使用TMT標記定量蛋白質組學分析，與GFP-群體相比，在GFP+細胞中TM處理后，線粒體復合物IV的多個亞基被特異性下調，對下調的蛋白質進行基因本體 (GO)分析，顯示參與線粒體電子傳遞鏈 (ETC) 的通路富集。同時作者還分析了從人 LM2 細胞系中分選的 LM2 GFP+和 GFP- 細胞，在 TM 處理 48 小時后蛋白組學分析，揭示了GFP+細胞優先富集，同時揭示了線粒體 ETC 相關的通路。因此，TM 處理特別影響具有更高細胞內銅水平的 SOX2/OCT4+ 細胞中的線粒體 ETC 通路。蛋白質組學分析確定了富含線粒體功能的途徑。細胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一種線粒體金屬酶，是線粒體ETC的終末酶。蛋白組學常見研究模式 | 蛋白質組專題_鹿明生物。吉林蛋白組學收費

2021年10月，中國科學院上海營養與健康研究所武愛波研究員課題組在《Ecotoxicology and Environmental Safety》（IF:6.291）發表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果，通過轉錄組學和蛋白質組學研究方法，探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇（簡稱：DON，俗稱嘔吐***）對成肌細胞分化的影響，發現了DON處理使得細胞骨架蛋白和細胞外基質蛋白表達下調，并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路的機理，為食品和飼料污染的防治提供了理論依據。其中轉錄組學和蛋白組學由歐易/鹿明生物提供技術支持。天津定量蛋白組學研究進展一站式服務,蛋白組學研究不同生物體在不同時刻/狀態下蛋白質表達的變化。

在本研究中，利用iTRAQ標記定量蛋白組學方法對東京野茉莉種子發育的4個時間點采樣進行蛋白質組學分析。獲得了2338個蛋白和1473個DEPs。Mfuzz聚類分析顯示，在種子發育過程中，轉錄本和蛋白質組之間存在相當大的時序一致性。在四個發育時期中，花后70天（種子發育活躍期）是視為東京野茉莉種仁發育的關鍵時期：在該階段與脂肪酸生物合成相關的功能基因和酶蛋白均達到表達峰值，同時種仁內部大部分營養物質開始迅速積累。通過轉錄組數據和蛋白質組數據綜合分析油脂合成的調控網絡，乙酰CoA羧化酶和**酸脫氫酶兩個酶體系處于中心位置，在脂肪酸的合成過程中具有主導作用。

iTRAQ標記定量蛋白組學技術鑒定AHSG和RPL29分別是上調和下調*****的蛋白。301份肝*標本的統計分析表明AHSG與NMT1呈正相關，而RPL29與NMT1呈負相關（圖8A）。此外，NMT1和AHSG均與**分期正相關，而RPL29與肝*的**分期呈負相關（圖8B）。值得注意的是，NMT1和AHSG水平較高的肝*患者的生存率低于水平較低的肝*患者（圖8C）。而較高水平的RPL29表明存活率較高（圖8C）。這些數據表明NMT1、NUP和NDP與肝*的臨床結果密切相關。iTRAQ蛋白質組學技術鑒定NMT1敲除時發生變化的蛋白質；蛋白質組學技術簡介及應用場景。

DIA蛋白組學：SAPHO綜合征是一種侵犯皮膚和骨骼的炎癥性疾病，其發病率低，表現形式多樣，診斷困難。2022年1月，由北京中醫藥大學課題組在J Proteomics.期刊發表的題為“Complement system deregulation in SAPHO syndrome revealed by proteomic profiling”的研究成果，通過DIA蛋白組學研究方法，***揭示了SAPHO患者的血清蛋白質組譜，為疾病診斷提供了潛在的生物標志物。同時作者發現補體系統抑制劑如CFH和C4BP在SAPHO綜合征中表達上調，這可能在SAPHO綜合征的發病機制中發揮重要作用。單細胞組學 單細胞蛋白組學 蛋白質組學 。山東清華大學 蛋白組學

蛋白組學近期研究進展的盤點。吉林蛋白組學收費

轉錄組學和蛋白質組學分析作者通過轉錄組學和蛋白質組學分析暴露于DON的C2C12細胞的差異基因（DEG）。轉錄組學鑒定了2387個DEG，其中72%被下調。蛋白質組學鑒定出402個DEG，其中74%被下調。GO和KEGG通路富集分析表明，轉錄組學DEGs參與了“男性主要性征的發育”、“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“骨骼肌收縮的調節”等生物學過程。**富集的通路是“ECM-受體相互作用”、“人**瘤病毒***”和“蛋白質消化吸收”。蛋白質組學分析中，富集到了“肌肉收縮”、“中間絲解聚”和“脂質轉運”等生物學過程。細胞成分中富集到“細胞骨架”、“細胞外基質”和“整合素”。KEGG通路富集到“新霉素、卡那霉素和慶大霉素生物合成”、“系統性紅斑狼瘡”、“ECM-受體相互作用”和“蛋白質消化和吸收”。前兩條通路與上調的DEG相關，而后兩條通路與下調的DEG相關，這與轉錄組學結果一致。吉林蛋白組學收費

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