機體為響應各種應激，其細胞會從一種功能“狀態”轉變為另一種功能“狀態”；當細胞在不同狀態之間轉變時，往往會經歷轉錄重組，導致一些基因被沉默，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態細胞進行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態。擬時序分析，即根據不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況，構建細胞譜系發育，但這里的時間并不是真時間，而是一個虛擬的時間，是指的細胞與細胞之間的轉化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中，也會存在多種不同的細胞形態。因此，不論測定了多少樣本，我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉化和變化進行描述。全線搭建BD Rahpsody單細胞測序平臺。上海BD Rhapsody單細胞服務機構

基因和基因產物并不是單獨運作的，而是參與了相互關聯的復雜通路、網絡和分子系統，這些合在一起實現了細胞、組織和生物體的運作。定義這些系統并確定它們的特征和相互作用，對于了解生物系統如何運作至關重要。”為了推動科學發現，科學家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復雜性的研究工具。對于越來越多的研究人員來說，單細胞RNA測序和單細胞多組學——即在單細胞分辨率下對基因表達及其他基于DNA、RNA或蛋白質的分析物進行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學問題上已證實是行之有效的。陜西BD VDJ單細胞測序服務深度的單細胞測序數據解讀助力醫療健康大時代。

關于BD Rhapsody單細胞平臺的樣本類型和樣本制備 ：在上機前需要注意細胞消化后的細胞團塊，獲得分離良好的細胞懸液、且細胞活力高（＞70%）；此外，了解您所研究細胞的大小范圍也很重要。細胞大小通常與細胞表達的轉錄本數量有關。各種尺寸不同的細胞（一般直徑不大于50μm）均可與我們基因表達解決方案中使用的BD Rhapsody平臺兼容。一般來說，細胞制備方案將根據組織來源和細胞類型而變化。每種組織類型都是獨特的，因此，必須在開始任何單細胞實驗之前優化樣本制備，烈冰多年樣本解離消化經驗，累積10+物種、50+組織的消化protocol，若您的樣本為組織，且尚未成功將組織樣本消化成單細胞懸液，烈冰將盡可能提供技術及實驗上的幫助。

烈冰科技作為國內率先同時擁有10X Genomics和BD Rhapsody雙分選平臺的測序服務商及云計算服務供應商，經過多年實戰，擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經驗，實測BD Rhapsody對能夠高效捕獲粒細胞。針對不同的分選平臺、建庫方法，實戰總結搭建出不同的數據預處理工作流程；烈冰科技NovelBrain?生物大數據平臺能有效支撐生命科學研究、醫療健康等領域對大數據分析的需求。高通量測序實驗平臺，包括NovaSeq 6000、10X Chromium X、BD FACSMelody、PANNORAMIC數字切片掃描儀等，配合一支來自海內外名校、多學科交叉型的高素質綜合團隊，為您的科學研究保駕護航。十二年測序經驗，烈冰生物單細胞多組學領域的佼佼者。

針對單細胞測序數據分析時的reads數、基因表達量及細胞數量判定過程中：以捕獲5000個細胞、100G的測序量為標準，每個細胞的reads數大約在50k左右；每個細胞的基因中位數取決于樣本的細胞類型，例如成熟的B，T，粒細胞數量較多的組織中，由于該類型細胞表達的基因數普遍較少，導致基因中位數下降。而某些疾病組織、或者體外培養的如干細胞等，他們的基因表達數較高，甚至可以超過1W，這就導致該類樣本基因中位數非常高。因此，我們對細胞數量以及基因中位數確認時，需要考察實際組織的細胞組成。搭配BD FACSMelody流式分選儀，全線搭建BD Rahpsody單細胞測序平臺。廣州BD單細胞實驗服務

單細胞測序平臺，烈冰提供高性價比服務方案。上海BD Rhapsody單細胞服務機構

針對單細胞測序的細胞數量判斷環節：主要是對細胞數量、基因表達量、測序質量進行整體描述。過濾標準：由于細胞破碎后游離RNA會釋放到環境或孔中，并且測序中也會存在一些死細胞，導致數據存在background值。因此，我們需要設定一定的標準來過濾掉假細胞或死細胞。以10× Genomics為例，細胞數量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點，當存在多個斜率拐點的時候，結合預期UMI=500時的細胞數量進行過濾。當斜率拐點低于UMI=500的時候，選擇UMI=500作為細胞的判斷的標準；否則，選擇和預期細胞數量接近的拐點作為細胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實的并且在基因數量上可以分析的數據。上海BD Rhapsody單細胞服務機構

上海烈冰生物醫藥科技有限公司位于江月路999號奇亞特中心22幢。公司業務涵蓋單細胞測序，生物大數據云分析平臺，空間轉錄組測序，單細胞多組學測序等，價格合理，品質有保證。公司將不斷增強企業重點競爭力，努力學習行業知識，遵守行業規范，植根于醫藥健康行業的發展。烈冰生物立足于全國市場，依托強大的研發實力，融合前沿的技術理念，飛快響應客戶的變化需求。