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陜西歐易生物空間轉錄組

來源: 發布時間:2021-11-25

1. 空間轉錄組是一種用于從空間層面上解析RNA-seq數據的技術,從而解析單個組織切片中的所有mRNA。空間轉錄組的條形碼逆轉錄oligo(dT)引物在顯微鏡載玻片表面的有序附著,空間轉錄組使得在mRNA樣品處理和后續測序過程中位置信息的編碼和獲取成為可能。單細胞RNA測序或組織樣本RNA測序,均無法為研究人員提供精確的空間信息。通過空間轉錄組技術可獲取組織中具體的位置的轉錄信息,為研究和診斷提供有效數據支撐。10x Genomics空間轉錄組技術可以應用于免疫、發育、神經和病理等研究方向??臻g轉錄組組織學板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像,記錄切片的形態學信息。陜西歐易生物空間轉錄組

第二,數據庫的建立。盡管當前空間轉錄組的數據在快速地增長,但尚未有對應的數據庫來對這些數據進行匯總集成。第三,研究物種及組織的多樣化。在當前時代,除 LCM 之外,研究的***主要集中于人類和小鼠的大腦,而其他***(例如肝臟)的空間轉錄組學研究相對滯后。對除人類和小鼠以外的其他生物以及除大腦以外的其他***的技術現代化,將為開發有用的空間轉錄組學地圖集提供廣闊的前景。第四,集成度高、交互性強、易擴展、文檔信息完善的開源工作流程的開發。該類工具的開發將簡化不同類型空間轉錄組學數據的整合和分析。遼寧空間轉錄組空間轉錄組可以進行細胞間通訊分析,區別在于空間位置信息可以同時用于識別潛在的細胞間相互作用。

 **近,空間轉錄組學研究炙手可熱。細胞及其在組織樣本中的相對位置之間的關系對于理解疾病病理可能至關重要??臻g轉錄組學是一項開創性的技術,它使科學家能夠測量組織樣本中的所有基因活性,并繪制出發生該活性的位置的圖。該技術已經導致了新發現,這些新發現將有助于幫助科學家更好地了解生物過程和疾病。10x Genomics空間轉錄組技術可以應用于**、免疫、發育、神經和病理等研究方向。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗,致力通過質量的服務,助力各位科研工作者取得新的突破。

1. 空間轉錄組實驗步驟A。切片制備和優化:取新鮮組織、冷凍、切片,并進行HE染色成像,優化確定切片是否覆蓋靶向區域。空間轉錄組實驗步驟B。切片固定和透化:將組織切片放置在含有與RNA結合捕獲探針的載玻片上,并進行固定和透化,使細胞中的 mRNA 得到釋放,并結合到相應的捕獲探針上,從而獲取基因表達信息。空間轉錄組實驗步驟c。逆轉和文庫構建:以捕獲的 RNA 為模板,進行 cDNA 合成,和測序文庫制備??臻g轉錄組實驗步驟d。高通量上機測序:對制備好的測序文庫,進行二代高通量短讀長測序??臻g轉錄組實驗步驟e。數據可視化分析:結合HE結果,確定哪些基因有表達,表達量高低,以及這些基因的空間位置信息??臻g轉錄組的條形碼逆轉錄oligo(dT)引物在顯微鏡載玻片表面的有序附著。

單細胞轉錄組測序技術的如火如荼,伴隨著空間轉錄組測序技術的蓬勃發展,可以看到,在現有的高通量檢測技術領域,這兩種技術已為科學研究的發展提供了前所未有的技術支撐。從2019年單細胞多組學被評為《Nature Methods》年度技術進展,到2020年空間轉錄組技術也被評為年度技術進展,相信在接下來的時間里,單細胞轉錄組和空間轉錄組將為生命科學的發展做出極其重要的貢獻。單細胞轉錄組測序技術的特點在于提供詳實的每個細胞的轉錄表達信息,但是缺失了來源組織的空間組成信息。現有商用空間轉錄組測序技術的特點在于提供了完整的組織空間位置信息,但是每個捕獲spot的信息無法達到單細胞分辨率(10個左右細胞)。因此,這兩個技術的存在是天然互補的,而將兩者的結合也是水到渠成,完美結合。scRNA-seq 技術的進步啟發了利用高分辨率轉錄組定量分析與空間轉錄組學數據的互補性質的新方法。河南歐易生物空間轉錄組價格

作者通過對三個人類腦皮層組織的空間轉錄組測序,可評估不同腦皮層區域中基因表達特征和細胞類型定位情況。陜西歐易生物空間轉錄組

10xVisium空間轉錄組技術原理為將新鮮冷凍的組織切片,置于文庫制備載玻片上,經過固定、染色和透化后,釋放出mRNA,mRNA與空間條形碼捕獲探針相結合,從而捕獲基因表達信息。然后將捕獲的mRNA合成cDNA并制備測序文庫進行測序,并對數據進行可視化分析??臻g轉錄組技術作為當今**前沿的科研技術,相信很多老師都希望將其運用于自己的課題中,快速發表高分文章。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗,致力通過質量的服務,助力各位科研工作者取得新的突破。陜西歐易生物空間轉錄組

上海歐易生物醫學科技有限公司擁有檢驗檢測服務。(依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動,具體經營項目以相關部門批準文件或許可證件為準)一般項目:生物醫藥產品、生化產品的研發,醫藥中間體、化工原料及產品(除危險品化學品、監控化學品、易制毒化學品)的研發、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關技術咨詢、技術服務,會務服務,企業管理咨詢。等多項業務,主營業務涵蓋科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢。公司目前擁有專業的技術員工,為員工提供廣闊的發展平臺與成長空間,為客戶提供高質的產品服務,深受員工與客戶好評。公司以誠信為本,業務領域涵蓋科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢,我們本著對客戶負責,對員工負責,更是對公司發展負責的態度,爭取做到讓每位客戶滿意。公司深耕科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢,正積蓄著更大的能量,向更廣闊的空間、更寬泛的領域拓展。

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