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關(guān)于BD Rhapsody單細(xì)胞平臺的樣本類型和樣本制備 :在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊,獲得分離良好的細(xì)胞懸液、且細(xì)胞活力高(>70%);此外,了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān)。各種尺寸不同的細(xì)胞(一般直徑不大于50μm)均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的BD Rhapsody平臺兼容。一般來說,細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來源和細(xì)胞類型而變化。每種組織類型都是獨特的,因此,必須在開始任何單細(xì)胞實驗之前優(yōu)化樣本制備,烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗,累積10+物種、50+組織的消化protocol,若您的樣本為組織,且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液,烈冰將盡可能提供技術(shù)及實驗上的幫助。測序的革新讓科學(xué)研究從個體基因差異逐漸轉(zhuǎn)為個體細(xì)胞的基因差異。成都BD單細(xì)胞測序服務(wù)公司
烈冰生物單細(xì)胞測序服務(wù)體系,不僅提供10X Genomics和BD Rhapsody兩大國際認(rèn)可的單細(xì)胞實驗平臺,在“附加”產(chǎn)品上,我們提供BD FACS Melody流式細(xì)胞儀,滿足您對特殊細(xì)胞類型的富集需求,自主研發(fā)的Panocell單細(xì)胞捕獲芯片,可兼容BD 平臺全套原裝磁珠、試劑和protocol,為您提供完整的單細(xì)胞多組學(xué)解決方案。從細(xì)胞多樣本分析和染色所需的試劑到檢測試劑盒,生物信息分析工具,和在線大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)、精簡方案和專業(yè)團(tuán)隊技術(shù)支持,烈冰生物可為您提供用于單細(xì)胞多組學(xué)甚至到空間轉(zhuǎn)錄組測序的各種工具,助您加速科研探索之旅。云南BD VDJ單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序烈冰單細(xì)胞多組學(xué)測序助您探究細(xì)胞類型特異性和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)特征。
機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激,其細(xì)胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時,往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,導(dǎo)致一些基因被沉默,一些基因被重新“喚醒”,但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時序分析,即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時間的變化情況,構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育,但這里的時間并不是真時間,而是一個虛擬的時間,是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中,也會存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此,不論測定了多少樣本,我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。
現(xiàn)有的單細(xì)胞測序技術(shù)陣營在幾個主要領(lǐng)域存在差別。一個是基于微流控通道的細(xì)胞與Beads的在通道內(nèi)的動態(tài)結(jié)合,通過油相水相不相容的特點將結(jié)合了的細(xì)胞和Beads進(jìn)行分隔,在這個空間,單個細(xì)胞的內(nèi)容物釋放,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引,以便下游識別。BD Rhapsody單細(xì)胞測序平臺采用靜態(tài)微孔技術(shù)(Cyto-Seq具有類似的技術(shù)原理)。通過微孔板的物理分隔,將一個個單個細(xì)胞和帶有標(biāo)簽的磁珠,一對一的“框”在微反應(yīng)的物理平臺中。這樣,每一個細(xì)胞都會結(jié)合一個磁珠,那么在每一個磁珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,這個抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫。烈冰BD Rahpsody單細(xì)胞測序平臺,助力您的深入科學(xué)探究。
您的珍貴樣本,可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng),基于BD平臺從原理到效率到通量的多重包容性,使得BD平臺對實驗過程存在的批次效應(yīng)產(chǎn)生的可能性更小,可在技術(shù)、生物學(xué)、實驗中心和用戶之間的樣本檢測獲得一致、可靠的結(jié)果,而磁珠的拆分使用和即時存儲,可增加實驗設(shè)計的靈活性,配套的BD Scanner可視化工作流程質(zhì)控,從細(xì)胞鋪板前微孔板空板檢測,到細(xì)胞上樣、磁珠上樣、磁珠洗滌掃描、細(xì)胞裂解、磁珠回收、回收磁珠掃描等全過程,均實現(xiàn)BD Scanner的可視化質(zhì)控,讓您的每個樣本在實驗端全程無憂。烈冰專注單細(xì)胞多組學(xué)測序領(lǐng)域。西安scRNA單細(xì)胞測序服務(wù)公司
單細(xì)胞測序因其強(qiáng)大的探究疾病--細(xì)胞--基因的關(guān)系,一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”。成都BD單細(xì)胞測序服務(wù)公司
單細(xì)胞測序結(jié)果動輒上百G數(shù)據(jù)量,龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求,首先針對下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié):單細(xì)胞測序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列,不可避免的會出現(xiàn)低質(zhì)量的測序結(jié)果,存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質(zhì)量評估就會變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過測序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來表征,即堿基測序結(jié)果的錯誤率在1% / 0.1%以下的比例。理想的測序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性,為后續(xù)細(xì)胞類型鑒定和功能分析打下堅實基礎(chǔ)。成都BD單細(xì)胞測序服務(wù)公司
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