5甲基胞嘧啶 (5-methylcytosine, 5mC) 是一種常見的DNA修飾類型,能調節基因表達、轉座子及染色體的狀態等。全基因組重亞硫酸鹽轉化的WGBS法,能夠實現單堿基分辨率的甲基化位點準確、高效定位。通過***分析不同處理方式下的全基因組甲基化水平,快速準確鑒定出差異甲基化區域,有助于我們更加***深入地了解動、植物的甲基化模式和表觀調控機制,在動物行為、植物脅迫、植物性狀、胚胎發育、cancer疾病、生物標記物等方面具有普遍的應用。目標區域甲基化重測序(Hi-Methylseq)結合了亞硫酸鹽轉換、靶向擴增子高通量測序技術。安徽目標區間甲基化重測序哪個公司做
DNA甲基化是一種表觀遺傳修飾,它是由DNA甲基轉移酶(DNA methyl-transferase, DNMT)催化S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosylmethionine, SAM)作為甲基供體,將胞嘧啶轉變為5-甲基胞嘧啶(mC)的一種反應,在真核生物DNA中,5-甲基胞嘧啶是存在的化學性修飾堿基。CG二核苷酸是**主要的甲基化位點,它在基因組中呈不均勻分布,存在高甲基化、低甲基化和非甲基化的區域,在哺乳動物中mC約占C總量的2-7%。甲基化檢測服務-亞硫酸氫鈉處理后測序法 (bisulfite genomic sequencing PCR, BSP)是利用未甲基化的胞嘧啶可以被亞硫酸氫鈉發生脫氨基變為尿嘧啶的原理,用兩一特異性引物擴增后測序。測序法克服了只能針對單個位點檢測,并且這些位點必須是限制性內切酶識別位點的缺點,可以對任何基因序列的甲基化狀態進行檢測。上海CPG島甲基化重測序技術服務重亞硫酸鹽測序本質上就是重亞硫酸鹽轉化與二代測序(NGS)的結合。
DNA去甲基化分為兩類:主動去甲基化(Active DNA Demethylation)和被動去甲基化(Passive DNA Demethylation)。基因組甲基化模式的形成主要依賴于主動去甲基化,主要涉及一類具有DNA去甲基化功能的蛋白,可能存在的五種機制a. DNA轉葡糖基酶參與的堿基切除修復(base excision repair;BER):5-mC 由DNA 轉葡糖基酶直接去除。此途徑主要存在于植物體內,動物體內也可能存在。b.脫氨酶參與的堿基切除修復:5-mC 脫氨變成胸腺嘧啶T,形成G/T 錯配,進入BER 途徑。這一途徑主要存在于動物體中,植物體中也可能存在。c.核苷酸外切修復機制(nucleotide excision repair;NER):直接移除甲基化的CpG 二核苷酸。d.氧化去甲基化:發生氧化反應打開碳-碳鍵,直接去除甲基基團。e.水解去甲基化:水解胞嘧啶的甲基基團,使其以甲醇的形式被釋放。DNA被動去甲基化是指當DNMTs活性被抑制或濃度過低時,無法維持原有的甲基化狀態,使DNA甲基化程度降低的過程,這類去甲基化通常發生在細胞復制的兩個周期之間,涉及到某些可與DNMTs結合的因子,其結合后形成的復合物可以阻止DNMTs與DNA的結合。
DNA甲基化作為重要的表觀遺傳學調控機制在許多關鍵的生物學過程如發育及疾病的進展中扮演著重要的作用,相對于基于PCR、芯片等傳統檢測手段,全基因組亞硫酸氫鹽測序(Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS) 技術可通過將高效的亞硫酸氫鹽轉化與高通量測序文庫構建方法相結合 (Post-BS WGBS),可在單堿基的分辨率下對來自更多樣本基因組中的甲基化位點進行準確的分析,既可以覆蓋所有甲基化位點,還能夠配合靶向技術檢測低頻甲基化信號,已成為目前在業界受到普遍關注的一種主流方法。DNA甲基化在DNA復制起始、錯配修復以及轉座子的失活等過程中對維持遺傳信息的穩定性發揮著重要的作用。
DNA甲基化一般是指DNA復制后,在DNA甲基轉移酶的作用下,將S-腺甘酰甲硫氨酸分子上的甲基轉移到DNA分子中胞嘧啶殘基的第5位碳原子上,形成5-甲基胞嘧啶的過程,它是真核細胞生物基因組重要的修飾方式之一。DNA甲基化包括從頭甲基化和維持甲基化2種模式。從頭甲基化是指在從未發生甲基化的位點上發生甲基化修飾,建立DNA甲基化的過程;而維持甲基化是指維持甲基化的酶可識別新合成的半甲基化雙鏈DNA,并將甲基添加到新鏈的非甲基化胞嘧啶上。DNA 甲基化能關閉某些基因的活性,去甲基化則誘導了基因的重新活化和表達。南京目標甲基化重測序分析
在前期全基因組甲基化測序等工作基礎上,利用Hi-MethylSeq技術對大規模群體的候選基因甲基化水平進行檢測。安徽目標區間甲基化重測序哪個公司做
WGBS能為基因組DNA甲基化時空特異性修飾的研究提供重要技術支持,能廣泛應用在個體發育、衰老和疾病等生命過程的機制研究中,也是各物種甲基化圖譜研究的優先方法。常規全基因組甲基化測序技術通過T4-DNA連接酶,在超聲波打斷基因組DNA段的兩端連接接頭序列,連接產物通過重亞硫酸鹽處理將未甲基化修飾的胞嘧啶C轉變為尿嘧啶U,進而通過接頭序列介導的 PCR 技術將尿嘧啶U轉變為胸腺嘧啶T。上海翼和是上海市遺傳學會理事單位,上海市****,至今已有十六年的歷史。安徽目標區間甲基化重測序哪個公司做
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