對于CAR修飾的免疫細胞，應采用多種體外方法評估其胞外抗原識別區的脫靶風險。TCR修飾免疫細胞的脫靶毒性可通過評估TCR與人體自身抗原肽的交叉識別能力來評估。首先，應采用體外試驗測定TCR修飾的免疫細胞與人自身抗原肽-HLA（與遞呈靶抗原肽的HLA等位基因相同）復合物的親和力，并說明抗原肽的選擇依據及選擇范圍。此外，還應研究其他相關或不相關的蛋白中是否含有靶抗原肽序列。如果TCR與人自身抗原肽有交叉反應可能，應確定靶抗原肽的較小識別基序（motif），并采用計算機預測分析評估交叉反應性。如果計算機預測可識別出具有潛在交叉反應性的抗原肽，應在體外測定TCR修飾免疫細胞對表達相應蛋白或遞呈相應抗原肽的的細胞的識別能力。如果不能排除交叉反應性，應基于含有潛在交叉反應性抗原肽的蛋白的表達模式以及TCR與潛在交叉反應性抗原肽的親和力來進行風險評估。為獲得TCR與其他等位HLA潛在交叉反應性的信息，應進行充分的HLA交叉反應性篩選。載體拷貝數低和高有什么不同？北京基因療法載體拷貝數政策

關于整合性載體的特殊考慮如受試者接受整合性載體基因zhiliao產品，例如轉座子元件、γ-逆轉錄病毒、慢病毒及其他逆轉錄病毒載體，或利用整合性載體或基于轉座子的載體在體外修飾的細胞，長期隨訪中需格外關注基因zhiliao產品的基因組整合風險，建議申辦方分析基因zhiliao載體在靶細胞或相關替代細胞的基因組中整合的影響如在優勢克隆、克隆性生長是否導致惡性。依據載體在靶細胞基因組中整合能力的不同，可分為非整合型、定點整合型、弱整合型、隨機整合型等不同類型。基因轉導與修飾的作用機制包括同源重組、非同源重組等。因此，需要根據多方面因素、針對不同類型產品的特性進行風險評估和控制。應通過綜合風險分析來論證產品開發的合理性和科學性，識別、確定與產品質量和安全性相關的風險因素； 確定非臨床和臨床研究期間所需進行風險評估的數據范圍和重點，并制定風險防控和處理措施。申請人需在整個產品生命周期內對其進行跟蹤分析和更新，收集數據以進一步確定其風險特征并制定控制策略。南京上市后載體拷貝數用于檢測慢病毒載體拷貝數的方法及其應用。

拷貝數，是指某基因（可以是質粒）在某一生物的基因組中的個數。單拷貝就是該基因在該生物基因組中只有一個，多拷貝則指有多個。在細菌細胞中，根據復制特性，質粒分嚴緊型和松弛型兩類，前者在細胞中只含1?2個，而后者含10?15個以上。恒定的拷貝數與質粒復制控制系統、宿主細胞遺傳背景及生長條件有關。拷貝數變異(Copynumbervariation,CNV)是由基因組發生重排而導致的,一般指長度為1kb以上的基因組大片段的拷貝數增加或者減少,主要表現為亞顯微水平的缺失和重復。

利用ddPCR檢測溶液中空載體的濃度和整合到T細胞群中的CAR和TCR載體的平均數量。ddPCR檢測到的平均每個細胞的載體拷貝數與流式細胞術檢測到的細胞轉導比例呈線性關系。使用ddPCR與Real-time PCR的定量精度比較表明，ddPCR明顯更精確，測量的差異減少了7倍，文中通過一些數據的比較說明了ddPCR具有更高的準確性和穩定性。使用ddPCR測定法通過不同的工作人員獲得了類似的載體拷貝數測量結果，突出了該測定法在技術人員之間的可重復性。對新鮮的和冷凍保存的CAR T和TCR工程改造的T細胞進行的分析得出了相似的結果。說明ddPCR是一種準確定量CAR和TCR工程T細胞中平均載體拷貝數的強大工具。該試驗也適用于其他類型的基因工程細胞，包括自然殺傷細胞和造血干細胞。慢病毒ganran靶細胞的ganran效率可以通過qPCR檢測靶細胞中的慢病毒載體拷貝數來測算。

用低拷貝質粒作表達載體有什么好處？因為高拷貝質粒穩定性低，而且給宿主細胞的壓力大。低拷貝數的質粒DNA在宿主細胞分裂前只能復制1～2次，而多拷貝數質粒可以在細胞分裂前復制成10～200拷貝。高拷貝數的質粒稱為松弛型質粒(relaxedplasmid)，單獨于細菌細胞而自主復制；低拷貝數的質粒一般是嚴緊型質粒(stringentplasmid)，它們的復制隨細菌染色體的復制同步進行。一般來說，外源基因的表達量隨拷貝數的增加而提高，但是當拷貝數很大時，拷貝數與發酵目標產物產率的這種關系卻不存在。細胞產品中的外源病毒載體基因拷貝數不高于5拷貝/細胞。浙江CAR-T載體拷貝數方法

慢病毒載體LV ， 基因載體拷貝數檢測服務，可聯系上海唯可。北京基因療法載體拷貝數政策

人工構建的質粒載體分類：高拷貝數的質粒載體，ColE1、pMB1派生質粒具有高拷貝數的特點。適合大量增殖克隆基因，或需要大量表達的基因產物。低拷貝數的質粒載體，由pSC101派生來的載體特點是分子量小的拷貝數。它有特殊的用途：當有些被克隆的基因的表達產物過多時會嚴重影響寄主菌的正常代謝活動，導致寄主菌的死亡時，就需要低拷貝的載體。失控的質粒載體，這是一類溫度敏感型復制控制質粒。如pBEU1、pBEU2。插入失活型克隆載體。載體的克隆位點位于其某一個選擇性標記基因內部。如pDF41、pDF42。正選擇的質粒載體，直接選擇轉化后的細胞。只有帶有選擇標記基因的轉化菌細胞才能在選擇培養基上生長。北京基因療法載體拷貝數政策