5甲基胞嘧啶 (5-methylcytosine, 5mC) 是一種常見的DNA修飾類型，能調節基因表達、轉座子及染色體的狀態等。全基因組重亞硫酸鹽轉化的WGBS法，能夠實現單堿基分辨率的甲基化位點準確、高效定位。通過***分析不同處理方式下的全基因組甲基化水平，快速準確鑒定出差異甲基化區域，有助于我們更加***深入地了解動、植物的甲基化模式和表觀調控機制，在動物行為、植物脅迫、植物性狀、胚胎發育、cancer疾病、生物標記物等方面具有普遍的應用。DNA甲基化在DNA復制起始、錯配修復以及轉座子的失活等過程中對維持遺傳信息的穩定性發揮著重要的作用。安徽目標區段甲基化重測序機構

上海翼和生物甲基化測序采用的是重亞硫酸鹽擴增子測序法（Bisulfite Amplicon Sequencing， BSAS），重亞硫酸鹽轉化是研究DNA甲基化的金標方法，該技術基于非甲基化胞嘧啶（C）向尿嘧啶（U）的化學轉化，即用重亞硫酸鹽處理基因組DNA，非甲基化胞嘧啶被轉化為尿嘧啶，而甲基化胞嘧啶不發生這種轉化，從而能夠在單核苷酸水平上確定DNA甲基化（圖1）。轉化后的序列可以進行多種分析，包括重亞硫酸鹽測序、焦磷酸測序、甲基化特異性PCR、高分辨率熔解曲線分析、基于微陣列的方法和下一代測序。南京亞硫酸鹽甲基化重測序分析以MethlyC-seq為例，將DNA段化后收集特定長度的片段并修復DNA末端.

WGBS能為基因組DNA甲基化時空特異性修飾的研究提供重要技術支持，能廣泛應用在個體發育、衰老和疾病等生命過程的機制研究中，也是各物種甲基化圖譜研究的優先方法。常規全基因組甲基化測序技術通過T4-DNA連接酶，在超聲波打斷基因組DNA段的兩端連接接頭序列，連接產物通過重亞硫酸鹽處理將未甲基化修飾的胞嘧啶C轉變為尿嘧啶U，進而通過接頭序列介導的 PCR 技術將尿嘧啶U轉變為胸腺嘧啶T。上海翼和是上海市遺傳學會理事單位，上海市****，至今已有十六年的歷史。

DNA甲基化作為重要的表觀遺傳學調控機制在許多關鍵的生物學過程如發育及疾病的進展中扮演著重要的作用，相對于基于PCR、芯片等傳統檢測手段，全基因組亞硫酸氫鹽測序(Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS) 技術可通過將高效的亞硫酸氫鹽轉化與高通量測序文庫構建方法相結合 (Post-BS WGBS)，可在單堿基的分辨率下對來自更多樣本基因組中的甲基化位點進行準確的分析，既可以覆蓋所有甲基化位點，還能夠配合靶向技術檢測低頻甲基化信號，已成為目前在業界受到普遍關注的一種主流方法。目標區域甲基化重測序（Hi-Methylseq）結合了亞硫酸鹽轉換、靶向擴增子高通量測序技術。

亞硫酸氫鈉修飾后測序法是一種對DNA進行亞硫酸氫鈉處理、聚合酶鏈反應擴增與DNA測序相結合的方法，能夠提供測定區域的序列信息，準確定位甲基化胞嘧啶位點；重亞硫酸鹽修飾后，甲基化胞嘧啶保持不變，但非甲基化胞嘧啶轉變為尿嘧啶，PCR擴增后為胸腺嘧啶，其將甲基化狀態的差異轉化成堿基的差異，從而對胞嘧啶的甲基化狀態進行分析；但在亞硫酸鈉處理的酸性環境下，單鏈特異性PCR模板穩定性下降，容易降解；并且模板鏈CG二核苷酸水平高易形成復雜的二級結構，常出現非特異性條帶，結合“巢式PCR法”能明顯提高擴增的特異度。DNA 甲基化能關閉某些基因的活性，去甲基化則誘導了基因的重新活化和表達。安徽目標區段甲基化重測序機構

機體細胞在經歷脅迫、創傷等環境變化后，會產生特定的應答，并往往會用DNA甲基化記錄在DNA修飾中。安徽目標區段甲基化重測序機構

WGBS（Whole Genome Bisulfite Sequence）全基因組甲基化測序，利用重亞硫酸氫鹽使DNA中未發生甲基化的胞嘧啶(C)脫氨基轉變成尿嘧啶(U)，而甲基化的胞嘧啶保持不變，然后通過PCR將U變為A，*有甲基化的C可以成功保留，***通過測序就可判斷CpG位點是否發生甲基化。特點是精確度高、重復性好，檢測范圍廣，可以覆蓋全基因組范圍內的每一個C堿基的甲基化狀態；但需要的數據量比較大，成本較高。上海翼和生物是上海市遺傳學會理事單位，上海市****，至今已有16年的歷史。安徽目標區段甲基化重測序機構

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