采用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對三個(gè)脫水特殊階段(21、27和40DAP)的新鮮蓮種胎進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析,共鑒定了5,477個(gè)蛋白質(zhì)。對測試樣本進(jìn)行了PCA分析,結(jié)果顯示,不同組間樣品具有很好的區(qū)分,每組的三個(gè)重復(fù)樣本被聚集在一起。PCA的前兩個(gè)成分占總方差的70%以上(圖2A)。三個(gè)試驗(yàn)組之間共有815個(gè)差異表達(dá)蛋白。其中,198個(gè)(32%)和198個(gè)(26%)蛋白質(zhì)豐度增加,而420個(gè)(68%)和558個(gè)(74%)蛋白質(zhì)豐度在27DAP和40DAP組分別下降(圖2B)。只有30個(gè)蛋白質(zhì)的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化(圖2C)。TMT/iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué) 差異表達(dá)蛋白質(zhì)組分析研究。江西糖蛋白組學(xué)
轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分析作者通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分析暴露于DON的C2C12細(xì)胞的差異基因(DEG)。轉(zhuǎn)錄組學(xué)鑒定了2387個(gè)DEG,其中72%被下調(diào)。蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定出402個(gè)DEG,其中74%被下調(diào)。GO和KEGG通路富集分析表明,轉(zhuǎn)錄組學(xué)DEGs參與了“男性主要性征的發(fā)育”、“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“骨骼肌收縮的調(diào)節(jié)”等生物學(xué)過程。**富集的通路是“ECM-受體相互作用”、“人**瘤病毒***”和“蛋白質(zhì)消化吸收”。蛋白質(zhì)組學(xué)分析中,富集到了“肌肉收縮”、“中間絲解聚”和“脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)”等生物學(xué)過程。細(xì)胞成分中富集到“細(xì)胞骨架”、“細(xì)胞外基質(zhì)”和“整合素”。KEGG通路富集到“新霉素、卡那霉素和慶大霉素生物合成”、“系統(tǒng)性紅斑狼瘡”、“ECM-受體相互作用”和“蛋白質(zhì)消化和吸收”。前兩條通路與上調(diào)的DEG相關(guān),而后兩條通路與下調(diào)的DEG相關(guān),這與轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)果一致。山東蛋白組學(xué)質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析蛋白組學(xué)近期研究進(jìn)展的盤點(diǎn)。
4D蛋白質(zhì)組學(xué):2022年3月,牛津大學(xué)Julian C. Knight教授課題組在cell發(fā)表的題為“A blood atlas of COVID-19 defines hallmarks of disease severity and specificity”的研究成果,通過4D蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組技術(shù)、流式技術(shù)、單細(xì)胞測序技術(shù)等研究方法,為不同COVID-19嚴(yán)重程度的患者提供了一個(gè)綜合的多組圖譜,并將其與流感和敗血癥患者與健康志愿者進(jìn)行了綜合比較,將支持未來的COVID-19藥物開發(fā)、臨床試驗(yàn)設(shè)計(jì)和個(gè)性化藥物方法。中文標(biāo)題:COVID-19的血液圖譜定義了疾病嚴(yán)重程度和特異性的特征研究對象:血液發(fā)表期刊:Cell影響因子:41.582發(fā)表時(shí)間:2022.3運(yùn)用生物技術(shù):4D蛋白組學(xué)技術(shù)
iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)研究方法:2021年12月歐易/鹿明生物合作客戶甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)孫萬倉教授課題組在Scientific Reports期刊發(fā)表的題為 “iTRAQ-Based Quantitative Proteome Analysis Insights into Cold Stress of Winter Turnip Rapa (Brassica rapa L.) Grown in the Field ”的研究成果,通過iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,探究了莖尖分生組織的形態(tài)對冬油菜低溫耐受性中的作用。中文標(biāo)題:iTRAQ標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)分析揭示了低溫脅迫對田間生長冬油菜的影響研究對象:白菜型冬油菜發(fā)表期刊:ScientificReports影響因子:4.17蛋白組學(xué)研究組織,血液,植物,尿液,動物,細(xì)胞樣品,酵母,微生物.。
作者通過iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)鑒定敲低NMT1后發(fā)生變化的蛋白質(zhì)。結(jié)果鑒定到三種上調(diào)蛋白(LXN,RPL29andFAU)和六種下調(diào)蛋白(NMT1,MTPN,AHSG,ALB,GON7andTF)(圖2A)。作者將這些蛋白質(zhì)分別命名為N-豆蔻酰化下調(diào)蛋白(NDP)和上調(diào)蛋白(NUP)。有趣的是,敲低NMT1會減少NDP和NUP的N-豆蔻酰化,而過表達(dá)NMT1會誘導(dǎo)NDP和NUP的N-豆蔻酰化(圖2B)。在小鼠模型中,敲除NMT1會導(dǎo)致NDP和NUP的去N-豆蔻酰化,這可以通過在肝臟中表達(dá)外源性NMT1來部分逆轉(zhuǎn)(圖2C)。這些發(fā)現(xiàn)表明,盡管NMT1對NDP和NUP的表達(dá)起著相反的作用,但NMT1同時(shí)刺激NDP和NUP的N-豆蔻酰化。蛋白質(zhì)組學(xué)測序 蛋白組學(xué)技術(shù)缺點(diǎn)。北京蛋白組學(xué)研究進(jìn)展
修飾蛋白質(zhì)組試-蛋白質(zhì)組學(xué) 解決方案。江西糖蛋白組學(xué)
通過蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定、PRM靶向鑒定、iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)等研究方法,發(fā)現(xiàn)了N-豆蔻酰化在肝臟**發(fā)生中發(fā)揮重要作用,揭示了NMT1的N-豆蔻酰化抑制抗**發(fā)生的NDP,并通過干擾泛素化來刺激促**發(fā)生的NUP機(jī)制。為靶向N-豆蔻酰化和NMT1可能有助于***肝*提供了理論依據(jù)。中文標(biāo)題:NMT1依賴于POTEE發(fā)生N-豆蔻酰化并通過差異調(diào)節(jié)靶標(biāo)的泛素化來刺激肝臟**的發(fā)生研究對象:細(xì)胞、小鼠、人**組織發(fā)表期刊:FrontiersinOncology影響因子:6.244發(fā)表時(shí)間:2021年5月合作單位:上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心運(yùn)用生物技術(shù):iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、PRM靶向驗(yàn)證、質(zhì)譜鑒定、qRT-PCR、IHC、WB、IP文章中iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持江西糖蛋白組學(xué)
上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司總部位于聯(lián)航路1188號25幢,是一家檢驗(yàn)檢測服務(wù)。(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動,具體經(jīng)營項(xiàng)目以相關(guān)部門批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn))一般項(xiàng)目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),會務(wù)服務(wù),企業(yè)管理咨詢。的公司。歐易生物深耕行業(yè)多年,始終以客戶的需求為向?qū)В瑸榭蛻籼峁└哔|(zhì)量的科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢。歐易生物始終以本分踏實(shí)的精神和必勝的信念,影響并帶動團(tuán)隊(duì)取得成功。歐易生物創(chuàng)始人張怡,始終關(guān)注客戶,創(chuàng)新科技,竭誠為客戶提供良好的服務(wù)。