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種子基因脫靶檢測guide-sequence

來源: 發(fā)布時間:2024-04-27

基因編輯產(chǎn)品除了適用基因zhiliao產(chǎn)品的一般考慮以及整合性載體的特殊考慮外,長期隨訪中還應(yīng)額外關(guān)注脫靶風(fēng)險,量化評估脫靶活性和在靶活性之間的相關(guān)性,或利用在靶活性來預(yù)測脫靶活性的水平。在開發(fā)過程中應(yīng)同時關(guān)注基因轉(zhuǎn)導(dǎo)效率、脫靶效率、插入突變情況、目的基因在靶細胞中整合位點及表達。評估基因zhiliao產(chǎn)品整合進基因組的可能性,判斷是否需要開展另外的遺傳毒性研究,評估插入突變(插入位點、插入拷貝數(shù)等)引起的遺傳毒性風(fēng)險。需要關(guān)注脫靶編輯、轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座印跡引起的遺傳毒性問題;鑒定/表征基因組整合位點。非臨床研究是藥物開發(fā)的重要環(huán)節(jié)之一。高精度脫靶檢測,推薦唯可生物,實驗實力強,專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。種子基因脫靶檢測guide-sequence

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使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計核酸酶進行基因組編輯,可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯游锘蚪M的特定位點。然而,可能會出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾,這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定,并破壞正常基因的功能,從而可能導(dǎo)致臨床前和臨床研究中的安全問題。基因編輯目前的脫靶分析技術(shù)主要依賴于生物信息學(xué)預(yù)測和全基因組脫靶檢測技術(shù)。這些預(yù)測缺乏可靠性,因為它們只涵蓋了潛在基因組改變的一小部分。而頻率低于0.5%的脫靶突變大多無法被全基因組脫靶檢測技術(shù)檢測到。我們是開發(fā)用于全基因組靶向/非靶向分析的無偏分析的先驅(qū)。靶向基因組編輯唯可生物為基因編輯安全性評估提供多方面的PCR和基于NGS的分析。我們的多功能且經(jīng)濟高效的檢測方法可檢測靶向和非靶向基因組改變。我們先進的分析技術(shù)與強大的內(nèi)部生物信息學(xué)體系相結(jié)合,可靠地量化了預(yù)期的靶向整合與非預(yù)期結(jié)果(如易位和INDEL)之間的比率。種子基因脫靶檢測guide-sequence育種脫靶檢測,推薦唯可生物,實驗實力強,專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。

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不同基因zhiliao產(chǎn)品的特殊考慮。關(guān)于整合性載體的特殊考慮如受試者接受整合性載體基因zhiliao產(chǎn)品,例如轉(zhuǎn)座子元件、γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒及其他逆轉(zhuǎn)錄病毒載體,或利用整合性載體或基于轉(zhuǎn)座子的載體在體外修飾的細胞,長期隨訪中需格外關(guān)注基因zhiliao產(chǎn)品的基因組整合風(fēng)險,建議申辦方分析基因zhiliao載體在靶細胞或相關(guān)替代細胞的基因組中整合的影響(例如是否存在克隆性生長、是否存在優(yōu)勢克隆、克隆性生長是否導(dǎo)致惡性liu等)。如果基因組整合相關(guān)風(fēng)險的分析可行,應(yīng)注意以下幾點:?在接受基因zhiliao產(chǎn)品的較初5年內(nèi),兩次檢測間的采樣間隔建議不超過6個月。此后每年至少檢測一次,直至檢測數(shù)據(jù)表明不再存在任何安全性風(fēng)險。

Cas9蛋白是一種切割外來DNA的酶,像一把分子剪刀。該蛋白通常與兩個RNA分子結(jié)合:crRNA和另一個稱為tracrRNA(或“反式j(luò)ihuocrRNA”)。這兩個RNA分子引導(dǎo)Cas9到它將進行切割的目標(biāo)部位。這段DNA是與crRNA的20個核苷酸互補的。CRISPR技術(shù)是從細菌和古細菌的自然防御機制中改編而來的。這些生物體使用CRISPR衍生的RNA和各種Cas蛋白,包括Cas9,來阻止病毒和其他異物的攻擊。它們主要通過切碎和破壞外來入侵者的DNA來做到這一點。當(dāng)這些組件被轉(zhuǎn)移到其他更復(fù)雜的生物體中時,它允許對基因進行操縱,或“編輯”。種子基因脫靶檢測機構(gòu)推薦唯可。

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由于設(shè)計的sgRNA會與非靶點DNA序列錯配,引入非預(yù)期的基因突變,即脫靶效應(yīng)(Off-targeteffects)。脫靶效應(yīng)造成了研究中的許多不確定性,這無疑限制了該技術(shù)的應(yīng)用。因此,研究者希望能開發(fā)有效的方法來檢測脫靶效應(yīng)。在目前主流的脫靶效應(yīng)評估方法中,有一種方法為GUIDE-seq,其原理是利用一種短的雙鏈寡聚核苷酸(dsODN)標(biāo)記CRISPR/Cas誘導(dǎo)的脫靶斷裂,然后對標(biāo)簽所在的基因組區(qū)域進行高通量測序,通過生物信息學(xué)分析從而確定脫靶位點。利用該技術(shù)可以在基因組范圍內(nèi)檢測CRISPR脫靶效應(yīng),從而改變了以往先預(yù)測假定脫靶位點再檢測的思路;與其他的評估方法相比,GUIDE-seq更精確、更靈敏。脫靶檢測分析,推薦唯可生物,實驗實力強,專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。浙江基因編輯技術(shù)脫靶檢測實驗室

脫靶檢測技術(shù)是一系列針對CRISPR/Cas9系統(tǒng)作用機制研發(fā)的用于確定CRISPR/Cas9系統(tǒng)基因編輯準(zhǔn)確性檢測工具。種子基因脫靶檢測guide-sequence

基于已有科學(xué)經(jīng)驗和既往非臨床/臨床研究結(jié)果,如果認為基因修飾細胞所采用的載體系統(tǒng)可將外源基因整合到細胞基因組中并可在體內(nèi)長期存續(xù),需綜合分析以上風(fēng)險因素,評估潛在的插入突變、致瘤/致性風(fēng)險。非臨床研究,應(yīng)采用具有代表性的基因轉(zhuǎn)導(dǎo)細胞進行基因整合位點分析,分析細胞的克隆組成以及在關(guān)注基因(如liu相關(guān)調(diào)控基因)附近有無優(yōu)先整合跡象,含有關(guān)注整合位點的細胞有無優(yōu)先異常增殖。對于嵌合抗原受體(Chimericantigenreceptor,CAR)或T細胞受體(Tcellreceptor,TCR)修飾的免疫細胞,應(yīng)盡可能采用多種方法評估其靶點相關(guān)毒性和脫靶毒性風(fēng)險。種子基因脫靶檢測guide-sequence

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