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南京scRNA單細胞平臺

來源: 發布時間:2022-07-12

單細胞測序實驗再樣本細胞上機分選簽,需要對細胞數量、細胞活性進準判斷,這對Single Cell分選標記、建庫、下機數據的質量都具有著決定性的作用。如若細胞計數偏高,將會影響建庫的成功率;計數偏低,則會提高雙細胞的比例;而細胞活率過低,就會使測序數據的利用率大打折扣,因此把好單細胞懸液質量這一關尤為重要。而在鋪板過程中,由于不同操作人員手法具有不可避免的差異,不同的液體流速將直接影響單細胞的入孔效果。因此烈冰生物BD Rhapsody單細胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器,其具有Prime Treat、Cell Load、Bead Load、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式,來對應各種不同的操作。通過已經設定的程序來控制液體的流速,大幅度降低人為操作習慣帶來的差異,保證實驗操作的一致性。烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機的全套實驗平臺。南京scRNA單細胞平臺

相對于Smart-Seq技術在細胞數量上的問題,BD平臺普遍提供的細胞數量都在1000-10000不等的測序細胞量,特殊研究需求的項目,可提供上限40000個細胞的捕獲量(單個樣本)。這個量級的測序細胞量已經可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此,對于基于基因表達進行準確細胞分型上,無論是從細胞數量上來說還是表達檢測可靠性來說,都會更實用。此外針對特殊項目研究,如需要捕獲和分析脆弱的細胞,如粒細胞、中性粒細胞、CAR-T細胞、干細胞、移植瘤細胞、骨髓瘤細胞等,烈冰生BD平臺也有更好的捕獲效能,滿足您的實際需求。蘇州BD VDJ單細胞服務機構單個細胞的基因結構和基因表達狀態,并鑒定細胞的類型。

您的珍貴樣本,可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細胞捕獲系統,基于BD平臺從原理到效率到通量的多重包容性,使得BD平臺對實驗過程存在的批次效應產生的可能性更小,可在技術、生物學、實驗中心和用戶之間的樣本檢測獲得一致、可靠的結果,而磁珠的拆分使用和即時存儲,可增加實驗設計的靈活性,配套的BD Scanner可視化工作流程質控,從細胞鋪板前微孔板空板檢測,到細胞上樣、磁珠上樣、磁珠洗滌掃描、細胞裂解、磁珠回收、回收磁珠掃描等全過程,均實現BD Scanner的可視化質控,讓您的每個樣本在實驗端全程無憂。

烈冰生物單細胞測序服務,為您提供可視化質控系統,保證每次實驗的可靠性:BD Rhapsody 掃描儀具有直接成像功能,可在工作流程的不同階段進行質量控制,如細胞捕獲率和細胞多態率(雙細胞率)。成像儀指標可以確認起始細胞樣本的質量,并確認微孔板工作流程中每個步驟的成功完成狀態 ;在細胞裂解前的步驟中評估細胞活性;并對通過測序確定的細胞回收量進行可靠估算。利用這些信息,在進行高成本的下游測序之前,用戶可根據需要改變方向并解決實驗中遇到的問題。這些指標允許用戶對不同工作日間的或者不同研究中心間的工作流程性能進行跟蹤。烈冰BD Rahpsody單細胞測序平臺,助力您的深入科學探究。

多樣本數據合并:Fraction of Reads Kept:合并樣本時,各樣本根據Mapped Barcoded Reads per Cell數量計算出來的數據利用率。如果各樣本間該參數值相差很大,需要進行Downsample處理,以數據量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平,從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數據,深度解讀數據分析結果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統穩定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!烈冰斥巨資引進Novaseq6000,開啟更大通量測序新紀元。深圳BD Rhapsody單細胞服務機構

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對于單細胞測序而言,常常需要先構建細胞圖譜,在此基礎上再開展后續各項分析,并且數據分析時以細胞聚類(cell cluster)為討論對象,而不是像常規Bulk測序一樣以組別為分析對象,因此單細胞測序項目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴格,但是單細胞測序,特別是目的為圖譜研究時,需要通過提高樣本復雜度(增加樣本數),盡可能的構建某一疾病類型、群體細胞圖譜信息。因此,單細胞測序實驗設計時首先需要保證生物學重復,不同樣本來源的樣本建議單獨進行細胞解離和捕獲、建庫、測序,以保證捕獲到足夠的細胞數,單個樣本分別捕獲細胞時,后續分析除了整體分析以外,還可以做單樣本分析,保證分析的完備準確性。南京scRNA單細胞平臺

上海烈冰生物醫藥科技有限公司位于江月路999號奇亞特中心22幢,交通便利,環境優美,是一家服務型企業。烈冰生物是一家有限責任公司(自然)企業,一直“以人為本,服務于社會”的經營理念;“誠守信譽,持續發展”的質量方針。公司擁有專業的技術團隊,具有單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序等多項業務。烈冰生物自成立以來,一直堅持走正規化、專業化路線,得到了廣大客戶及社會各界的普遍認可與大力支持。

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