烈冰生信團隊傾情研發的NovelBrain?生信大數據分析平臺，針對龐大的單細胞測序數據，能夠實現細胞類型鑒定的快、精、準：一鍵導入gene list構建個性化基因列表；輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot；任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型；一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖：輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖，還可以通過調節寬、高和系數比例來調節美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板，幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現分析工具和模板的快速調用和一站式全流程自動化分析，節省工作時間并提升整體工作效率。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量測序服務。烈冰科技單細胞測序數據分析培訓班

現有的單細胞測序技術陣營在幾個主要領域存在差別。一個是分隔單個細胞以在其中進行微反應的物理平臺。在這個空間，單個細胞的內容物釋放，轉錄本或其他生物分析物被標記或添加索引，以便下游識別。現有技術的另一個主要區別是如何添加索引，就像生成測序文庫所涉及的流程步驟一樣。10X Genomics單細胞測序平臺采用動態微流控技（Drop-Seq具有類似的技術原理）。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠，其中一列縱向孔道輸入細胞，凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上，并通過微流控技術，將之輸入到第二縱向孔道，即油相孔道中。這時候，就形成了一個個油滴并輸出并收集在EP管中。每一個油滴中會落入一個細胞以及一個凝膠微珠，那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，構成我們的捕獲凝膠微珠。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構建文庫。吉林10X Genomics單細胞測序商業化服務烈冰開展了單細胞轉錄組、單細胞多組學以及空間轉錄組等多種產品在內的全套科研解決方案。

10X Genomics 是一種基于 drop 的微流控技術，液體在配套芯片中的微管道中流動，因此細胞直徑會受到芯片中微管道直徑的限制，微流體通道的直徑約為 50 ~ 60 um，因此捕獲細胞的直徑不能超過 40um。當細胞直徑過大時，容易出現管道堵塞，造成GEM生成失敗，對于神經科學研究和心血管疾病研究的老師而言，準備采用單細胞技術用于課題研究的時候，往往會遇到一個尷尬的問題，就是目標細胞，例如神經元細胞、成熟心肌細胞由于體積過大，不適用于 10X 單細胞技術。其中神經元細胞的直徑很大，直接超過了芯片中管道的直徑，雖然心肌細胞直徑低于 50um，但是成熟心肌細胞的長度很長，有可能堵塞通道造成實驗失敗，這也是為什么現在很多已發表的心臟單細胞文章，主要研究方向是心臟發育的原因了，主要還是因為未發育成熟的心肌細胞比較小，不會出現堵塞管道的風險。因此可以考慮組織解離后過 40um 濾網，過濾掉大細胞，避免出現管道堵塞、實驗失敗的風險。此種方案的缺點是大細胞被過濾掉，丟失相關細胞數據；另外組織解離獲得高質量細胞懸液以后，繼續做細胞裂解抽細胞核，開展細胞核測序。具體可訪問烈冰官網給我們留言，烈小冰將安排專業技術為您詳細解答。

10× Genomics單細胞方案要求使用具有較高活性的單細胞懸液。在實際實驗中，我們發現因為樣本類型和制備單細胞懸液方法的不同，容易出現單細胞懸液中死亡細胞的比例較高的情況。去除單細胞懸液中的死細胞和其他污染物對獲得高質量數據是至關重要的。這是因為，死亡的細胞易裂解導致其中的RNA釋放出來。這種cell-free RNA會導致檢測的背景噪聲，并會影響單細胞數據的質量。因此當樣本活性較差時，對細胞懸液中細胞活性檢測后，需要進行一般死細胞去除的工作（一般懸液活性小于70%時考慮此操作），以保證較高的上機捕獲細胞的質量。烈冰科技成立10余年，為科研學者提供專注的測序數據分析服務。

烈冰生物成立于2010年，與時俱進，堅持為科研學者提供國際前沿的高通量測序實驗和深度的生物信息數據分析服務，已逐步發展為單細胞多組學檢測服務****。專注于“單細胞測序系列技術服務”的專精領域，在上海、北京、廣州、西安和江西等地擁有數千平辦公場所，并布局多中心產品研發生產基地和營銷、運營中心。2016年起連續被評為上海市****，60+項自主知識產權，轉化率近80%。產品覆蓋從單細胞測序，核測序，單細胞多組學，空間轉錄組測序等多組學聯合的實驗+數據分析全流程服務平臺。為600+國內高校和醫院、5000+深度合作學者用戶、10000+生命科學探索的重要科研項目在醫藥開發、科學研究、醫學及臨床研究，疾病分子標志物篩選、生命和神經發育研究等提供多層次、多組學檢測服務和解決方案，助力300+CNS國際學術期刊文章發表，30+篇單細胞技術聯合（助力）發文，IF 10+文章占比＞65%。全線搭建10X Genomics Chromium X單細胞實驗測序平臺。西安高通量測序單細胞測序百萬通量平臺

測序的革新讓科學研究從個體基因差異逐漸轉為個體細胞的基因差異。烈冰科技單細胞測序數據分析培訓班

單細胞轉錄組測序是在單細胞水平上高通量測序分析基因表達譜的技術，突破傳統高通量測序的局限性，組織解離后，單個樣本一次上機能捕獲500-20000個細胞， 基于每個細胞分別建庫測序，獲得單個細胞的基因結構和基因表達狀態，并鑒定細胞的類型，可以在不同樣本間從細胞類型的組成和豐度角度進行比較，反映細胞間的異質性。而2021年橫空出世的10X Genomics Chromium X平臺實現了單塊chip上的百萬級別通量的細胞捕獲，系統實現16個通道同時運行，每個通道可捕獲2000-20000個細胞（不混樣），并支持原Chromium Controller體統外的多種細胞捕獲百萬級別通量實驗，可準確鑒別稀有細胞類型和適配大規模單細胞研究。烈冰科技單細胞測序數據分析培訓班

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