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不論在科研還是臨床中,CRISPR技術(shù)的使用都帶來了非常高的回報,也同時伴隨著各種風險,這其中脫靶現(xiàn)象就研究者們較為擔心的一類風險。本文中我們盤點了多種主流的CRISPR脫靶位點檢測方法,但沒有一種方法是適用于所有CRISPR技術(shù)的脫靶檢測,一個項目中只使用一種脫靶檢測方法也是不足夠的。如何在實驗中,特別是臨床試驗中多方面評估CRISPR的脫靶風險,需要將多種脫靶檢測方法有效組合。同時,每一條sgRNA都不可避免地存在脫靶位點,如何評估這種風險,如何降低這種風險,具體的解決方案我們用臨床實例來為大家介紹。脫靶檢測方法,推薦唯可生物,實驗實力強,專業(yè)性高,檢測效率高,結(jié)果準確率高。嘉興高精度脫靶檢測企業(yè)
臨床研究人群,如果一種基因zhiliao產(chǎn)品具有引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風險,需要開展長期隨訪觀察時,所有接受基因zhiliao產(chǎn)品的受試者在簽署知情同意書后均應(yīng)入組長期隨訪臨床研究。在設(shè)計長期隨訪臨床研究的方案時,應(yīng)考慮目標受試者人群及特征、整體健康情況以及接受zhiliao的患者的預(yù)期生存期等特征對遲發(fā)性不良反應(yīng)的收集的影響。通常來說,當臨床研究人群的某些特征(如預(yù)期壽命短、多重合并癥、以及暴露于放療或化療等其他藥物)可能干擾遲發(fā)性不良反應(yīng)的觀察分析時,會影響長期隨訪觀察在評估和減輕受試者風險方面的效用;而在病情較輕或較局限,合并癥以及伴隨zhiliao有限或較穩(wěn)定的受試者中,通過長期隨訪觀察收集到的評估數(shù)據(jù)可能更容易分析。嘉興高精度脫靶檢測企業(yè)隨著脫靶影響因素、降低策略及脫靶檢測技術(shù)研究的不斷深入,未來CRISPR/Cas9系統(tǒng)將在更多領(lǐng)域造福人類。
長期隨訪觀察的考慮要素:遲發(fā)性不良反應(yīng)相關(guān)的潛在風險因素.在評估基因zhiliao產(chǎn)品的風險因素時,申請人應(yīng)考慮基因zhiliao產(chǎn)品的特性,同時參考該產(chǎn)品的非臨床和臨床數(shù)據(jù)以及類似產(chǎn)品的已知數(shù)據(jù)。基因zhiliao產(chǎn)品的非臨床研究旨在為臨床研究提供支持性信息和關(guān)鍵安全性特征參數(shù),如機體中的生物分布和持久性、整合/修飾宿主基因組、潛伏再jihuo以及潛在免疫原性等。對于新型基因zhiliao產(chǎn)品,可參考數(shù)據(jù)有限,申請人應(yīng)盡可能在非臨床研究中獲得用于評估遲發(fā)性不良反應(yīng)風險的數(shù)據(jù)。
持續(xù)ganran,有復(fù)制能力的病毒或細菌載體基因zhiliao產(chǎn)品,有可能在免疫能力低下的患者中發(fā)展為持續(xù)ganran,進一步增加發(fā)生遲發(fā)但嚴重ganran的風險。基因編輯活性,基因編輯等新型基因zhiliao產(chǎn)品有獨特的基因組修飾功能,可誘導(dǎo)人類基因組中的位點特異性改變或修飾,同時也可能在基因組中發(fā)生脫靶效應(yīng),導(dǎo)致非預(yù)期的基因表達變化,進而增加未知且不可預(yù)測的遲發(fā)性不良反應(yīng)風險。非預(yù)期的生物分布,某些基因zhiliao產(chǎn)品需要在特定的細胞或組織中表達以實現(xiàn)zhiliao目的,如果基因zhiliao產(chǎn)品在非預(yù)期的細胞、組織或qiguan中表達或修飾,可能引起非靶細胞功能、生長或/分化改變,甚至引發(fā)liu。基因編輯脫靶將無處隱藏。
改進Cas變體使用SpCas9和SaCas9 變體:已研發(fā)出諸如SpCas9-Nickase、dCas9 、dCas9–FokI、xCas9、Cas9-NG、evoCas9、SpCas9 – HFI、eSpCas9和Hypa-Cas9等多種Cas變體,可降低脫靶效應(yīng)。改進的Cas9同源物具有更廣的PAM功能和特異性:實驗表明Cpf1、CRISPR-Cpf1-RNP可降低脫靶效應(yīng)。CRISPR 遞送方法:基于病毒的遞送方法:腺病毒 (AdV) 顯示出整合到靶細胞基因組中的微弱潛力,這一特征有利于限制脫靶效應(yīng)。然而,AdVs 會引發(fā)免疫反應(yīng),目前還不能完全排除它與宿主基因組整合的可能性。非病毒遞送方法:當sgRNA和Cas9以RNP復(fù)合物形式傳遞時,電穿孔顯示植物原生質(zhì)體中的脫靶突變數(shù)量很低。通過脂質(zhì)體介導(dǎo)的轉(zhuǎn)染傳遞RNP復(fù)合物顯示,與質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)染相比,脫靶突變的發(fā)生率較小。基因編輯治療過程中安全性評價,即脫靶效應(yīng)的檢測。北京育種脫靶檢測分析
如何降低脫靶效應(yīng)?選擇特異的gRNA; 使用RNP; 使用eSpCas9的質(zhì)粒; 使用Nickase Cas9。嘉興高精度脫靶檢測企業(yè)
gRNA的長度和錯配: 17個核苷酸長度的gRNA顯示出更高的基因組編輯效率。相比之下,18-20 bp的長度顯示出較低的基因組編輯效率。在人類細胞中減少潛在脫靶效應(yīng)的指導(dǎo)方針:1) 應(yīng)避免在PAM的7-10 bp范圍內(nèi)靶序列有超過3個錯配;2) 在PAM的12 bp內(nèi),應(yīng)避免sgRNA 凸起以減少脫靶效應(yīng)。gRNA的化學(xué)修飾:在gRNA核糖磷酸骨架中加入2?-O-甲基-3?-膦酰基乙酸酯會導(dǎo)致位點特異性修飾,使脫靶切割減少40-120倍,同時保持靶向性能。gRNA上游5'發(fā)夾結(jié)構(gòu)的修飾可以提高Cas9和Cas12的特異性,降低脫靶效應(yīng)。嘉興高精度脫靶檢測企業(yè)