10x Genomics空間轉錄組技術的準確性高嗎?下圖是一個將10x Genomics空間轉錄組技術應用于小鼠海馬體研究的案例。A圖為腦組織切片的HE染色結果,從10x Genomics空間轉錄組分析結果中,可以清晰看到Tmsb4x(B圖)和Selenow(C圖)在海馬體區域高表達,和已知的研究結果一致性較高。開展10x Genomics空間轉錄組需要做哪些準備?空間轉錄組是一項十分前沿的技術,涉及到很多細節方面的準備工作,例如組織類型的選擇、前期預實驗的設計、病理區域的確認等一系列內容。而且實驗中存在很多不確定性因素,處理不慎容易導致整個項目失敗。如何通過“HE染色”判斷空間轉錄組項目樣本是否為“好的樣本”呢?江西空間轉錄組報價
空間轉錄組的一般流程。將準備好的新鮮冷凍組織切片放置于空間轉錄組芯片上。每個細胞中的RNA分子都包含著基因表達的信息。組織切片成像,以檢索組織學信息。這樣就可以看到一個細胞或一組細胞在組織中的位置。空間轉錄組芯片上含有上千個捕獲的spot,這些捕獲探針的 Poly-T 尾可以結合RNA分子的 Poly-A 尾。這些陣列的排列順序就像一個棋盤,帶有相同身份條形碼(barcode)的探測位于同一個正方形中。這樣就可以確定每個捕獲探針及其結合RNA的來源。組織切片固定。該芯片包含一個與組織切片一起成像的視覺可檢測框架。四川歐易生物空間轉錄組質量細胞通訊是單細胞研究中一個模擬與理解復雜組織生態系統動力學的適用方法。
10xVisium空間轉錄組技術原理為將新鮮冷凍的組織切片,置于文庫制備載玻片上,經過固定、染色和透化后,釋放出mRNA,mRNA與空間條形碼捕獲探針相結合,從而捕獲基因表達信息。然后將捕獲的mRNA合成cDNA并制備測序文庫進行測序,并對數據進行可視化分析。空間轉錄組技術作為當今**前沿的科研技術,相信很多老師都希望將其運用于自己的課題中,快速發表高分文章。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗,致力通過質量的服務,助力各位科研工作者取得新的突破。
本文利用空間轉錄組學研究了在AD小鼠模型中,淀粉樣斑塊周圍直徑為100mm的組織域中發生的轉錄變化。發現了富含髓鞘和少突膠質細胞基因(OLIGs)的基因共表達網絡的早期改變,而斑塊誘導的基因(PIGs)的多細胞基因共表達網絡涉及補體系統、氧化應激、溶酶體和炎癥,在疾病的后期非常突出。此外作者通過對小鼠和人腦切片進行原位測序(ISS),證實了大多數觀察到的細胞水平的變化。空間轉錄組學分析為探究AD和其他腦部疾病致病特征附近失調的細胞網絡提供了可能。研究的***主要集中于人類和小鼠的大腦,而其他***(例如肝臟)的空間轉錄組學研究相對滯后。
1. 10x Genomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區域,每個捕獲區域的大小為6.5x6.5mm,包含5000個被條形碼標記的點(barcoded spots),每個點的直徑為55 μm,點和點之間中心的距離為100 μm,并且每個點都有一個barcode序列。10X Visium空間轉錄組的實驗主要分為兩部分:組織學板塊和組學板塊。組織學板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像,記錄切片的形態學信息;組學板塊包括cDNA的合成、擴增、接頭連接和測序,記錄切片的轉錄本信息和空間位置信息 。空間轉錄組使得在mRNA樣品處理和后續測序過程中位置信息的編碼和獲取成為可能。浙江歐易生物空間轉錄組
Science發表了將組織擴展和原位RNA測序結合起來的新型空間轉錄組技術ExSeq。江西空間轉錄組報價
歐易生物自引進10x Visium空間轉錄組以來已經完成了上百例樣本測序,在樣本包埋、切片、實驗和數據分析上積累了大量寶貴的經驗。本次培訓班旨在跟廣大科研工作者介紹空間轉錄組的研究熱點和方案設計,分享歐易生物在樣本處理、實驗和數據挖掘上的成功經驗,助力各位科研工作者取得新的突破。招生對象:A、對空間轉錄組感興趣,期望了解空間轉錄組技術,或近期準備開展空間轉錄組測序項目B、項目已經開展,需要深入挖掘數據的科研工作者。江西空間轉錄組報價
上海歐易生物醫學科技有限公司擁有檢驗檢測服務。(依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動,具體經營項目以相關部門批準文件或許可證件為準)一般項目:生物醫藥產品、生化產品的研發,醫藥中間體、化工原料及產品(除危險品化學品、監控化學品、易制毒化學品)的研發、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關技術咨詢、技術服務,會務服務,企業管理咨詢。等多項業務,主營業務涵蓋科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢。公司目前擁有較多的高技術人才,以不斷增強企業重點競爭力,加快企業技術創新,實現穩健生產經營。公司以誠信為本,業務領域涵蓋科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢,我們本著對客戶負責,對員工負責,更是對公司發展負責的態度,爭取做到讓每位客戶滿意。公司力求給客戶提供全數良好服務,我們相信誠實正直、開拓進取地為公司發展做正確的事情,將為公司和個人帶來共同的利益和進步。經過幾年的發展,已成為科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢行業出名企業。