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杭州single cell 單細胞多組學測序

來源: 發布時間:2022-07-12

單細胞測序技術(Single Cell Sequencing)從一種新興的研究角度,借助已有的高通量測序手段,幫助研究者在樣本中細胞的異質性、免疫微環境、發育學、免疫學以及其他領域中進行單細胞層面的數據解析,解決了Bulk Population Sequencing所無法解決的問題。這樣一個新的研究領域必然也需要足夠可靠的實驗手段來支撐。BD Rhapsody單細胞分選系統為此提供了完善的硬件設備,保證了從單細胞懸液質量評估到單細胞分選標記過程中每一個實驗步驟的準確質控。NovelBio單細胞實驗團隊借助BD Rhapsody單細胞分選系統,在實驗實施層面對單細胞測序結果的可靠性提供了強有力的保證。繼單細胞懸液制備之后,又在另一道關鍵關卡提供了可靠的支持,幫助研究者在單細胞測序領域收獲更多的成果。豐富的測序和數據分析經驗,烈冰配套全程個性化、定制化地數據分析服務。杭州single cell 單細胞多組學測序

烈冰生信團隊傾情研發的NovelBrain?生信大數據分析平臺,針對龐大的單細胞測序數據,能夠實現細胞類型鑒定的快、精、準:一鍵導入gene list構建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調節寬、高和系數比例來調節美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現分析工具和模板的快速調用和一站式全流程自動化分析,節省工作時間并提升整體工作效率。溫州BD Rhapsody單細胞平臺高通量測序技術是對傳統測序一次突破性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。

Single Cell Sequencing技術,即利用優化后的高通量測序技術(NGS,Next Generation Sequencing)分析每一個單個細胞的序列信息,從而更高分辨率地揭示細胞間的細胞差異以及其在微環境中的功能情況。那么問題來了,如何獲得單個細胞?如果無法獲得單個細胞這一切都是不成立的;如何獲得大批量的單個細胞?單個組織細胞群體通常在百萬級別以上,如果被檢測的測序細胞數量過小精確度不足;如何低成本地獲得大批量單個細胞?單細胞測序成本非常高,尤其是需要測2000~3000個以上的細胞的時候,如果單個細胞的分選成本也很高,技術根本無法普及。所以,正因為這些問題的存在使得高通量測序在單個細胞測序應用中的普及度一直不足,直到幾個單細胞測序突破性技術的誕生。

您的珍貴樣本,可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細胞捕獲系統,首先,該系統的技術原理是基于cyto-seq的微孔技術,因此不會因為樣本細胞體積太大或懸液背景太雜等問題導致捕獲通道的堵塞進而導致樣本的損失;其次,BD RhapsodyTM單細胞捕獲系統無電子元件,便于攜帶,當您的樣本需及時實驗時,我們可以“拎包上門”,快速的完成細胞捕獲部分,不至于珍貴樣本因細胞活性快速下降帶來的損失;在這,BD Rhapsody單細胞捕獲系統對細胞數量包容性較好,細胞懸液上樣量高達575ul,針對樣本中細胞數量較少的組織類型,也能完成整個項目的細胞捕獲工作。自2019年起,烈冰生物BD單細胞測序平臺已助力發表近20篇一區CNS高分文章。

烈冰科技作為國內率先同時擁有10X Genomics和BD Rhapsody雙分選平臺的測序服務商及云計算服務供應商,經過多年實戰,擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經驗,實測BD Rhapsody對能夠高效捕獲粒細胞。針對不同的分選平臺、建庫方法,實戰總結搭建出不同的數據預處理工作流程;烈冰科技NovelBrain?生物大數據平臺能有效支撐生命科學研究、醫療健康等領域對大數據分析的需求。高通量測序實驗平臺,包括NovaSeq 6000、10X Chromium X、BD FACSMelody、PANNORAMIC數字切片掃描儀等,配合一支來自海內外名校、多學科交叉型的高素質綜合團隊,為您的科學研究保駕護航。烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規模發現和復雜疾病研究的測序。烈冰科技單細胞轉錄組測序

強勢發文!烈冰BD單細胞測序平臺助力揭示愈傷組織能再生的機制。杭州single cell 單細胞多組學測序

烈冰生物BD Rhapsody平臺,采用精簡的工作流程助力您的實驗成功: 1.制備單細胞懸液:可使用碧迪醫療單細胞多樣本分析試劑盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶聯抗體( Ab-Oligos)將細胞染色 2.微孔板預充和處理:使用自動移液器進行液體交換 3.單細胞捕獲工作流程: (1)細胞上樣:上樣 575微升細胞懸液;系統未采用微流體通道設計,無需擔心通道堵寨;通過重力輕輕沉淀細胞,可捕獲脆弱細胞,BD Rhapsody微孔板包含大于220,000個分區,可在低雙細胞率下捕獲多達40000個細胞 (2)細胞上樣掃描:估算捕獲的活細胞數量和細胞多態率 (3)磁珠上樣:微孔的正六邊形幾何形狀和尺寸可防止磁珠多重分配在微孔中 (4)磁珠上樣和磁珠洗滌掃描:估算包含活細胞和磁珠的微孔數量;測定細胞存留率,評估是否發生細胞損失 (5)細胞裂解:使用裂解緩沖液,確保細胞完全裂解 (6)磁珠回收:輕松、高效地磁性回收磁珠并采用Scanner掃描磁珠回收情況杭州single cell 單細胞多組學測序

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