亞硫酸氫鈉轉化是分析胞嘧啶甲基化效果比較好的工具之一。該方法基于亞硫酸氫鈉對 DNA 的處理，確定其甲基化模式。重亞硫酸鹽測序本質上就是重亞硫酸鹽轉化與二代測序（NGS）的結合。甲基化的金標準是亞硫酸氫鹽測序法：用亞硫酸氫鹽處理DNA，未發生甲基化的胞嘧啶能夠被轉化為尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶則保持不變，通過后續的測序即可檢測。利用亞硫酸氫鹽的這種原理，可以衍生出多種甲基化檢測方法，如甲基化特異性的PCR和高分辨率熔解曲線法。DNA甲基化可引起基因組中相應區域染色質結構變化,使DNA失去核酶限制性內切酶的切割位點,。江蘇全基因組甲基化重測序報告

在表觀遺傳中，DNA甲基化修飾具有非常重要的地位。其中胞嘧啶雜環5號位的甲基化修飾，又稱作5-甲基胞嘧啶（5mC），是**常見的甲基化修飾方式，也是迄今為止研究**為普遍的DNA甲基化修飾方式。一般認為當DNA甲基化出現在基因啟動子區，就會抑制基因轉錄，從而起到負調控的作用。DNA甲基化的形成機制，包括從頭合成（de novo），甲基化的維持（Maintenance）和去甲基化（Demethylation），這些過程分別由不同的基因和通路調控。這些基因和通路在動植物中即保守，又有所區別。上海多重PCR技術甲基化重測序哪里做重亞硫酸鹽測序可以從單個堿基水平分析基因組中甲基化的胞嘧啶。

DNA甲基化是在DNA甲基化轉移酶(Dnmt)的作用下將甲基選擇性地添加到胞嘧啶上形成5-胞嘧啶的過程，剛被發現時被定義為第五種堿基，實際上它是一種重要的表觀遺傳學標記，在調控基因表達、維持染色質結構、基因印記、X染色體失活以及胚胎發育等生物學過程中發揮著重大的作用，獲得全基因組范圍內所有C位點的甲基化水平數據，對表觀遺傳學的時空特異性研究具有重要意義，Bisulfite甲基化測序是以新一代高通量測序平臺為基礎，結合全基因組Bisulfite處理和生物信息數據分析技術，進行低成本、高效率、高準確度的全基因組DNA甲基化水平圖譜繪制。

目標區域甲基化重測序（Hi-MethylSeq），又叫重亞硫酸鹽擴增子測序（Bisulfite Amplicon Sequencing， BSAS）。在前期全基因組甲基化測序、全基因組甲基化芯片等工作基礎上，或者依據文獻報道目的基因甲基化與性狀/疾病關聯，選擇感興趣的目的區間或候選基因，利用Hi-MethylSeq技術對大規模群體的候選基因甲基化水平進行檢測。Hi-MethylSeq技術通過亞硫酸氫鹽（bisulfite）處理，用多重PCR擴增目的片段，添加barcode和測序通用接頭，在Illumina X10二代測序平臺對PCR產物進行高通量測序，利用生物信息學方法，精確定量計算目標區間內的甲基化位點的甲基化狀態，在完成目標區域檢測的同時大幅降低研究費用。將序列與未經處理的序列進行比較，判斷CpG位點是否發生甲基化。

物種的DNA甲基化率通常與物種基因組大小成正比。從細菌的數千個基因進化到高等動物的數萬個基因，基因數增長的一個數量級。要管好這么多的基因，在漫長的一生中有規律地關閉或打開基因表達，DNA甲基化這個開關對高等動植物必不可少。轉座子是一類在基因組上可以自主復制（或剪切）和移動的**功能元件。如果它們隨意移動，對基因組的穩定性具有破壞作用。DNA甲基化對轉座子的移動具有抑制作用。通常，物種的基因組越大，其基因組中轉座子的比例越高，那么限制轉座子移動的門神——DNA甲基化的比例就越高。DNA甲基化屬于表觀遺傳的范疇。天津甲基化重測序報告

DNA甲基化幾乎只存在于CpG二核苷酸上，是一個關鍵的表觀遺傳標記和基因表達調控因子。江蘇全基因組甲基化重測序報告

亞硫酸氫鹽測序法用亞硫酸氫鈉對 DNA 進行化學處理會使甲基化特異性序列變異，從而可以通過NGS進行定位和量化，主要的DNA甲基化數據分析流程：獲得DNA甲基化數據之后，首先，需要對數據進行處理和質量的基本控制，包括原始測序和芯片數據的讀取、轉換到產生準確的DNA甲基化圖譜；其次，需要對DNA甲基化位點的結果進行可視化，并且利用統計學方法鑒定樣本特異性差異的DNA甲基化位點；第三，驗證 DNA 甲基化差異位點，并且對其進行生物學解釋。江蘇全基因組甲基化重測序報告

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