DNA甲基化一直以來都是表觀遺傳學領域研究的重點之一。DNA甲基化(Methylation)是指在DNA甲基轉移酶(DNA methyltransferase, 縮寫DNMT)的作用下,基因組DNA序列上CpG島的二核苷酸5′端胞嘧啶轉變?yōu)?′甲基胞嘧啶(5′ methylcytosine, 縮寫5mC)。這種DNA修飾的方式并未改變基因的序列, 但能抑制某些基因的表達。在哺乳動物中,基因組DNA的甲基化可分為兩種類型:維持甲基化(maintenance DNA methylation)和重新甲基化(de novo methylation)。維持甲基化是指在甲基轉移酶的作用下,DNA的半保留復制過程中,會在子鏈的相應的位置進行甲基化修飾的過程。重新甲基化是指在甲基轉移酶的作用下,原來沒有甲基化的DNA雙鏈上,進行甲基化的過程,之后由維持甲基化酶來維持穩(wěn)定的DNA甲基化狀態(tài)。對于這兩種甲基化機制來說,有兩種對應類型的甲基化酶:維持甲基轉移酶和重新甲基轉移酶。DNA甲基化是在DNA甲基化轉移(DNMTs)的作用下使CpG二核苷酸5'端的胞嘧啶轉變?yōu)?'甲基胞嘧啶。河南目標區(qū)間甲基化重測序準確度高
DNA甲基化是指生物體在DNA甲基轉移酶(DNA methyltransferase,DMT) 的催化下,以s-腺苷甲硫氨酸(SAM)為甲基供體,將甲基轉移到特定的堿基上的過程。DNA甲基化能降低某些基因的表達活性,去甲基化則能引起基因的重新活化和表達。DNA甲基化能引起染色質的結構、DNA構象、DNA穩(wěn)定性及DNA與蛋白質之間的相互作用方式的改變,從而影響基因表達。研究證實,CpG二核苷酸中胞嘧啶的甲基化導致了人體1/3以上由于堿基變異而引起的遺傳性疾病。由于DNA甲基化與人體發(fā)育和tumour疾病的密切關系,特別是CpG島甲基化引起的抑cancer基因的轉錄失活,使得DNA甲基化成為表觀遺傳學和表觀基因組學的重要研究內容。成都全基因組甲基化重測序技術服務重亞硫酸鹽測序本質上就是重亞硫酸鹽轉化與二代測序(NGS)的結合。
WGBS(Whole Genome Bisulfite Sequence)全基因組甲基化測序,利用重亞硫酸氫鹽使DNA中未發(fā)生甲基化的胞嘧啶(C)脫氨基轉變成尿嘧啶(U),而甲基化的胞嘧啶保持不變,然后通過PCR將U變?yōu)锳,*有甲基化的C可以成功保留,***通過測序就可判斷CpG位點是否發(fā)生甲基化。特點是精確度高、重復性好,檢測范圍廣,可以覆蓋全基因組范圍內的每一個C堿基的甲基化狀態(tài);但需要的數(shù)據量比較大,成本較高。上海翼和生物是上海市遺傳學會理事單位,上海市****,至今已有16年的歷史。
DNA甲基化(DNA methylation)為DNA化學修飾的一種形式,能在不改變DNA序列的前提下,改變遺傳表觀。 DNA甲基化在維持細胞正常功能、傳遞基因組印記,胚胎發(fā)育、tumour發(fā)生等方面發(fā)揮重要作用,目前已經成為表觀遺傳學和表觀基因組學的研究熱點。DNA甲基化測序可在全基因組水平上比較大限度的、完整的獲取甲基化狀態(tài)信息和與基因表達調控的多重關系,可高效精確完成全基因組甲基化測序及*分辨DNA甲基化譜式繪制,并可對發(fā)現(xiàn)的靶點區(qū)進行甲基化特異性PCR驗證。WGBS的流程與全基因組DNA測序主要區(qū)別于DNA文庫的構建。
目標區(qū)域甲基化重測序(Hi-Methylseq)結合了亞硫酸鹽轉換、靶向擴增子高通量測序技術,可實現(xiàn)多區(qū)段、多位點的甲基化精確定量分析,特別適合隊列樣本目標區(qū)域的甲基化分析,測序深度高,結果更加準確。適用于感興趣目的片段甲基化研究;適用于在大樣本中進一步確認全基因組甲基化研究挑選的陽性位點(DMR)。農口上:表觀遺傳學研究、品種鑒定、品種改良;醫(yī)口上:tumour早期診斷、表觀遺傳學生物標志物開發(fā)、tumour復發(fā)的 預測因子。甲基化的金標準是亞硫酸氫鹽測序法.北京CPG島甲基化重測序哪里做
常規(guī)全基因組甲基化測序技術通過T4-DNA連接酶,在超聲波打斷基因組DNA段的兩端連接接頭序列。河南目標區(qū)間甲基化重測序準確度高
在表觀遺傳中,DNA甲基化修飾具有非常重要的地位。其中胞嘧啶雜環(huán)5號位的甲基化修飾,又稱作5-甲基胞嘧啶(5mC),是**常見的甲基化修飾方式,也是迄今為止研究**為普遍的DNA甲基化修飾方式。一般認為當DNA甲基化出現(xiàn)在基因啟動子區(qū),就會抑制基因轉錄,從而起到負調控的作用。DNA甲基化的形成機制,包括從頭合成(de novo),甲基化的維持(Maintenance)和去甲基化(Demethylation),這些過程分別由不同的基因和通路調控。這些基因和通路在動植物中即保守,又有所區(qū)別。河南目標區(qū)間甲基化重測序準確度高
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