本研究應用空間代謝組學能夠客觀地識別食管腺*。EA組磷脂富含長鏈、多不飽和的PGs。并且,遺傳學研究表明,這一機制與脂肪酸從頭合成有關。這些結果表明,空間代謝組學可以區分惡性食管中的組織類型。在臨床應用包括客觀診斷和術中切緣評估具有潛在價值。在獲得AFADESI平臺原創團隊全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已經完成共計近千例樣本經驗,包括心臟、腦、**、腸道、肝臟、腎臟、皮膚等十幾種組織樣本空間代謝組學檢測及分析。
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1.樣本準備Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射東莨菪堿后被殺死(處理組,3只),對照組大鼠(3只)也用同樣方法殺死。獲取大鼠整個大腦,在低溫下將大腦切成連續的矢狀切片(暴露出海馬和紋狀體),用于Nissl染色、H&E染色和質譜成像檢測。2.空間代謝組實驗使用AFADESI-MSI分析,代謝物質量數范圍50-500Da,質譜分辨率70,000。3.數據處理和代謝網絡分析原始數據經過轉化,再使用自建MassImager軟件獲取成像結果;在獲取差異代謝物的高分辨率質譜信息后,使用Metaboanalys在線數據挖掘軟件以褐家鼠(rattusnorvegicus)為參考完成代謝物高通量定性,并輸出代謝網絡信息。大腦中復雜網絡可視化使用Cyctoscope軟件完成。吉林空間代謝組學是什么空間代謝組學二維乃至三維的水平,極大拓展了對組學樣品信息的認知。
空間代謝組學:在大鼠腦繪制特定區域分布的極性代謝物圖譜使用AFADESI-MSI在正離子和負離子模式下分別獲得298個和372個微區輪廓清晰的代謝物離子圖像。使用精確分子量并結合同位素豐度,通過人類代謝組數據庫(HMDB)對離子圖像進行識別,鑒定出多種內源極性代謝物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神經遞質等。***系統(CNS)的特定功能和特定解剖區域相關。例如,乙酰膽堿在大腦皮層中高度表達;γ-氨基丁酸是一種抑制性神經遞質,其在大腦皮層的信號強度較低,在中腦、嗅球和下丘腦中的濃度較高。
質譜成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作為一種新型的分子影像技術,能夠直接從生物組織中獲得大量已知或未知的內源性代謝物和外源***物等分子的結構、含量和空間分布信息。相對于其他成像方法(如熒光成像、放射性標記成像等),該技術無需化學或放射性標記、不需復雜樣品前處理,具有高特異性、高通量和空間信息保留的突出優勢。質譜成像技術可以實現生物組織中上千代謝物的定性、定量和定位分析,結合生物信息學分析,發展為空間代謝組學方法,可從生物組織原位發現差異代謝物,并識別其生物學功能。空間代謝組性價比高.擁有專業技術團隊。
分子成像技術是研究大腦中DNA、RNA、蛋白質和代謝產物的強大工具。質譜成像技術(MSI)是一種檢測大腦中蛋白質、代謝物和脂質物質的高靈敏度和高通量分子成像技術,在**邊緣診斷、**生物標志物發現、藥物分布和機理闡述等領域有***的應用。本文作者開發了一種基于敞開式空氣動力輔助解吸電噴霧離子化質譜成像(AFADESI-MSI)技術的代謝網絡映射方法,對大鼠腦不同極性的小分子代謝物(m/z50-500Da)進行微區分布研究,不僅鑒定出腦部幾乎所有重要的代謝物,還繪制了包含神經遞質、嘌呤,有機酸,多胺,膽堿、碳水化合物和脂類等20條通路的代謝網絡,并使用這種代謝網絡映射質譜成像方法解析了東莨菪堿致大鼠記憶功能障礙模型腦的代謝變化,為***系統疾病的***提供新的信息和見解。空間代謝組突破傳統代謝組研究損失空間信息的瓶頸。江蘇空間代謝組學的質譜成像
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在空間上的代謝變化表明,在東莨菪堿***后,大鼠腦微區的代謝網絡發生紊亂。但是代謝物和代謝酶是代謝網絡的關鍵因素,基于空間分辨的代謝組學信息為發現酶或基因異常提供了線索,但若要完成完整的代謝網絡分析必須進一步驗證蛋白質和基因表達水平。本文作者開發了一種空間分辨代謝網絡作圖方法,通過無需衍生化、特定標記或復雜樣品預處理的高通量AFADESI-MSI方法和代謝組學策略,在具有復雜結構化腦組織中發現代謝分子變化。能檢測出多種極性內源性代謝物,并繪制相關代謝網絡,提供組織微區分布的圖譜。還將多種功能性小分子(例如核苷酸、多胺、肌酸、神經酰胺代謝物)含量分布可視化。四川玉米空間代謝組學
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