烈冰科技自主研發的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數據,深入解讀數據分析結果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統穩定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!此外,烈冰生信團隊根據豐富的實戰經驗為用戶量身打造了一款單細胞測序結果解讀的神兵利器——單細胞瀏覽器(SingleCellBrowser),不僅可以將海量復雜的結果文件可視化,還可以實現分析結果的三維立體化的展示呈現。專業的生信代碼交給專業的烈冰,專業的生物學意義交給專業的您!自主研發PanoCell單細胞實驗測序平臺。杭州烈冰科技空間轉錄組測序價格
10x Genomics空間轉錄組測序技術通過將組織切片的高通量mRNA分析和形態學背景整合,使基因表達譜可以被定位回它們的原始空間位置。傳統的空間轉錄組測序技術局限于冰凍組織切片。10x Genomics推出全新的針對FFPE樣本的Visium空間基因表達解決方案,該技術打破從FFPE組織樣本中獲取空間全部轉錄組基因表達信息的壁壘,能夠從FFPE樣本中獲取高靈敏度、高特異性的相關基因的表達信息,在形態學背景下實現真正的探索發現,進一步擴展空間生物學的可能性。合肥BD空間轉錄組技術支持空間轉錄組測序是高通量測序下的又一重大技術突破。
空間轉錄組學(Spatial Transcriptomics)是指在組織切片上完成,保留樣本空間信息的組學研究。空間轉錄組可展示組織切片中不同區域的基因表達情況,揭示精細病理區域中激發的信號通路,完成分子特征驅動病理特征的機制解析。空間轉錄組學完成了病理數字化結合病理影像化的技術革新,對于診斷標志物、耐藥位點以及靶向藥物的研發,免疫治等新興領域都具有重要作用。當組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉錄組芯片上時,通過透化處理,細胞內的mRNA釋放出來,從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲。被捕獲的mRNA開始逆轉錄,得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列。通過上機測序,可以將每個mRNA轉錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置。
已發表的關于空間轉錄組技術有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。這些方法或是在細胞數量上限制較大,或是存在有效測序深度不足等問題。10xGenomics公司提供的Visium空間基因表達解決方案是目前一個高通量空間轉錄組的商業化解決方案。該解決方案可以輕松地將空間轉錄組學技術應用到組織切片和染色的標準方法中,從而研究空間分辨率下整個轉錄組mRNA的表達情況,同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息。烈冰生物全轉錄組測序通過雙文庫構建,實現多種RNA的一網打盡。
空間組學可以應用的方向:1.可以鑒定到疾病的空間位置異質性:對于阿爾茨海默癥的研宄可以探索到小神經質細胞趨向于阿爾茨海默神經班。 2.建立空間轉錄組圖譜構建個人空間轉錄組圖譜將極大提升科研人員對生物體組織間的細胞差異。3、描述胚胎發育及空間藍區胚胎發育的動態過程是科研人員一直為之著迷的,空間組學發展可以清晣的描繪胚胎發育的藍圖。除了皮膚、胰腺和骨頭組織外,其余樣本類型均可開展10xGenomics空間轉錄組研究。10xGenomics公司已經測試完畢的組織類型有:人:心勝、腎勝、卵巢、乳房、淋巴結、大腦、大腸、肺、脾臟小鼠:大腦、眼睛、心勝、腎勝、大腸、肝臟、肺、卵巢,四頭肌、小腸、脾勝、胃、翠丸、甲狀腺、舌頭大鼠:大腦、腎臟、心臟烈冰智造空間轉錄組細胞捕獲,媲美國際主流的單細胞平臺。武漢上海烈冰生物空間轉錄組測序
十二年測序經驗,烈冰生物空間轉錄組領域的佼佼者。杭州烈冰科技空間轉錄組測序價格
空間轉錄組技術流程:1、組織優化由于不同物種、組織來源的樣本所需的比較好透化時間不盡相同,在正式開展空間轉錄組測序實驗前,需要利用組織優化kit進行條件的摸索。組織優化芯片上包含8個捕獲區域,每個區域均覆蓋了熒光標記探針,可捕獲mRNA形成帶有熒光標簽的cDNA,隨即可通過熒光成像結果判定比較好透化時間及組織優化條件。2、空間轉錄組測序確定組織優化條件后,即可進行切片、H&E染色及成像、空間轉錄組文庫構建及測序分析流程。杭州烈冰科技空間轉錄組測序價格
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