蛋白組學技術可以提供細胞狀態和調控的功能信息，本研究建立了單細胞蛋白組學方法，實現了高靈敏度的蛋白組學檢測。該技術有助于揭示疾病的發病機制，探討預后和風險相關的不同腎臟疾病亞型中的蛋白組學異質性和獨特的蛋白標志物，為藥物靶點***提供希望。大規模單細胞分析對于捕獲復雜細胞系統中的生物異質性至關重要，但*基于RNA技術的單細胞轉錄組學數據并不能很好地**蛋白質水平上的變化。而單細胞蛋白組學技術能夠從蛋白質水平上破譯細胞機制并且獲得更多的信息。蛋白組學研究必看的經典綜述。遼寧蛋白組學火山圖

4D蛋白質組學分析發現，不同的病因和疾病的嚴重程度中蛋白表達存在差異。嚴重的疾病同急性期的蛋白的增加，補體系統蛋白及功能相關的蛋白相關；通過COVID-19和健康組對比，發現了49%的差異分析物；和膿毒癥相比，G-CSF，IL-8等在嚴重的COVID-19患者中含量更低；蛋白和臨床相關性分析則發現臨床特征和某些蛋白呈強相關性。本研究通過4D蛋白組學技術結合其他組學技術及免疫技術，確定了COVID-19免疫特征和宿主反應等相關因素，并為進一步COVID-19的***打下了良好的基礎。山東蛋白組學與代謝組學4D-蛋白組+代謝組雙平臺知識干貨帶您。

本研究通過生理和蛋白質組學分析在冬油菜中鑒定了大量的冷脅迫響應蛋白。探討了冬油菜耐凍性增強的機理和低溫脅迫對冬油菜形態和生理生化變化的影響。文章以耐凍型Longyou 7和冷敏感型Lenox為材料，通過iTRAQ標記蛋白組學和轉錄組學分析，揭示了谷胱甘肽轉移酶活性、碳水化合物結合和谷胱甘肽結合、代謝過程及IAA反應與冷應激反應密切相關，鑒定出了Longyou 7和Lenox之間的DAPs，這些DAPs參與氨基酸、碳水化合物、脂質和能量代謝，對提高冬油菜的耐凍性發揮了重要作用。

作者通過泛素化蛋白組學分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質。中文標題：氮調節茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成：多組學分析揭示的蛋白質水平調節研究對象：茶樹根發表期刊：JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子：5.279發表時間：2021年9月1日發表單位：安徽農業大學運用生物技術：TMT蛋白質組學、泛素化蛋白質組學(其中部分數據分析由鹿明生物提供技術支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝，通過蛋白質組和泛素化蛋白質組結合轉錄組數據探索了調節機制。本文的多組學數據整合分析思路值得借鑒。定量蛋白質組學 蛋白質進行質譜檢測未知蛋白進行全檢測。

作者運用iTRAQ標記定量蛋白組學對種子發育過程中蛋白質表達的定量比較，同時進行GO和KEGG通路富集分析。結果表明所有鑒定的蛋白被分為29類，主要涉及翻譯和碳水化合物代謝。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖。在三對比較中，普遍富集的途徑包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝。其中，參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非常活躍。為了評估轉錄組和蛋白質組之間的一致性，以及了解轉錄后的mRNA在蛋白質水平上是如何表現的，作者進行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯合分析。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。蛋白質組學多組學分析蛋白質組學研究進展。浙江蛋白組學差異

蛋白組學常見研究模式,蛋白樣本準備注意事項以及經典案例解讀。遼寧蛋白組學火山圖

TMT標記定量蛋白質組學研究案例：2021年12月威爾康奈爾醫學中心和紀念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發表的題為 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果，通過蛋白質組學和代謝組學研究方法，發現了高度轉移性 SOX2/OCT4+ 細胞的離散亞群表現出細胞內銅水平升高特征，探究了TM 介導的復合物 IV 失活確定為 SOX2/OCT4+ 細胞群中的主要代謝缺陷，AMPK/mTORC1 能量傳感器為重要的下游途徑。描繪了銅-代謝-轉移軸，為高風險三陰性乳腺*患者的下一代治療方法提供了理論依據。中文標題：銅耗竭調節線粒體氧化磷酸化以損害三陰性乳腺*轉移研究對象：高風險三陰性乳腺*(TNBC)發表期刊：NatureCommunications影響因子：14.919發表時間：2021年12月合作單位：紀念斯隆凱特琳**中心，Sandra和EdwardMeyer**中心運用關鍵生物技術：TMT標記定量蛋白質組學和靶向代謝組學遼寧蛋白組學火山圖

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