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溫州基因編輯脫靶檢測安全性評價

來源: 發(fā)布時間:2024-04-16

近幾年,細胞和基因zhiliao(cell & gene therapy,CGT)領(lǐng)域發(fā)展迅猛,在多個方向取得了重大突破,以anti-CD19和BCMA為代的多種CAR-T免疫細胞療法攻克了一部分血液瘤,多種AAV療法也給一些難以成藥的罕見病提供了有效的zhiliao方案。另一方面,基于CRISPR基因編輯技術(shù)的眾多基因療法也進展迅速,較早體外基因編輯療法較快今年年底能夠上市(CRISPR Therapeutics CTX001),體內(nèi)基因編輯療法取得了不錯的臨床數(shù)據(jù)(Intellia Therapeutics NTLA-2001),使用CRISPR技術(shù)制造的通用型CAR-T療法也是免疫細胞療法發(fā)展的一大趨勢(Caribou Biosciences CB-010)。脫靶檢測在揭示CRISPR/Cas9系統(tǒng)的脫靶機制以及進一步提高系統(tǒng)靶向性的研究中具有重要作用。溫州基因編輯脫靶檢測安全性評價

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GUIDE-Seq脫靶評估技術(shù)的優(yōu)勢分析鼓潤致力于基因組編輯工具脫靶的分析檢測工作,為篩選、優(yōu)化基因組編輯工具的保真性提供標準化的分析。我們脫靶分析具有如下優(yōu)勢:實用性強:能反映CRISPR在真核細胞中進行基因編輯的在靶與脫靶情況,以進行安全性和有效性評價;檢測通量高:一次能檢測多個樣本的在靶與脫靶情況,并通過優(yōu)化的標簽設(shè)計,降低實際的測序reads數(shù)量;準確性高:絕大部分檢測結(jié)果可被驗證;靈敏度高:能夠高效檢測出低頻脫靶位點,檢測低至0.1%的脫靶突變;實驗難度低:操作過程簡單易行細胞適應(yīng)性強。off-target脫靶檢測方法如何檢測是否發(fā)生脫靶?

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通常不需要進行標準的遺傳毒性組合試驗,但應(yīng)根據(jù)基因zhiliao產(chǎn)品的特點、產(chǎn)品的具體適應(yīng)癥、載體的已有信息、導入基因序列結(jié)構(gòu)等,評估基因zhiliao產(chǎn)品整合進基因組的可能性,判斷是否需要開展另外的遺傳毒性研究,如研究基因組修飾的發(fā)生情況,并檢測隨后可能發(fā)生的異常細胞行為;評估插入突變(插入位點、插入拷貝數(shù)等)引起的遺傳毒性風險。當基因zhiliao產(chǎn)品采用基因編輯或轉(zhuǎn)座子技術(shù)時,需要關(guān)注脫靶編輯、轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座印跡引起的遺傳毒性問題;鑒定/表征基因組整合位點。

由于設(shè)計的sgRNA會與非靶點DNA序列錯配,引入非預期的基因突變,即脫靶效應(yīng)(Off-targeteffects)。脫靶效應(yīng)造成了研究中的許多不確定性,這無疑限制了該技術(shù)的應(yīng)用。因此,研究者希望能開發(fā)有效的方法來檢測脫靶效應(yīng)。在目前主流的脫靶效應(yīng)評估方法中,有一種方法為GUIDE-seq,其原理是利用一種短的雙鏈寡聚核苷酸(dsODN)標記CRISPR/Cas誘導的脫靶斷裂,然后對標簽所在的基因組區(qū)域進行高通量測序,通過生物信息學分析從而確定脫靶位點。利用該技術(shù)可以在基因組范圍內(nèi)檢測CRISPR脫靶效應(yīng),從而改變了以往先預測假定脫靶位點再檢測的思路;與其他的評估方法相比,GUIDE-seq更精確、更靈敏。基因編輯可以‘指哪打哪’,四種脫靶檢測方法。

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Cas9蛋白是一種切割外來DNA的酶,像一把分子剪刀。該蛋白通常與兩個RNA分子結(jié)合:crRNA和另一個稱為tracrRNA(或“反式j(luò)ihuocrRNA”)。這兩個RNA分子引導Cas9到它將進行切割的目標部位。這段DNA是與crRNA的20個核苷酸互補的。CRISPR技術(shù)是從細菌和古細菌的自然防御機制中改編而來的。這些生物體使用CRISPR衍生的RNA和各種Cas蛋白,包括Cas9,來阻止病毒和其他異物的攻擊。它們主要通過切碎和破壞外來入侵者的DNA來做到這一點。當這些組件被轉(zhuǎn)移到其他更復雜的生物體中時,它允許對基因進行操縱,或“編輯”。脫靶切割位點已在基因編輯技術(shù),CRISPR / Cas9,ZFNs和TALEN。上海定量脫靶檢測評估標準

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對于基因修飾細胞zhiliao產(chǎn)品,充分的非臨床研究是為了:(1)闡明基因修飾的目的、功能以及產(chǎn)品的作用機制,明確其在擬定患者人群中使用的生物學合理性;(2)為臨床試驗的給藥途徑、給藥程序、給藥劑量的選擇提供支持性依據(jù);(3)根據(jù)潛在風險因素,闡明毒性反應(yīng)特征,預測人體可能出現(xiàn)的不良反應(yīng),確定不良反應(yīng)的臨床監(jiān)測指標,為制定臨床風險控制措施提供參考依據(jù)。因此,應(yīng)充分開展非臨床研究,收集用于風險獲益評估的信息,以確立擬開發(fā)產(chǎn)品在目標患者人群中預期具有合理的、可接受的獲益風險比,同時為臨床試驗的設(shè)計和風險控制策略的制定提供支持性依據(jù)。溫州基因編輯脫靶檢測安全性評價

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