空間轉錄組的一般流程2。這使得在后續步驟中覆蓋細胞組織圖像和基因表達數據成為可能。用我們的滲透試劑對組織進行滲透，這意味著在細胞膜上形成小孔。RNA分子可以通過這些通道離開細胞，并與芯片上相鄰的捕獲探針結合。因此，基因表達信息被捕獲在芯片上。需要通過以下步驟將捕獲的RNA分子中存儲的信息轉換為數據。cDNA合成是為了創造穩定的雙鏈DNA分子。這是必要的，因為cdna - rna -雜交體的降解速度很快。此外，這是構建可測序文庫之前的必要步驟。所有之前收集的信息都被匯集起來，可以在線訪問。這意味著在實踐中，您可以查看組織切片的圖像并選擇組織中的不同區域。然后你可以確定哪些基因在這些區域中以什么數量表達。因此，你可以在一個單一的實驗中進行新分析。HE 染色適用于空間轉錄組的組織學呈現方法。遼寧空間轉錄組應用

單細胞轉錄組測序技術的如火如荼，伴隨著空間轉錄組測序技術的蓬勃發展，可以看到，在現有的高通量檢測技術領域，這兩種技術已為科學研究的發展提供了前所未有的技術支撐。從2019年單細胞多組學被評為《Nature Methods》年度技術進展，到2020年空間轉錄組技術也被評為年度技術進展，相信在接下來的時間里，單細胞轉錄組和空間轉錄組將為生命科學的發展做出極其重要的貢獻。單細胞轉錄組測序技術的特點在于提供詳實的每個細胞的轉錄表達信息，但是缺失了來源組織的空間組成信息。現有商用空間轉錄組測序技術的特點在于提供了完整的組織空間位置信息，但是每個捕獲spot的信息無法達到單細胞分辨率（10個左右細胞）。因此，這兩個技術的存在是天然互補的，而將兩者的結合也是水到渠成，完美結合。黑龍江應用空間轉錄組作者借助空間轉錄組測序技術探究人類心臟在發育過程中的基因表達特征和細胞圖譜變化。

第二，數據庫的建立。盡管當前空間轉錄組的數據在快速地增長，但尚未有對應的數據庫來對這些數據進行匯總集成。第三，研究物種及組織的多樣化。在當前時代，除 LCM 之外，研究的***主要集中于人類和小鼠的大腦，而其他***（例如肝臟）的空間轉錄組學研究相對滯后。對除人類和小鼠以外的其他生物以及除大腦以外的其他***的技術現代化，將為開發有用的空間轉錄組學地圖集提供廣闊的前景。第四，集成度高、交互性強、易擴展、文檔信息完善的開源工作流程的開發。該類工具的開發將簡化不同類型空間轉錄組學數據的整合和分析。

空間轉錄組數據分析的重要是根據每個芯片上每個spot的基因表達信息進行聚類，然后將spot根據坐標位置序列放回到組織的圖像上，同時可以對每個gene在組織上表達的空間位置進行定位。獲得測序數據后，首先利用Space Ranger 軟件可以自動化的對圖像進行處理、數據比對和Barcode處理。另外一個軟件Loupe Cell Browser是一個適用于Windows和MacOS的桌面應用程序，它可以快速、輕松地可視化和分析10X Visium數據。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破?？臻g轉錄組組織學板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像，記錄切片的形態學信息。

有哪些技術手段可以進行空間轉錄組研究？已發表的關于空間轉錄組技術有Slide-seq , LCM-seq , seqFISH, MERFISH , Liver single cell zonation , Geo-seq and Tomo-seq。這些方法或是在細胞數量上限制較大，或是存在有效測序深度不足等問題。10x Genomics公司提供的Visium空間基因表達解決方案是目前較好的一個高通量空間轉錄組的商業化解決方案。該解決方案可以輕松地將空間轉錄組學技術應用到組織切片和染色的標準方法中，從而研究空間分辨率下整個轉錄組mRNA的表達情況，同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息。空間轉錄組測序技術在進行 HE 染色的同時需要保證獲取組織基因表達信息。河南技術空間轉錄組

分享歐易生物在空間轉錄組樣本處理、實驗和數據挖掘上的成功經驗，助力各位科研工作者取得新的突破。遼寧空間轉錄組應用

空間轉錄組數據分析的是根據每個芯片上每個 spot 的基因表達信息進行聚類，然后將 spot 根據坐標位置序列放回到組織的圖像上，同時可以對每個 gene 在組織上表達的空間位置進行定位。獲得測序數據后，首先利用 Space Ranger  軟件可以自動化的對圖像進行處理、數據比對和 Barcode 處理。另外一個軟件 Loupe Cell Browser 是一個適用于 Windows 和 MacOS 的桌面應用程序，它可以快速、輕松地可視化和分析10X Visium 數據。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。遼寧空間轉錄組應用

上海歐易生物醫學科技有限公司總部位于聯航路1188號25幢，是一家檢驗檢測服務。（依法須經批準的項目，經相關部門批準后方可開展經營活動，具體經營項目以相關部門批準文件或許可證件為準）一般項目：生物醫藥產品、生化產品的研發，醫藥中間體、化工原料及產品（除危險品化學品、監控化學品、易制毒化學品）的研發、銷售，儀器儀表的銷售，并提供相關技術咨詢、技術服務，會務服務，企業管理咨詢。的公司。歐易生物作為檢驗檢測服務。（依法須經批準的項目，經相關部門批準后方可開展經營活動，具體經營項目以相關部門批準文件或許可證件為準）一般項目：生物醫藥產品、生化產品的研發，醫藥中間體、化工原料及產品（除危險品化學品、監控化學品、易制毒化學品）的研發、銷售，儀器儀表的銷售，并提供相關技術咨詢、技術服務，會務服務，企業管理咨詢。的企業之一，為客戶提供良好的科研服務，科研檢測，學術研究，技術咨詢。歐易生物繼續堅定不移地走高質量發展道路，既要實現基本面穩定增長，又要聚焦關鍵領域，實現轉型再突破。歐易生物始終關注醫藥健康行業。滿足市場需求，提高產品價值，是我們前行的力量。