通過蛋白質組學質譜鑒定、PRM靶向鑒定、iTRAQ標記定量蛋白組學等研究方法，發現了N-豆蔻酰化在肝臟**發生中發揮重要作用，揭示了NMT1的N-豆蔻酰化抑制抗**發生的NDP，并通過干擾泛素化來刺激促**發生的NUP機制。為靶向N-豆蔻酰化和NMT1可能有助于***肝*提供了理論依據。中文標題：NMT1依賴于POTEE發生N-豆蔻酰化并通過差異調節靶標的泛素化來刺激肝臟**的發生研究對象：細胞、小鼠、人**組織發表期刊：FrontiersinOncology影響因子：6.244發表時間：2021年5月合作單位：上海交通大學醫學院附屬上海兒童醫學中心運用生物技術：iTRAQ標記定量蛋白組學、PRM靶向驗證、質譜鑒定、qRT-PCR、IHC、WB、IP文章中iTRAQ標記定量蛋白組學由歐易/鹿明生物提供技術支持蛋白組+代謝組+脂質組-數據分析系統。山東蛋白組學特異細胞分析
為了更好地了解DON對C2C12細胞分化的影響，作者進行了轉錄組學和蛋白質組學的整合分析。共鑒定了149個共同的***差異基因（co-DEG），其中91%被共下調（圖3A）。15%的co-DEG屬于真核細胞骨架，其中大部分屬于肌動蛋白絲，少數是中間絲和微管的成分。對co-DEG進行GO分析，生物學過程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調節”條目。細胞組分中富集的**個條目是“纖維蛋白原復合物”、“細胞外空間”、“細胞外基質”、“細胞外區域”和“蛋白質細胞外基質”，這些都是細胞外成分（圖3B）。結果表明，DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細胞外成分的表達。通路富集分析富集到了“ECM-受體相互作用”、“蛋白質消化和吸收”、“人**瘤病毒***”和“粘著斑”等通路。山東蛋白組學特異細胞分析蛋白組學檢測一個樣多少錢。
運用生物技術：TMT標記定量蛋白質組學、PRM蛋白靶向驗證由鹿明生物提供技術支持：2021年12月，上海交通大學張荻課題組在Frontiers in Plant Science發表題為 TMT-Based Quantitative Proteomic Analysis Reveals the Physiological Regulatory Networks of Embryo Dehydration Protection in Lotus(Nelumbo nucifera)的研究成果，通過TMT標記蛋白質組學和平行反應監測蛋白靶向驗證(PRM)技術研究方法，構建了蓮花胚胎脫水保護的生理調控網絡。為揭示荷花種子長壽的脫水保護機制提供了新的見解。
TMT標記定量蛋白質組學研究案例：2021年12月威爾康奈爾醫學中心和紀念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發表的題為 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果，通過蛋白質組學和代謝組學研究方法，發現了高度轉移性 SOX2/OCT4+ 細胞的離散亞群表現出細胞內銅水平升高特征，探究了TM 介導的復合物 IV 失活確定為 SOX2/OCT4+ 細胞群中的主要代謝缺陷，AMPK/mTORC1 能量傳感器為重要的下游途徑。描繪了銅-代謝-轉移軸，為高風險三陰性乳腺*患者的下一代治療方法提供了理論依據。中文標題：銅耗竭調節線粒體氧化磷酸化以損害三陰性乳腺*轉移研究對象：高風險三陰性乳腺*(TNBC)發表期刊：NatureCommunications影響因子：14.919發表時間：2021年12月合作單位：紀念斯隆凱特琳**中心，Sandra和EdwardMeyer**中心運用關鍵生物技術：TMT標記定量蛋白質組學和靶向代謝組學蛋白組學，研究方法，高通量定性定量研究,有。
作者運用iTRAQ標記定量蛋白組學對種子發育過程中蛋白質表達的定量比較，同時進行GO和KEGG通路富集分析。結果表明所有鑒定的蛋白被分為29類，主要涉及翻譯和碳水化合物代謝。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖。在三對比較中，普遍富集的途徑包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝。其中，參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非常活躍。為了評估轉錄組和蛋白質組之間的一致性，以及了解轉錄后的mRNA在蛋白質水平上是如何表現的，作者進行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯合分析。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。蛋白組學翻譯后修飾篩選,檢測,鑒定,定性,定量。安徽蛋白組學技術
蛋白質組學基本策略 研究基礎 研究內容 研究意義背景。山東蛋白組學特異細胞分析
本研究通過生理和蛋白質組學分析在冬油菜中鑒定了大量的冷脅迫響應蛋白。探討了冬油菜耐凍性增強的機理和低溫脅迫對冬油菜形態和生理生化變化的影響。文章以耐凍型Longyou 7和冷敏感型Lenox為材料，通過iTRAQ標記蛋白組學和轉錄組學分析，揭示了谷胱甘肽轉移酶活性、碳水化合物結合和谷胱甘肽結合、代謝過程及IAA反應與冷應激反應密切相關，鑒定出了Longyou 7和Lenox之間的DAPs，這些DAPs參與氨基酸、碳水化合物、脂質和能量代謝，對提高冬油菜的耐凍性發揮了重要作用。山東蛋白組學特異細胞分析
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