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北京分泌蛋白組學

來源: 發(fā)布時間:2022-05-19

通過蛋白質(zhì)組學+轉(zhuǎn)錄組學研究方法,發(fā)現(xiàn)大黃素引發(fā)外泌體通過抑制代謝通路來減少肺泡巨噬細胞的活化和改善肺部炎癥的特征,探究了外泌體在參與炎癥相關(guān)***損傷中的重要作用,為大黃素可以通過減少胰腺外泌體介導的肺泡巨噬細胞活化來減輕嚴重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷提供依據(jù)。中文標題:大黃素通過抑制胰腺外泌體介導的肺泡巨噬細胞活化減輕嚴重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷研究對象:大鼠血漿外泌體發(fā)表期刊:ActaPharmaceuticaSinicaB影響因子:11.413發(fā)表時間:2021年10月合作單位:四川大學華西醫(yī)院運用生物技術(shù):TMT標記定量蛋白組學(由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)、轉(zhuǎn)錄組學蛋白組+代謝組+脂質(zhì)組-數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)。北京分泌蛋白組學

隨著美國臨床蛋白質(zhì)組**分析項目(CPTAC)和中國人類蛋白質(zhì)組計劃(CNHPP)等大型蛋白質(zhì)組學研究計劃的推進,發(fā)表了一系列**的大規(guī)模人群多組學分析文章[2,3]。這些高分文章通過基因組學、轉(zhuǎn)錄組學、蛋白質(zhì)組學、磷酸化蛋白質(zhì)組學、代謝組學、微生物組學等技術(shù),在上百例的病例樣本中***表征了某種**的分子特征。對比這些文章,可以發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)在多組學數(shù)據(jù)分析中逐漸成為**結(jié)果,且蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析有些共同特點,即:1)基于蛋白質(zhì)組進行**分子分型2)分析不同亞型患者的臨床特征3)免疫、代謝、突變、微生物等**領(lǐng)域研究熱點在不同亞型中的差別分析4)篩選亞型特征分子作為預后標志物或潛在的藥靶進行驗證或機制研究該文是樊嘉院士/周虎研究員/高大明研究員/**教授團隊繼2019年Cell發(fā)表的肝細胞*多組學研究后,同樣基于蛋白質(zhì)組為**的多組學聯(lián)合分析策略,進一步闡釋了蛋白質(zhì)組學驅(qū)動精細醫(yī)學的優(yōu)勢,為**的發(fā)***展機制、分子分型、預后監(jiān)測和個性化***策略提供新思路。廣東磷酸化蛋白組學北京蛋白組學翻譯后修飾篩選,檢測,鑒定,定性,定量。

TMT標記定量蛋白組學研究案例:2021年11月,南京中醫(yī)藥大學附屬醫(yī)院江蘇省中醫(yī)院單位(一作劉史佳研究員)及其課題組在MolecularMetabolism期刊發(fā)表的題為“Serumintegrativeomicsrevealsthelandscapeofhumandiabetickidneydisease”的研究成果,通過TMT標記定量蛋白組學和GC-MS非靶代謝組學研究方法,發(fā)現(xiàn)了糖尿病腎病(DKD)特征,篩選了蛋白和代謝組合生物標志物。為優(yōu)化糖尿病腎病(DKD)管理提供了豐富且開放訪問的數(shù)據(jù)資源。中文標題:血清綜合組學揭示人類糖尿病腎病情況研究對象:人血清發(fā)表期刊:MolecularMetabolism影響因子:7.422發(fā)表時間:2021年11月1日合作單位:江蘇省中醫(yī)院運用生物技術(shù):TMT標記定量蛋白質(zhì)組學、GC-MS非靶向代謝組學(其中部分工作由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)、ELISA

文章使用TMT標記定量蛋白質(zhì)組學的方法,分析鑒定了差異表達的蛋白質(zhì),對下調(diào)的蛋白質(zhì)進行基因本體論(GO)分析,顯示下調(diào)參與線粒體電子傳遞鏈(ETC)的途徑富集,證明了TM處理特別影響了具有較高細胞內(nèi)銅水平的SOX2/OCT4+細胞中的線粒體ETC途徑。確定TM介導的銅依賴性線粒體復合物IV失活是SOX2/OCT4+群體中的主要代謝缺陷。研究結(jié)果確定了銅-代謝-轉(zhuǎn)移軸,并強調(diào)了其作為高危TNBC患者的下一代治療方法的潛力。蛋白質(zhì)組學分析確定了富含線粒體功能的途徑。細胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一種線粒體金屬酶,是線粒體ETC的終末酶。蛋白組學技術(shù)對腎錯構(gòu)瘤尿液差異蛋白的研究。

iTRAQ標記定量蛋白組學技術(shù)鑒定AHSG和RPL29分別是上調(diào)和下調(diào)*****的蛋白。301份肝*標本的統(tǒng)計分析表明AHSG與NMT1呈正相關(guān),而RPL29與NMT1呈負相關(guān)(圖8A)。此外,NMT1和AHSG均與**分期正相關(guān),而RPL29與肝*的**分期呈負相關(guān)(圖8B)。值得注意的是,NMT1和AHSG水平較高的肝*患者的生存率低于水平較低的肝*患者(圖8C)。而較高水平的RPL29表明存活率較高(圖8C)。這些數(shù)據(jù)表明NMT1、NUP和NDP與肝*的臨床結(jié)果密切相關(guān)。iTRAQ蛋白質(zhì)組學技術(shù)鑒定NMT1敲除時發(fā)生變化的蛋白質(zhì);蛋白驗證新技術(shù)-PRM,平行反應監(jiān)視蛋白組學。安徽蛋白組學 公司

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本研究采用串聯(lián)質(zhì)量標簽(TMT)標記的蛋白質(zhì)組學和平行反應監(jiān)測(PRM)技術(shù),對蓮子脫水過程中的生理調(diào)控網(wǎng)絡進行了深入研究表明,碳水化合物代謝(包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細胞壁組織)、ER中的蛋白質(zhì)加工、DNA修復和抗氧化事件對蓮種胎脫水有積極的反應。在蓮種胚脫水過程中,非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑,在脫水過程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結(jié)果為揭示荷花胚胎脫水保護機制的生理學調(diào)控網(wǎng)絡提供了酶途徑在抗氧化保護中起著主要作用。應激生理學檢測表明,H2O2是誘發(fā)氧化應激損傷的主要活性氧(ROS)成分,谷胱甘肽新的見解。北京分泌蛋白組學

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