一般情況下重組載體基因較少整合到基因組中,但近年來已發現載體基因整合到特定基因座中導致的可能性。建議設計時充分考慮重組載體的安全性,關注目的基因的啟動子選擇、給藥劑量、整合區域等多種相關因素。建議對病毒載體進行全基因組測序。另外,也可將病毒載體轉導目標細胞后,對整合有載體序列的細胞基因組進行測序,說明載體骨架及目的基因序列的準確性。對于整合型載體還應考慮插入突變的風險,應對插入位點進行分析并說明對細胞存在的潛在的安全性影響,并對分析方法的合理性進行說明。用于檢測慢病毒載體拷貝數的方法及其應用與流程。蘇州VCN載體拷貝數評估
對特定類型基因修飾細胞產品的特殊考慮鑒于基因修飾細胞的產品種類繁多、各有特點,除上述一般技術要求外,還應基于產品的特性進行相應的特殊考慮。本指導原則列舉了以下三種情形的特殊考慮。CAR或TCR修飾的免疫細胞對于嵌合抗原受體(Chimericantigenreceptor,CAR)或T細胞受體(Tcellreceptor,TCR)修飾的免疫細胞,應盡可能采用多種方法評估其靶點相關毒性和脫靶毒性風險。對于靶點相關毒性,應采用體外方法深入分析靶點在人體qiguan、組織和細胞中的表達分布情況,基因表達分析庫和文獻調研也可能會有助于闡明靶點在不同病理生理狀態下的表達是否存在差異。應采用表達和不表達靶抗原的細胞作為靶細胞進行體外試驗,確認CAR或TCR修飾的免疫細胞可特異性的識別和殺傷靶細胞。杭州慢病毒載體拷貝數方法隨訪載體拷貝數檢測服務,選上海唯可,檢測分析技術成熟。
關于整合性載體的特殊考慮如受試者接受整合性載體基因zhiliao產品,例如轉座子元件、γ-逆轉錄病毒、慢病毒及其他逆轉錄病毒載體,或利用整合性載體或基于轉座子的載體在體外修飾的細胞,長期隨訪中需格外關注基因zhiliao產品的基因組整合風險,建議申辦方分析基因zhiliao載體在靶細胞或相關替代細胞的基因組中整合的影響如在優勢克隆、克隆性生長是否導致惡性。依據載體在靶細胞基因組中整合能力的不同,可分為非整合型、定點整合型、弱整合型、隨機整合型等不同類型。基因轉導與修飾的作用機制包括同源重組、非同源重組等。因此,需要根據多方面因素、針對不同類型產品的特性進行風險評估和控制。應通過綜合風險分析來論證產品開發的合理性和科學性,識別、確定與產品質量和安全性相關的風險因素; 確定非臨床和臨床研究期間所需進行風險評估的數據范圍和重點,并制定風險防控和處理措施。申請人需在整個產品生命周期內對其進行跟蹤分析和更新,收集數據以進一步確定其風險特征并制定控制策略。
拷貝數,對于質粒載體,拷貝數是我們關心的特性之一。實際上,每個細菌中的質粒的拷貝數主要決定于質粒本身的復制特性。按照復制性質,可以把質粒分為兩類:嚴緊型質粒:當細菌染色體復制一次時,質粒也復制一次,每個細菌內只含1~2個質粒;松弛型質粒:當細菌染色體復制停止后仍然能繼續復制,每一個細菌內一般含20個左右質粒拷貝。這些質粒的復制是在寄主的松弛控制之下的,每個細菌中含有10-200份拷貝,如果用一定的藥物處理抑制寄主蛋白質的合成還可使質粒拷貝數增至幾千份。當然,恒定的拷貝數與質粒復制控制系統、質粒的大小及培養條件有關。載體拷貝數方法,上海唯可生物專業人員為您解答。
數字PCR(DigitalPCR),數字PCR的基本原理是將含有核酸分子的反應體系分成成千上萬個納升級的微滴,其中每個微滴或不含待檢核酸靶分子,或者含有一個至數個待檢核酸靶分子,且每個微滴都作為一個單獨的PCR反應器。經PCR擴增后,采用微滴分析儀逐個對每個微滴進行檢測,有熒光信號的微滴判讀為1,沒有熒光信號的微滴判讀為0(因此該技術被稱為“數字PCR”),較終根據泊松分布原理以及陽性微滴的比例,分析軟件可計算給出待檢靶分子的濃度或拷貝數(無需標準曲線的繪制)。基因療法載體拷貝數檢測服務,當然選擇上海唯可,實驗室配備全,專業人員為您答疑解惑。北京慢病毒載體拷貝數實驗室
用于檢測單個CAR-T細胞的慢病毒載體拷貝數的方法。蘇州VCN載體拷貝數評估
流式檢測CAR+T細胞數量,較,作者用FC流式評估了用axis-cel和tisasa-celzhiliao的患者的CAR+T細胞的數量。在CAR-T細胞給藥后5個不同時間點冷凍的PBMCs上對UPN#009(軸細胞)和UPN#020(組織細胞)進行了回顧性FC試驗。CAR-T細胞的數量測定每ul血液。從圖4中可以明顯看出,兩種方法都可以觀察到CAR-T細胞數量的高度收斂。值得注意的是,所有三種方法(fc、dPCR和qPCR)都檢測到了第35天UPN#009中CAR-T細胞數量的復蘇。這些數據與我們小組之前觀察到的基于PCR和基于fc的定量的高一致性相一致。蘇州VCN載體拷貝數評估