二等位多態性的。廣東SNP分型公司

高分辨率熔解(High-resolutionmelting,簡稱HRM)分析是一門新興的技術。它通過PCR之后的熔解曲線分析,就能檢測PCR片段的微小序列差異,從而應用在突變掃描、序列配對和基因分型等多個方面。憑借其速度和簡便性,高分辨率熔解這種方法正在迅速普及。其實雙鏈DNA的熔解分析可追溯到上世紀六十年代,當時是通過紫外吸收來監測的。分析需要幾微克的DNA,而樣品以0.1-1.0°C/分鐘的速率緩慢加熱,常常要花上幾個小時才能完成。后來,LightCycler定量PCR儀的出現,讓熒光熔解分析變得流行。樣品量因毛細管而縮減至納克級,且熔解速率更快,達0.1-1.0°C/秒,這樣熔解時間縮短至幾分鐘。當時使用的染料是SYBR?GreenI。廣東SNP分型公司

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