空間轉錄組的應用有哪些？一、構建空間轉錄組圖譜：借助于空間分辨的單細胞轉錄組學，建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結構的重要步驟。目前的多項研究通過單細胞轉錄組技術結合空間轉錄技術，得到多個***的時空轉錄組圖譜（相關研究后續會在如下專輯更新）。二、描繪胚胎發育和空間藍圖：胚胎發育是一個復雜的過程，其中動態變化在生物分子水平上迅速發生。對這種微觀變化的時間和空間方面的分析都具有挑戰性。預期使用空間轉錄組學技術可以表征胚胎發育的空間表達藍圖。通過培訓系統掌握空間轉錄組測序原理和方案設計思路，助力科學研究。甘肅空間轉錄組價格

Visium空間轉錄組能夠做何種組織類型以及推薦切片厚度是什么？10X Genomics測試過很多組織類型，絕大多數都可以用于空間轉錄組的分析。下圖是他們官網上測試過的組織類型的列表，測試過的組織都可以運用在空間轉錄組的分析上面。但建議用戶用基因表達玻片做正式實驗前，務必用組織優化的玻片測試一下，看組織能否用于空間轉錄組的實驗，同時也找到比較好的組織通透時間。切片厚度基本上以10μm為主，但也有少量組織例外。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。山西10x空間轉錄組正是由于空間轉錄組可以從多維度解析生物學過程的特點得到蓬勃發展。

高通量空間轉錄組學數據的處理和分析需要新穎的方法和工具支撐，尤其是在預處理、scRNA-seq 數據的空間重構、基于微陣列數據的細胞類型去卷積、空間高變基因的識別、細胞間相互作用的推導等。scRNA-seq 技術的進步啟發了利用高分辨率轉錄組定量分析與空間轉錄組學數據的互補性質的新方法。對于未進行轉錄組測序的 smFISH 和 ISS 數據，可通過 scRNA-seq 數據估算空間數據中未分析的基因的表達模式。此外，“空間轉錄組學”這一術語的變體，也用于描述將轉錄本定位到細胞器的技術（例如 APEX-seq），盡管該技術沒有記錄任何空間坐標。

轉錄本的空間位置信息可以通過在原位陣列上捕獲的組織切片中的轉錄本來獲取，目前已有多種技術策略被開發報道， 如空間轉錄組技術（Spatial Transcriptomics，ST）和 Visium 技術，通過將包含空間位置信息的條形碼、UMI 標簽、poly-dT 的探針固定在商用微陣列載玻片上，來捕獲包含 poly(A) 尾巴的轉錄本，并獲取全轉錄組水平的基因表達及位置信息。一些無需成像即可計算重建空間基因表達模式所需信息的技術也被開發了出來，其中之一就是是 DNA 顯微技術，它記錄 cDNA 之間的接近度，該信息可用于重建轉錄本之間的相對位置。對于 EDA 以外的任務，用戶仍然經常需要學習新的語法，轉換對象類型，空間轉錄組學仍然面臨許多挑戰。

10x Genomics空間轉錄組的實現原理是什么？10x Genomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區域，每個捕獲區域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個被條形碼標記的點（barcoded spots），每個點的直徑為55 μm，點和點之間中心的距離為100 μm，并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA，遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列，然后進行文庫構建并進行測序。根據數據的條形碼信息對數據進行分析，以確定哪些數據來自哪個位置，從而實現空間基因表達的可視化。 空間轉錄組樣本的組織切片的細胞中會釋放出mRNA，遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列。廣東歐易生物空間轉錄組質量

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早期空間轉錄組學的另一條發展路線是基因捕獲和增強子捕獲篩選，開發于二十世紀八十年代，當時 DNA 測序通量正在增加，動物基因組是新開放的前沿領域。果蠅和小鼠的篩選是在八十年代后期進行的，目的是觀察未靶向且通常未知的基因表達情況。隨著通量的增加，增強子和基因捕獲技術在九十年代成為空間轉錄組學的技術，直到 WMISH 在九十年代后期興起。WMISH 技術的自動化程度較高，避免了對轉基因品系的依賴，同時由于在二十一世紀初獲得物種的參考基因組信息變得越來越便利，探針設計因此也更為方便。甘肅空間轉錄組價格

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