應用場景:單克隆抗體藥物輔助篩選;致xingbing毒整合位點檢測與整合偏好性分析等;WGS不適用于轉染之后未經過傳代培養和表型篩選的細胞系。豐富的項目經驗目前,唯可已與國內外多家免疫zhiliao研究前沿企業開展合作,采用該方法對高度異質性的CAR-T細胞進行整合位點檢測與細胞安全性評估,具有較為豐富的項目經驗。一般HBV插入到基因組中形成下圖結構。使用三代測序,靶向插入區域的測序reads可分為Readsgroup1(HBV插入區域測通)和Readsgroup2(reads部分比對染色體,部分比對HBV插入區域)。基于三代數據比對后bam文件的IGV圖,判斷變異類型,推斷斷點類型和插入序列。目前,基因整合位點主要通過PCR方法分離并經測序鑒定。溫州載體整合位點安全性評價
當載體或基因zhiliao產品原有的風險特征增加時,例如經過修飾以攜帶基因組編輯成分的質粒或改變給yaofang式以提高整合能力等,需要提高對長期隨訪觀察的要求;反之,也可以對目前認為存在遲發風險的基因zhiliao載體進行修飾,以降低這些風險。長期表達,與其他產品相比,部分基因zhiliao產品的明顯特征是可以在患者靶細胞或基因修飾細胞中持續存在并編碼表達作用因子(功能性蛋白或基因表達調節元件),并通過長久或長期改變靶細胞或組織的功能來達到zhiliao效果。同時,由于基因zhiliao編碼的作用因子在體內的長期暴露或表達異常,可能產生與其功能相關的長期安全性風險,如細胞生長失控和惡性liu形成、自身免疫反應或其他無法預測的遲發性不良反應。南京整合位點安評通過分選CAR-T 細胞,對T細胞受體(TCR)β鏈庫進行深度測序(TCR-seq)以及慢病毒載體整合位點(LVIS)分析。
插入突變風險評估一些整合性載體(如逆轉錄病毒、慢病毒、轉座子)可將外源基因插入整合到細胞基因組中,這可能會導致關鍵基因突變或jihuo原基因,從而導致惡性liu風險增加。影響插入突變的關鍵風險因素包括:(1)載體的整合特征,如插入位點的偏好性;(2)載體的設計,如增強子、啟動子等構建元件的活性,影響鄰近基因的潛力;產生剪接突變體的潛在剪接位點或多聚腺苷酸信號等;(3)細胞載體拷貝數;4)轉基因表達產物的功能活性(如與細胞生長調控相關)和表達水平;5)靶細胞群的轉化可能性,這可能與細胞的分化狀態、增殖潛力、體外培養條件和體內植入環境等有關。
基因編輯產品建議觀察15年或至數據表明不再存在任何風險。?腺相關病毒載體建議觀察5年或至數據表明不再存在任何風險。以上長期隨訪時間的建議主要基于基因zhiliao的產品類型,具體產品的隨訪時間取決于產品的特性和體內存在時間、轉基因表達時間、遲發性不良反應的預期時間及發生率、受試者適應癥和預期生存期、給藥途徑、以及長期隨訪的其他觀察目的。隨著隨訪數據的積累,研究者和研究申辦方可能會根據產品的存在情況、轉基因表達和臨床表現的持續評估情況,延長或縮短長期隨訪的持續時間。如果研究申辦方認為其基因zhiliao產品安全性風險較低、無需開展長期隨訪臨床研究,或者希望變更隨訪時間,應合理說明依據或變更理由并與藥品監督管理部門進行溝通。慢病毒載體介導的轉基因整合位點研究方法。
?如果受試者體內出現載體陽性細胞的克隆性生長,或檢測發現基因整合位點在基因或相關基因附近,應縮短檢測間隔至不超過3個月并密切監測惡性liu征兆,直至檢測不到基因zhiliao載體。?對基于慢病毒/逆轉錄病毒載體的基因zhiliao產品,如出現與可復制xingbing毒可能相關的不良事件,還應開展可復制xingbing毒(replicablecompetentlentivirus/retrovirus,RCL/RCR)的檢測。關于基因編輯產品的特殊考慮基因編輯產品除了適用基因zhiliao產品的一般考慮以及整合性載體的特殊考慮外,長期隨訪中還應額外關注脫靶風險,量化評估脫靶活性和在靶活性之間的相關性,或利用在靶活性來預測脫靶活性的水平。如果基因zhiliao產品通過全身給yaofang式遞送,長期隨訪中的安全性監測不僅包括靶qiguan或靶組織的脫靶活性,而且還應包括可能發生在其他組織和qiguan中的脫靶活性。采用LM-PCR和全基因組重測序兩種方法,可以有效分析重組細胞外源序列的整合位點。杭州AAV整合位點服務
整合位點安評,推薦唯可生物,實驗實力強,專業性高,檢測效率高,結果準確率高。溫州載體整合位點安全性評價
由于免疫細胞zhiliao產品的長期存活及持久性作用,申請人應對臨床試驗期間接受zhiliao的所有受試者進行適當的長期隨訪,關注受試者生存、新發或繼發aizheng、ganran、免疫功能變化及遲發性不良反應等安全性風險,以及非臨床或臨床數據提示需要關注的潛在風險,并觀察產品在體內的持續存在時間、轉基因表達時間(如有)、是否有致瘤性、免疫原性等。隨訪時間主要取決于免疫細胞zhiliao產品的風險水平、體內的存活和作用時間、疾病進程的認識等,應足以觀察到可能由于產品特性、暴露性質等導致的受試者風險,并不應短于遲發不良事件的預期發生時間。溫州載體整合位點安全性評價