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廈門烈冰生物空間轉錄組測序價格

來源: 發(fā)布時間:2022-08-19

為同時獲得空間表達和組織學背景信息,該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進行組織學染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進行表達定量。由于FFPE樣本通常存在RNA高度降解的問題,針對FFPE樣本的Visium空間基因表達解決方案無法像新鮮凍存組織樣本一樣利用完整mRNA具有的poly(dA)序列進行mRNA捕獲。該方案采用針對編碼基因的成對RNA模板連接探針(RTL)與mRNA雜交。左側探針(LHS)具有部分Read 2序列,右側探針(RHS)具有合成的poly(A)序列。左右探針與mRNA雜交后彼此連接,而mRNA被RNase降解。組織透化后,被連接的成對探針與芯片上包含空間Barcode、UMI和poly(dT)序列的引物序列捕獲,并且空間Barcode和UMI序列被延伸到成對探針序列上。攜帶空間Barcode的探針序列用于進行測序文庫構建和測序。測序序列上的空間Barcode用于將測序序列定位到組織切片圖像上,UMI用于基因表達定量。空間轉錄組可展示組織切片中不同區(qū)域的基因表達情況,揭示精細病理區(qū)域的信號通路。廈門烈冰生物空間轉錄組測序價格

烈冰生物真正實現空間轉錄組測序的全程把控,做到從實驗設計、空間信息標記、建庫測序、定制化分析的全流程一站式服務,助力高分文章發(fā)表;專業(yè)實驗團隊保證樣本的高度一致性;專業(yè)的生物學團隊提供個性化的產品應用場景解讀、保持對生物學意義的關注;強大的生信分析團隊一對一地進行詳實科學的實驗方案設計并提供多次售后分析;可接受樣品類別為冰凍組織:新鮮樣本經液氮預冷的異戊烷速凍,-80℃保存OCT包埋組織:新鮮組織異戊烷速凍后進行OCT包埋,或新鮮組織直接OCT包埋后-80℃速凍,注意標明樣本方向,樣本于-80℃保存樣本處理和運輸過程需要在低溫環(huán)境廈門烈冰生物空間轉錄組平臺烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現和復雜疾病研究的測序。

烈冰配置了LEICA CM1950冷凍切片機,搭配切片經驗豐富的實驗團隊,可以提供一致性更高、實驗操作更精細的冷凍切片準備方案,保持密切高效的溝通,設計更適合的實驗方案,確保每一個實驗細節(jié)有效進行;烈冰升級配置尼康相差顯微鏡和CCD成像系統,更高清分辨率解析組織切片原始圖像信息,10X,20X,40X,60X更多物鏡選擇,為不同大小的樣本提供更清晰的圖像,更精細的圖像信息采集、拼接策略,為樣本內微小區(qū)域的組織學提供更清晰的影像;

解決空間轉錄組測序數據分析中由于超大數據量、超高的質控要求以及繁多分析需求而引起的分析困難,做到快速可定制化完成空間轉錄組分析;擁有行業(yè)先進的3DHISTECH公司的PANNORAMIC系列的數字切片掃描儀,可以同時實現明場與熒光場下冷凍切片的快速掃描成像;Z-Stack多層聚焦掃描及Extended Focus 景深擴展多層融合掃描模式,進一步提升分辨率和清晰度,保證切片高分辨的數字圖像信息精細采集;能夠滿足針對分析結果中感興趣基因的RNA-FISH驗證以及組織切片的免疫組化的高清成像,獲取表達與定位信息。全線搭建10x Genomics空間轉錄組測序平臺。

空間轉錄組測序是在組織原位檢測全轉錄組基因表達的?種技術,可以展?組織切?中不同區(qū)域的基因表達情況,同時能夠得到?的基因在組織內部的空間位置信息。與傳統的全基因轉錄組或單細胞轉錄組測序相?,空間轉錄組測序漿病理影像(H&E染?)與測序數據映射在?起,進?可以分析組織切內部空間結構的細胞異質性。常規(guī)單細胞轉錄組測序技術丟失了細胞在原組織中至關重要的空間位置信息,而單細胞空間轉錄組技術在進行單細胞轉錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息。空間轉錄組技術能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環(huán)境,將成為發(fā)育生物學、神經生物學、免疫生物學等領域的研究利器。豐富的測序和數據分析經驗,烈冰配套全程個性化、定制化地數據分析服務。廈門烈冰生物空間轉錄組平臺

烈冰智造空間轉錄組細胞捕獲,媲美國際主流的單細胞平臺。廈門烈冰生物空間轉錄組測序價格

單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉錄組測序分析,可精確地描述每一個細胞的狀態(tài),在異質性發(fā)育過程中具有不可忽視的應用價值。然而,單細胞測序無法給出固態(tài)異質化組織中細胞空間排布信息,對于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性。空間轉錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序,可以精確指示點陣內的全部基因表達情況。空間轉錄組測序的加入,無疑讓單細胞測序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質性。廈門烈冰生物空間轉錄組測序價格

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司專注技術創(chuàng)新和產品研發(fā),發(fā)展規(guī)模團隊不斷壯大。公司目前擁有專業(yè)的技術員工,為員工提供廣闊的發(fā)展平臺與成長空間,為客戶提供高質的產品服務,深受員工與客戶好評。公司業(yè)務范圍主要包括:單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序等。公司奉行顧客至上、質量為本的經營宗旨,深受客戶好評。一直以來公司堅持以客戶為中心、單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序市場為導向,重信譽,保質量,想客戶之所想,急用戶之所急,全力以赴滿足客戶的一切需要。

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