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上海BD單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)服務(wù)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-07-11

單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)再樣本細(xì)胞上機(jī)分選簽,需要對(duì)細(xì)胞數(shù)量、細(xì)胞活性進(jìn)準(zhǔn)判斷,這對(duì)Single Cell分選標(biāo)記、建庫(kù)、下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細(xì)胞計(jì)數(shù)偏高,將會(huì)影響建庫(kù)的成功率;計(jì)數(shù)偏低,則會(huì)提高雙細(xì)胞的比例;而細(xì)胞活率過(guò)低,就會(huì)使測(cè)序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣,因此把好單細(xì)胞懸液質(zhì)量這一關(guān)尤為重要。而在鋪板過(guò)程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,不同的液體流速將直接影響單細(xì)胞的入孔效果。因此烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分選平臺(tái)配套了專門定制的電動(dòng)移液器,其具有Prime Treat、Cell Load、Bead Load、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式,來(lái)對(duì)應(yīng)各種不同的操作。通過(guò)已經(jīng)設(shè)定的程序來(lái)控制液體的流速,大幅度降低人為操作習(xí)慣帶來(lái)的差異,保證實(shí)驗(yàn)操作的一致性。高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)測(cè)序一次突破性的改變,一次對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條核酸序列進(jìn)行測(cè)定。上海BD單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)服務(wù)

相對(duì)于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問(wèn)題,BD平臺(tái)普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-10000不等的測(cè)序細(xì)胞量,特殊研究需求的項(xiàng)目,可提供上限40000個(gè)細(xì)胞的捕獲量(單個(gè)樣本)。這個(gè)量級(jí)的測(cè)序細(xì)胞量已經(jīng)可以說(shuō)能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此,對(duì)于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上,無(wú)論是從細(xì)胞數(shù)量上來(lái)說(shuō)還是表達(dá)檢測(cè)可靠性來(lái)說(shuō),都會(huì)更實(shí)用。此外針對(duì)特殊項(xiàng)目研究,如需要捕獲和分析脆弱的細(xì)胞,如粒細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、CAR-T細(xì)胞、干細(xì)胞、移植瘤細(xì)胞、骨髓瘤細(xì)胞等,烈冰生BD平臺(tái)也有更好的捕獲效能,滿足您的實(shí)際需求。蘇州BD VDJ單細(xì)胞平臺(tái)個(gè)性化制定測(cè)序項(xiàng)目方面,滿足從檢測(cè)基因到蛋白的多組學(xué)測(cè)序要求。

烈冰生物搭建近10臺(tái)BD Rhapsody平臺(tái),目前為全國(guó)范圍內(nèi)的高校、醫(yī)院和研究所等單位的科研學(xué)者提供服務(wù),BD Rhapsody平臺(tái)采用U型微孔板,1個(gè)板即對(duì)應(yīng)1個(gè)樣本(不混樣的情況下),每個(gè)通道一般捕獲細(xì)胞數(shù)在1000-10000個(gè)之間,而上限可捕獲40000細(xì)胞時(shí)也能獲得較低的雙細(xì)胞率,此外,單個(gè)細(xì)胞捕獲效率高達(dá)80%,可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類型,有利于稀有樣本或小細(xì)胞量類型樣本研究;細(xì)胞可適性高,對(duì)細(xì)胞大小(直徑超過(guò)40um細(xì)胞需要制備成細(xì)胞核)及類型無(wú)限制。細(xì)胞捕獲周期較短,能夠?qū)崿F(xiàn)自動(dòng)分離,且實(shí)驗(yàn)端捕獲細(xì)胞過(guò)程全程可視化進(jìn)行,保障每一例珍貴樣本實(shí)驗(yàn)的成功進(jìn)行,1天內(nèi)可完成從細(xì)胞懸液到cDNA文庫(kù)構(gòu)建的所有的測(cè)序準(zhǔn)備工作。

樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,在對(duì)細(xì)胞進(jìn)行清洗和計(jì)數(shù)后,單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上,直至用于后續(xù)的上機(jī)和文庫(kù)制備步驟。在理想狀況下,一旦制備好樣本,應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而,您還有必要了解各類細(xì)胞的不同性質(zhì),因?yàn)檫@可能會(huì)影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時(shí)間,以及它們?cè)谥苽浜蠖嗑帽銘?yīng)當(dāng)被盡快使用。例如,有些細(xì)胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時(shí)間,它們就開(kāi)始形成團(tuán)塊。這些團(tuán)塊很難解離,增加了堵塞的風(fēng)險(xiǎn),而且每個(gè)團(tuán)塊被當(dāng)成單細(xì)胞計(jì)數(shù),又降低了細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性。此外,有些細(xì)胞更加粘稠,形成團(tuán)塊的速度更快。對(duì)于這些細(xì)胞,必須盡量減少制備和使用之間的時(shí)間差。烈冰對(duì)于一個(gè)細(xì)胞群體中的每個(gè)細(xì)胞單獨(dú)進(jìn)行建庫(kù)測(cè)序分析。

針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞上樣數(shù),為什么不建議捕獲到的細(xì)胞數(shù)量越高越好?一味地追求高數(shù)量的細(xì)胞捕獲可能會(huì)存在一些問(wèn)題。例如在上機(jī)細(xì)胞懸液濃度固定時(shí),如果目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)增加到8000甚至10000,上樣細(xì)胞懸液體積勢(shì)必增加,在細(xì)胞懸液質(zhì)量不是很理想(細(xì)胞活性<90%、碎片率>5%、結(jié)團(tuán)率均>5%)的情況下,引入的背景信號(hào)會(huì)增加,分析結(jié)果不理想的直接體現(xiàn)包括:cell、non-cell無(wú)法有效區(qū)分和Fraction reads in cells偏低。當(dāng)cell和non-cell無(wú)法有效區(qū)分時(shí),會(huì)使得數(shù)據(jù)出現(xiàn)假陽(yáng)性和假陰性結(jié)果!當(dāng)目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)很大時(shí),多細(xì)胞率會(huì)增加,數(shù)據(jù)分析時(shí),此部分“cell”表現(xiàn)為基因檢測(cè)數(shù)和UMI檢測(cè)數(shù)是正常cell的N倍(N是一個(gè)GEM包裹的細(xì)胞數(shù)),導(dǎo)致所有細(xì)胞的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)(單個(gè)細(xì)胞基因檢測(cè)中位數(shù)、單個(gè)細(xì)胞UMI檢測(cè)中位數(shù))虛高。此部分“cell”雖然可以通過(guò)設(shè)置數(shù)據(jù)分析閾值進(jìn)行過(guò)濾,但是容易會(huì)有此類數(shù)據(jù)的殘留和正常高基因檢測(cè)細(xì)胞的人為去除!搭建多種測(cè)序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺(tái),5000+項(xiàng)目檢驗(yàn),真實(shí)可信賴。廈門single cell RNA單細(xì)胞測(cè)序

烈冰科技成立10余年,為科研學(xué)者提供專注的測(cè)序數(shù)據(jù)分析服務(wù)。上海BD單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)服務(wù)

我國(guó)經(jīng)濟(jì)進(jìn)入“新常態(tài)”,總體上推動(dòng)單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序從粗放式增長(zhǎng)向注重質(zhì)量、效率方向轉(zhuǎn)變。民間資本的進(jìn)入也一定程度刺激我國(guó)單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序市場(chǎng)活力。社會(huì)對(duì)健康類產(chǎn)業(yè)的關(guān)注度越來(lái)越高,迫切需要對(duì)單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序的規(guī)模和結(jié)構(gòu)進(jìn)行核算。從世界范圍來(lái)看,美、歐、日等發(fā)達(dá)地區(qū)的銷售產(chǎn)業(yè)發(fā)展歷史悠久,無(wú)論是銷售產(chǎn)品制造業(yè)還是銷售服務(wù)業(yè),都處于全球優(yōu)先地位。而泰國(guó)、印度等東南亞及南亞地區(qū),銷售產(chǎn)業(yè)雖然起步晚,但是發(fā)展較快,已成為經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展重要組成部分。目前全球銷售產(chǎn)業(yè)發(fā)展主要有美國(guó)波士頓—?jiǎng)虻尼t(yī)藥產(chǎn)業(yè)集聚區(qū)、德國(guó)圖特林根的醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)集聚區(qū)、日本富山縣的醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)集聚區(qū)、印度班加羅爾的仿制藥產(chǎn)業(yè)集聚區(qū)等九大發(fā)展模式。而我國(guó)仍以醫(yī)藥服務(wù)和醫(yī)藥商品為主,整體收入規(guī)模偏小。在項(xiàng)目的加入上可以進(jìn)行分?jǐn)偅恳患壹瘓F(tuán)的資本壓力都會(huì)得到較大的減輕,這種具有組合資本優(yōu)勢(shì)的服務(wù)型項(xiàng)目也是很多資本重點(diǎn)關(guān)注的資本項(xiàng)目。上海BD單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)服務(wù)

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號(hào)奇亞特中心22幢,交通便利,環(huán)境優(yōu)美,是一家服務(wù)型企業(yè)。公司致力于為客戶提供安全、質(zhì)量有保證的良好產(chǎn)品及服務(wù),是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè)。公司擁有專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì),具有單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序等多項(xiàng)業(yè)務(wù)。烈冰生物將以真誠(chéng)的服務(wù)、創(chuàng)新的理念、***的產(chǎn)品,為彼此贏得全新的未來(lái)!

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