空間轉錄組數據分析的是根據每個芯片上每個 spot 的基因表達信息進行聚類，然后將 spot 根據坐標位置序列放回到組織的圖像上，同時可以對每個 gene 在組織上表達的空間位置進行定位。獲得測序數據后，首先利用 Space Ranger  軟件可以自動化的對圖像進行處理、數據比對和 Barcode 處理。另外一個軟件 Loupe Cell Browser 是一個適用于 Windows 和 MacOS 的桌面應用程序，它可以快速、輕松地可視化和分析10X Visium 數據。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。空間轉錄組避免了組織中細胞位置信息的丟失。黑龍江品質空間轉錄組

空間轉錄組的應用有哪些？一、發現疾病的空間異質性：同時了解患病組織中的細胞類型及其定位有助于解決空間分辨的轉錄組學問題。在不同的環境下，明智地選擇這些方法在生物學研究中也是至關重要的，例如在神經科學中，基于FISH的方法很普遍；基于LCM的方法適用于小樣本（例如臨床樣本）以及整個轉錄組或基因組分析。二、構建空間轉錄組圖譜：借助于空間分辨的單細胞轉錄組學，建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結構的重要步驟。目前的多項研究通過單細胞轉錄組技術結合空間轉錄技術，得到多個***的時空轉錄組圖譜（相關研究后續會在如下專輯更新）。四川歐易生物空間轉錄組質量歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。

空間基因表達技術能夠在保留空間背景信息的同時，多方位測量轉錄組譜。然而，現有的分析方法并沒有解決技術分辨率有限或有效利用空間信息的問題。來自美國的科研團隊開發了BayesSpace，這是一種完全貝葉斯統計方法，它使用來自空間鄰域的信息來增強空間轉錄組數據的分辨率并進行聚類分析。BayeSpace通過使用的Bioconductor SingleCellExperiment數據結構將預處理數據作為輸入，無縫集成到空間轉錄組分析工作流中，輸出同樣存儲在SingleCellExperiment對象中，該對象可用于下游分析。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。

歐易生物自引進10x Visium空間轉錄組以來已經完成了上百例樣本測序，在樣本包埋、切片、實驗和數據分析上積累了大量寶貴的經驗。本次培訓班旨在跟廣大科研工作者介紹空間轉錄組的研究熱點和方案設計，分享歐易生物在樣本處理、實驗和數據挖掘上的成功經驗，助力各位科研工作者取得新的突破。招生對象：A、對空間轉錄組感興趣，期望了解空間轉錄組技術，或近期準備開展空間轉錄組測序項目B、項目已經開展，需要深入挖掘數據的科研工作者。空間轉錄組學和 10X Visium 依靠這種微陣列技術，區別在于微陣列載玻片上的組織上的轉錄本信息。

當前的技術主要有四種策略：1、基于組學實驗結合空間重建的計算策略。這種計算方法可以充分利用內在基因表達模式或共表達的趨勢，從單個細胞的大量轉錄組數據中重構細胞間的環境。然而，這些推論方法在某些情況下*呈現空間趨勢或特定組織的總體布局。2、激光切割與NGS測序結合的策略。基于LCM的轉錄組學或基因組學成功地獲得了單個細胞的空間轉錄組，盡管其通量很低，但是在可以標記成千上萬個單個細胞位置的多路復用條形碼策略可行之前，將少量細胞的數據粗略地整合到構成***的巨大背景中，可能具有一定價值。3、基于熒光物質原位的轉錄組學。基于圖像的原位轉錄組學在很大程度上增加了可檢測區域，但也存在一些問題，例如幾種smFISH方法很難從包括信號干擾、轉錄本積累等復雜背景中提取單個細胞。4、基于寡核苷酸的空間條碼加上NGS測序。費用較高且無法在單個細胞中獲得轉錄組。空間轉錄組是一項前沿技術，涉及到很多細節方面的準備工作。浙江歐易生物空間轉錄組是什么

研究通過對 ALS 小鼠疾病進程（癥狀前、發病、癥狀期和終末期）的脊髓組織進行空間轉錄組測序。黑龍江品質空間轉錄組

空間轉錄組（Spatial Transcriptomics）就是將基因的表達情況與關注的組織切片的免疫化學染色圖像進行整合，從而將組織內不同細胞的基因表達信息定位到組織的原始空間位置上去，進而直接觀測組織中不同部位功能區基因表達的差異。空間轉錄組技術利用了常規的原位技術和組學技術兩方面的優勢。目前已發表的關于空間轉錄組技術有主要有 Spatial Transcriptomics, Slide-seq, LCM-seq, seqFISH, MERFISH, Liver single cell zonation, Geo-seq 和 Tomo-seq, 涉及物種有人、小鼠、果蠅、秀麗隱桿線蟲、斑馬魚、擬南芥、楊樹和云杉等。黑龍江品質空間轉錄組

上海歐易生物醫學科技有限公司主營品牌有歐易生物，發展規模團隊不斷壯大，該公司服務型的公司。公司是一家私營合伙企業企業，以誠信務實的創業精神、專業的管理團隊、踏實的職工隊伍，努力為廣大用戶提供***的產品。公司始終堅持客戶需求優先的原則，致力于提供高質量的科研服務，科研檢測，學術研究，技術咨詢。歐易生物自成立以來，一直堅持走正規化、專業化路線，得到了廣大客戶及社會各界的普遍認可與大力支持。