如何檢測脫靶效應？在gRNA修飾中，截短的sgRNA是一種減少脫靶效應的簡單方法，并且基于RNP的遞送在大多數情況下適用于獲得更高的目標活性。此外，選擇合適的Cas變體對于減少脫靶效應也至關重要。但選擇合適的脫靶檢測工具，也是重中之重。脫靶預測結合PCR檢測法，利用脫靶預測軟件預測潛在的脫靶位點，PCR擴增預測的脫靶位點，利用直接測序或酶切法檢測脫靶情況。操作簡便、成本低偏倚性預測。全基因組測序，一種通過高通量測序檢測脫靶突變的方法，需要選擇適當的參考基因組過濾背景突變，數據比對分析獲得含有PAM基序的潛在修飾位點，進一步基因擴增驗證其突變情況。高通量全基因組范圍檢測可檢測SNPs，Indels和染色體水平變化。高深度全基因組重測序服務,該方法能多方位精細地對基因編輯的細胞或個體進行off-target檢測。連云港基因療法脫靶檢測實驗室

采用基因編輯技術制備的細胞產品。對于采用基因編輯技術制備的基因修飾細胞產品，應進行體外在靶和脫靶活性評估，以確認修飾酶或向導RNA對靶基因序列的特異性。在評估基因編輯的脫靶風險時，應說明所選擇的評價策略的合理性和敏感性。雖然采用計算機分析預測基因編輯的潛在脫靶位點，并對潛在脫靶位點進行深度測序分析，可用于評估基因編輯的脫靶風險；但選擇的評價策略仍應包含體外全基因組測序比對，以證明潛在脫靶位點未出現脫靶。此外，在評估脫靶活性時，還應評估種屬特異性的差異、細胞病理生理狀態的差異或細胞類型的差異對非臨床數據預測性的影響。必要時，還應分析基因編輯對細胞表型和生理功能的潛在影響。連云港基因療法脫靶檢測實驗室根據選擇的sgRNA，通過生物信息學方法，對sgRNA進行脫靶分析。

CIRCLE-seq和CHANGE-seq與SITE-seq同期發表的CIRCLE-seq一定程度上解決了SITE-seq的一些問題。CIRCLE-seq的第一步是將純化后的基因組DNA隨機打斷成300bp左右的片段，然后首尾相連成環狀DNA，這種方法很好地避免了DNA隨機斷裂造成的背景噪聲。實驗的第二步是用Cas9切割環狀DNA，再連上接頭并進行雙端測序，這樣就可以在一次測序中同時獲取切割位點的兩側序列，彌補了SITE-seq的另一個缺點。CIRCLE-seq從總體上來說要優于SITE-seq，但是將基因組DNA隨機打斷后成環的效率并不高，所以同一作者在3年后發表了CHANGE-seq，用Tn5一步法打斷基因組并加接頭，提高了成環效率，降低了起始基因組DNA的用量。

圍繞大家關心的CRISPR基因編輯安全性問題，我們首先對CRISPR脫靶位點檢測技術進行一次大盤點，在sgRNA設計階段需要如何做才能夠盡可能地避免脫靶現象的發生。較簡單的脫靶位點檢測方法是全基因組測序（WGS），但在實際使用中，即使測序深度達到100X，也很難發現一些低頻率的脫靶位點，同時測序成本卻非常高。為彌補WGS的這些缺陷，常見的脫靶位點檢測技術都需要對脫靶位點進行捕獲富集，來提高檢測靈敏度，降低測序成本。按照實驗原理的不同，脫靶位點檢測技術可以分為細胞外、細胞內和其他特殊方法這3類。脫靶檢測安全性評價，推薦唯可生物，實驗實力強，專業性高，檢測效率高，結果準確率高。

自基因zhiliao出現之日起，安全性問題就隨之產生了，并成為阻礙基因zhiliao研發的一大障礙，吳寧博士認為：“基因zhiliao產品的研發和上市，安全性會將是一個非常重要考量。如果一款產品它安全性有問題的話，在市場化道路上就會受到很大影響。尤其是基因zhiliao，目前處于起始階段，一旦出現不良事件，很有可能對整個行業都會產生致命打擊。具體說來，基因zhiliao的安全性問題主要涉及基因插入突變、脫靶、生物分布和持久性、潛伏再jihuo以及潛在免疫原性等。”基因編輯脫靶檢測，推薦唯可生物，實驗實力強，專業性高，檢測效率高，結果準確率高。無錫基因編輯脫靶檢測政策

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CRISPR/Cas9的問題：和TALEN和ZFNS技術一樣，CRISPR/Cas9技術在應用時也存在一定概率的脫靶問題——Cas9核酸酶在非目標位點發生切割，引入非預期的基因突變。脫靶切割引入的突變可能會直接破壞細胞的基本功能，帶來不可預控的嚴重后果。如何減輕脫靶效應？gRNA的GC含量：gRNA 的序列結構對CRISPR/Cas9基因編輯的靶向活性有影響。gRNA 序列中 40%–60%的 GC 含量可以增加靶向活性，因為較高的 GC 含量穩定了DNA：RNA 雙鏈體并破壞了脫靶結合。gRNA-on-gRNA序列的位置對編輯有影響，位于四個核苷酸末端的嘌呤殘基可以提高編輯效率。鳥嘌呤優先選擇在gRNA的20位，胞嘧啶優先選擇在16位以增加靶向編輯。連云港基因療法脫靶檢測實驗室